陆地棉×毛棉种间高密度遗传图谱构建
发布时间：2021-05-18 11:04
棉花是重要的天然纤维作物,同时也是重要的植物蛋白和油料来源。随着全球对纺织品需求的增加,提高纤维产量和纤维品质一直是棉花育种者关注的焦点。陆地棉具备高产、强适应性的特点,在全世界各地都有种植,但陆地棉遗传基础比较狭窄,限制了棉花产量、品质改良的进展。毛棉具有耐旱、抗盐碱等陆地棉不具有的特性,陆地棉与毛棉间的杂交可产生可育后代。构建陆地棉和野生棉种毛棉种间高密度遗传图谱,对毛棉优良性状QTL有利等位基因的挖掘和陆地棉分子标记辅助选择育种（marker assisted selection,MAS）具有重要意义。本研究对实验室前期构建的陆地棉与毛棉BC1群体遗传连锁图谱进行标记加密,并比较分析了棉花基因组染色体结构变异。主要结果如下:1.引物多态性筛选用21426对SSR引物对两亲本陆地棉CCRI 35和P0601211进行多态性筛选,最终共获得962对多态性SSR引物,多态性比例为4.90%。2.遗传连锁图谱加密与偏分离检测用筛选出来的多态性引物对92个BC1单株进行群体标记基因型检测,加密后的遗传图谱包含1915个标记位点,图谱总长度为406...
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 文献综述
1.1 棉属的起源及分类研究
1.1.1 棉属的起源
1.1.2 棉属的分类
1.1.3 四倍体棉种的分布与分化
1.2 遗传标记的发展
1.2.1 分子标记的发展简史
1.2.2 DNA分子标记在作物育种的应用
1.3 棉花遗传图谱的构建
1.3.1 作图群体
1.3.2 棉花种间遗传图谱的研究进展
1.3.3 棉花种内遗传图谱的研究进展
1.4 棉花物理图谱的研究进展
1.5 棉花染色体结构变异
1.6 毛棉的特征和研究
第2章 引言
2.1 研究目的与意义
2.2 技术路线
第3章 实验材料与方法
3.1 实验材料
3.2 棉花基因组DNA的提取
3.2.1 实验主要仪器
3.2.2 主要试剂配制
3.2.3 DNA的提取步骤
3.3 引物的来源以及PCR扩增反应
3.3.1 引物的来源
3.3.2 PCR扩增
3.3.3 PCR反应程序
3.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳
3.4.1 试剂配制
3.4.2 电泳
3.5 陆地棉与毛棉种间遗传图谱的构建
3.5.1 SSR引物多态性筛选及作图群体基因型检测
3.5.2 图谱构建
3.6 偏分离检测
3.7 共线性分析
3.7.1 陆、海遗传图谱与陆、毛遗传图谱线性关系
3.7.2 遗传图谱与陆地棉、雷蒙德氏棉和亚洲棉基因组物理图谱共线性分析
第4章 结果与分析
4.1 亲本引物多态性筛选及分析
4.2 BC_1 群体基因型检测
4.3 遗传图谱标记加密
4.4 标记位点偏分离检测
4.5 不同遗传图谱之间的共线性分析
4.6 遗传图谱与物理图谱间共线性分析
第5章 讨论
5.1 亲本间标记多态性分析
5.2 遗传图谱的加密
5.3 标记偏分离现象
5.4 不同遗传图谱间的共线性关系
5.5 遗传图谱与不同物理图谱间的线性分析
第6章 结论
6.1 陆地棉和毛棉BC1 群体种间遗传图谱加密
6.2 遗传图谱间的线性关系
6.3 遗传图谱与物理图谱间的线性关系
参考文献
已发表论文
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]棉花种质资源收集鉴定与创新利用[J]. 杜雄明,刘方,王坤波,贾银华,周忠丽,何守朴,龚文芳,潘兆娥,王立如,耿晓丽,庞保印. 棉花学报. 2017(S1)
[2]陆地棉主要产量相关性状的SSR标记关联分析[J]. 王娟,董承光,刘丽,孔宪辉,王旭文,余渝. 植物遗传资源学报. 2017(04)
[3]近5年毛棉考察总结[J]. 王坤波,刘方,周忠丽,王星星,王春英,黎绍惠. 中国棉花. 2016(06)
[4]偏分离群体连锁图矫正和QTL定位软件包DistortedMap的研制[J]. 谢尚潜,耿青春,章元明. 南京农业大学学报. 2014(05)
[5]棉花资源收集、保存、评价与利用现状及未来[J]. 杜雄明,孙君灵,周忠丽,贾银华,潘兆娥,何守朴,庞保印,王立如. 植物遗传资源学报. 2012(02)
[6]夏威夷毛棉考察简报[J]. 王坤波,文学,黎绍惠,朱芸. 中国棉花. 2011(12)
[7]中国棉花生产与政策60年[J]. 马淑萍,王戈,龙熹. 中国棉花. 2009(09)
[8]中国棉花生产中存在的主要问题及建议[J]. 王延琴,杨伟华,许红霞,周大云,冯新爱,匡猛. 中国农学通报. 2009(14)
[9]利用高代回交和分子标记辅助选择构建棉花染色体片段代换系[J]. 杨泽茂,李骏智,李爱国,张保才,刘广平,李俊文,石玉真,刘爱英,蒋建雄,王涛,袁有禄. 分子植物育种. 2009(02)
[10]作物QTL定位常用作图群体[J]. 蒋洪蔚,刘春燕,高运来,李灿东,张闻博,胡国华,陈庆山. 生物技术通报. 2008(S1)
博士论文
[1]陆地棉种内杂交F2:3群体的耐盐性、纤维品质和产量性状的QTL定位[D]. LATYR DIOUF.中国农业科学院 2018
[2]棉属细胞质基因组进化及陆地植物基因水平转移分析[D]. 陈志文.中国农业大学 2017
[3]陆地棉种内高密度遗传图谱构建及重要农艺性状QTL定位[D]. 贾晓昀.西北农林科技大学 2017
[4]陆地棉与海岛棉、毛棉、达尔文氏棉种间遗传图谱加密及线性关系比较[D]. 刘方.西南大学 2016
[5]不结球白菜抗芜菁花叶病毒基因分子标记与遗传定位[D]. 王新华.上海交通大学 2010
硕士论文
[1]陆地棉与达尔文氏棉种间BC1群体遗传图谱构建[D]. 刘瑞.西南大学 2017
[2]陆地棉×黄褐棉种间BC1群体遗传连锁图谱的构建[D]. 李曼.西南大学 2017
[3]陆海种间图谱加密与染色体结构变异分析[D]. 王文文.西南大学 2017
[4]海岛棉抗枯萎病性的遗传分析及遗传连锁图谱加密[D]. 陈磊.新疆农业大学 2012
[5]陆地棉和毛棉种间SSR遗传图谱构建及其茸毛和蜜腺基因的染色体定位[D]. 侯美英.南京农业大学 2012
[6]加工番茄抗黄萎病基因的QTL定位及品种（系）遗传多样性分析[D]. 张超.石河子大学 2011
[7]四倍体棉种起源与演化的FISH研究[D]. 刘三宏.中国农业科学院 2004
本文编号：3193680
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 文献综述
1.1 棉属的起源及分类研究
1.1.1 棉属的起源
1.1.2 棉属的分类
1.1.3 四倍体棉种的分布与分化
1.2 遗传标记的发展
1.2.1 分子标记的发展简史
1.2.2 DNA分子标记在作物育种的应用
1.3 棉花遗传图谱的构建
1.3.1 作图群体
1.3.2 棉花种间遗传图谱的研究进展
1.3.3 棉花种内遗传图谱的研究进展
1.4 棉花物理图谱的研究进展
1.5 棉花染色体结构变异
1.6 毛棉的特征和研究
第2章 引言
2.1 研究目的与意义
2.2 技术路线
第3章 实验材料与方法
3.1 实验材料
3.2 棉花基因组DNA的提取
3.2.1 实验主要仪器
3.2.2 主要试剂配制
3.2.3 DNA的提取步骤
3.3 引物的来源以及PCR扩增反应
3.3.1 引物的来源
3.3.2 PCR扩增
3.3.3 PCR反应程序
3.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳
3.4.1 试剂配制
3.4.2 电泳
3.5 陆地棉与毛棉种间遗传图谱的构建
3.5.1 SSR引物多态性筛选及作图群体基因型检测
3.5.2 图谱构建
3.6 偏分离检测
3.7 共线性分析
3.7.1 陆、海遗传图谱与陆、毛遗传图谱线性关系
3.7.2 遗传图谱与陆地棉、雷蒙德氏棉和亚洲棉基因组物理图谱共线性分析
第4章 结果与分析
4.1 亲本引物多态性筛选及分析
4.2 BC_1 群体基因型检测
4.3 遗传图谱标记加密
4.4 标记位点偏分离检测
4.5 不同遗传图谱之间的共线性分析
4.6 遗传图谱与物理图谱间共线性分析
第5章 讨论
5.1 亲本间标记多态性分析
5.2 遗传图谱的加密
5.3 标记偏分离现象
5.4 不同遗传图谱间的共线性关系
5.5 遗传图谱与不同物理图谱间的线性分析
第6章 结论
6.1 陆地棉和毛棉BC1 群体种间遗传图谱加密
6.2 遗传图谱间的线性关系
6.3 遗传图谱与物理图谱间的线性关系
参考文献
已发表论文
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]棉花种质资源收集鉴定与创新利用[J]. 杜雄明,刘方,王坤波,贾银华,周忠丽,何守朴,龚文芳,潘兆娥,王立如,耿晓丽,庞保印. 棉花学报. 2017(S1)
[2]陆地棉主要产量相关性状的SSR标记关联分析[J]. 王娟,董承光,刘丽,孔宪辉,王旭文,余渝. 植物遗传资源学报. 2017(04)
[3]近5年毛棉考察总结[J]. 王坤波,刘方,周忠丽,王星星,王春英,黎绍惠. 中国棉花. 2016(06)
[4]偏分离群体连锁图矫正和QTL定位软件包DistortedMap的研制[J]. 谢尚潜,耿青春,章元明. 南京农业大学学报. 2014(05)
[5]棉花资源收集、保存、评价与利用现状及未来[J]. 杜雄明,孙君灵,周忠丽,贾银华,潘兆娥,何守朴,庞保印,王立如. 植物遗传资源学报. 2012(02)
[6]夏威夷毛棉考察简报[J]. 王坤波,文学,黎绍惠,朱芸. 中国棉花. 2011(12)
[7]中国棉花生产与政策60年[J]. 马淑萍,王戈,龙熹. 中国棉花. 2009(09)
[8]中国棉花生产中存在的主要问题及建议[J]. 王延琴,杨伟华,许红霞,周大云,冯新爱,匡猛. 中国农学通报. 2009(14)
[9]利用高代回交和分子标记辅助选择构建棉花染色体片段代换系[J]. 杨泽茂,李骏智,李爱国,张保才,刘广平,李俊文,石玉真,刘爱英,蒋建雄,王涛,袁有禄. 分子植物育种. 2009(02)
[10]作物QTL定位常用作图群体[J]. 蒋洪蔚,刘春燕,高运来,李灿东,张闻博,胡国华,陈庆山. 生物技术通报. 2008(S1)
博士论文
[1]陆地棉种内杂交F2:3群体的耐盐性、纤维品质和产量性状的QTL定位[D]. LATYR DIOUF.中国农业科学院 2018
[2]棉属细胞质基因组进化及陆地植物基因水平转移分析[D]. 陈志文.中国农业大学 2017
[3]陆地棉种内高密度遗传图谱构建及重要农艺性状QTL定位[D]. 贾晓昀.西北农林科技大学 2017
[4]陆地棉与海岛棉、毛棉、达尔文氏棉种间遗传图谱加密及线性关系比较[D]. 刘方.西南大学 2016
[5]不结球白菜抗芜菁花叶病毒基因分子标记与遗传定位[D]. 王新华.上海交通大学 2010
硕士论文
[1]陆地棉与达尔文氏棉种间BC1群体遗传图谱构建[D]. 刘瑞.西南大学 2017
[2]陆地棉×黄褐棉种间BC1群体遗传连锁图谱的构建[D]. 李曼.西南大学 2017
[3]陆海种间图谱加密与染色体结构变异分析[D]. 王文文.西南大学 2017
[4]海岛棉抗枯萎病性的遗传分析及遗传连锁图谱加密[D]. 陈磊.新疆农业大学 2012
[5]陆地棉和毛棉种间SSR遗传图谱构建及其茸毛和蜜腺基因的染色体定位[D]. 侯美英.南京农业大学 2012
[6]加工番茄抗黄萎病基因的QTL定位及品种（系）遗传多样性分析[D]. 张超.石河子大学 2011
[7]四倍体棉种起源与演化的FISH研究[D]. 刘三宏.中国农业科学院 2004
本文编号：3193680
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