转录因子应答非生物胁迫Meta分析及玉米耐旱候选基因挖掘
发布时间：2021-06-11 17:08
植物的一生中通常会遭受各种逆境胁迫,对植物的生长发育造成非常不利的影响,严重的甚至会引起死亡。植物的逆境胁迫主要包括生物胁迫和非生物胁迫两大类。世界上主要农作物每年有近50%的产量损失都与非生物胁迫有关。转录因子在调控植物适应非生物胁迫过程中意义重大。本研究通过整合分析方法,对过表达WRKY、MYB、CBF转基因植物及其野生型在干旱、高盐和低温胁迫下的表现进行定量比较分析;同时,利用SSR分子标记对62份玉米导入系材料进行基因型分析和苗期耐旱性鉴定,试图筛选出与玉米耐旱相关的单片段导入系材料。本研究的目的是统计学和试验科学研究方法共同探讨非生物胁迫下植物生长调控机制,以期为培育耐旱、耐盐、耐低温植物提供理论依据。主要结果如下:1.不同水分胁迫环境条件下WRKY过表达转基因植物与其野生型表现不同。在非水分胁迫下,转基因植物与其野生型在相对含水量上表现差异显著;在水分胁迫下,转基因植物的存活率显著高于其野生型,在16个响应指标中有7个指标变化率超过20%,其中存活率提高了89.8%。2.不同盐胁迫环境条件下MYB过表达转基因植物与其野生型表现不同。在非盐胁迫下,仅在脯氨酸含量上转基因植物和...
【文章来源】：河北农业大学河北省
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
整合分析基本过程
2.1 试验材料2.1.1 WRKY 转录因子响应干旱胁迫数据搜集从 PubMed、Web of science、SpringerLink 3 个英文数据库中以“植物（Plant）或作物（Crop）”“过表达（Overexpression）”；“干旱（Drought）或非生物胁迫（Abiotic stress）或水分亏缺（Watdeficit）”；WRKY 转录因子（WRKY transcription factors）为关键词进行检索。对检索到的 435 篇文献按照以下筛选标准进行筛选：（1）发表 2008-2018 年间的文章；（2）至少应包括一个表型评价指标（如株高，发芽率，脯氨酸含量，丙二醛含量等）；（3）剔除从不同数据库中检索到的相同研究；（4）剔除综述、会议报告等非研究型文章；（5）每一个研究应包含对照组和处理组；（6每一个处理应至少包含 3 个重复；（7）每一篇研究均是以英文的形式发表的。获得了符合上述标准的文献 47 篇，包含 158 个独立研究（附表 S1）。其中，涉及 19 个物种，其中单子叶植物 6 种双子叶植物 13 种。禾本科植物 5 种，豆科植物 3 种，茄科植物 2 种，菊科植物 2 种，其它植物种。纳入国内外干旱研究地理位置分布如图 2 所示。从图 2 中可以看出，本次纳入的干旱研究地点在世界地图上主要分布在亚欧大陆，在中国地图上主要集中在华北平原，少数分布在长江中下游平原。
转录因子应答非生物胁迫 Meta 分析及玉米耐旱候选基因挖掘.1.2 MYB 转录因子响应高盐胁迫数据搜集从 PubMed、Web of science、中国知网（CNKI）、万方（WanFang）4 个数据库中，以“Plant）”、“MYB 转录因子（MYB Transcription factors）”、“过表达（Overexpression）”、“盐Salt stress）”为关键词进行文献的检索。对所检索到的 632 篇文献再按照以下标准进行筛选表时间介于 2008-2018 年间；（2）剔除从不同数据库中检索到的相同研究；（3）研究应至脯氨酸含量、钠离子含量、钾离子含量、根长等 16 个表型评价指标之一；（4）每一个处少包含 3 个重复；（5）每一个研究应包含对照组和处理组；（6）剔除综述、会议报告等非文章。符合上述标准的文献有 70 篇，包含了 263 个独立研究（附表 S2）。其中，英文文，中文文献 27 篇；涉及 28 个物种，16 个科属；研究数量居多的科属包括禾本科（80）、（36）菊科（24）茄科（24）、豆科（19）等。纳入国内外高盐研究地理分布如图 3 所示 3 中可以看出，本次纳入的高盐研究地点在世界地图上主要分布在亚欧大陆，在中国地图集中在华北平原，少数分布在长江中下游平原和内陆地区。
【参考文献】：
期刊论文
[1]PtrMYB106通过抑制内源脱落酸调节植物高盐胁迫适应能力[J]. 汪琼,徐静,彭杰娣,唐晓雯,汪晶,刘驰,涂成杰,尹恒,方庆. 分子植物育种. 2019(23)
[2]植物盐胁迫响应的研究进展[J]. 胡涛,张鸽香,郑福超,曹钰. 分子植物育种. 2018(09)
[3]施用有机肥对中国农田土壤微生物量影响的整合分析[J]. 任凤玲,张旭博,孙楠,徐明岗,柳开楼. 中国农业科学. 2018(01)
[4]AtMYB73基因正调控拟南芥对盐胁迫的响应[J]. 庞茜,赵亚婷,樊锦涛,邢红侠,张靖,邢继红,董金皋. 河北农业大学学报. 2017(05)
[5]免耕及深松耕对黄土高原地区春玉米和冬小麦产量及水分利用效率影响的整合分析[J]. 魏欢欢,王仕稳,杨文稼,孙海妮,殷俐娜,邓西平. 中国农业科学. 2017(03)
[6]MdMYB73的分子克隆及其在苹果愈伤组织和拟南芥幼苗中的盐抗性功能鉴定[J]. 张全艳,刘晓,于建强,胡大刚,郝玉金. 园艺学报. 2016(11)
[7]玉米回交导入系BC1F2代吐丝期叶片光合参数与耐旱性的关系[J]. 赵晓亮,孙继颖,高聚林,苏治军,王志刚,于晓芳,胡树平. 内蒙古农业科技. 2015(05)
[8]植物盐胁迫抗性的分子机制研究进展[J]. 蔡晓锋,胡体旭,叶杰,张余洋,李汉霞,叶志彪. 华中农业大学学报. 2015(03)
[9]新疆干旱条件下常用玉米自交系耐旱性鉴定研究[J]. 韩登旭,杨杰,邵红雨,梁晓玲,阿布来提·阿布拉,李铭东,程慧金. 玉米科学. 2012(04)
[10]小麦逆境胁迫相关基因Ta14S的克隆及表达分析[J]. 任江萍,刘海伦,王新国,牛洪斌,李永春,王翔,陈新,尹钧. 中国农业科学. 2012(06)
博士论文
[1]番茄转录因子SlbZIP38响应干旱和高盐胁迫的功能研究[D]. 潘阳露.西南大学 2018
[2]水、旱稻种子萌发和叶片光合荧光的差异抗旱机理研究[D]. 滕开琼.河南农业大学 2014
[3]小麦MYB转录因子的功能研究[D]. 张立超.中国农业科学院 2013
[4]渗透胁迫下水稻体内多胺代谢及其生理功能研究[D]. 周小梅.湖南农业大学 2008
硕士论文
[1]玉米抗旱相关基因ZmMYB48你的功能分析[D]. 王彦.安徽农业大学 2018
[2]耐盐碱基因OsMYB56转化水稻的初步研究[D]. 王晓雪.吉林农业大学 2016
[3]转CBF3基因茄子后代植株抗寒性与分子检测研究[D]. 蔡霞.西南大学 2015
[4]玉米蔗糖代谢关键基因灌浆期动态表达及其调控的初步研究[D]. 任晓东.四川农业大学 2014
[5]玉米细胞壁转化酶基因Incw2在玉米籽粒中的过量表达[D]. 李淑君.四川农业大学 2011
[6]玉米酸转化酶基因（ivr2）的耐旱性关联分析及自交系耐旱性分析[D]. 李亮.新疆农业大学 2010
[7]我国常用玉米自交系耐旱性鉴定、评价与改良研究[D]. 李争光.石河子大学 2010
本文编号：3224942
【文章来源】：河北农业大学河北省
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
整合分析基本过程
2.1 试验材料2.1.1 WRKY 转录因子响应干旱胁迫数据搜集从 PubMed、Web of science、SpringerLink 3 个英文数据库中以“植物（Plant）或作物（Crop）”“过表达（Overexpression）”；“干旱（Drought）或非生物胁迫（Abiotic stress）或水分亏缺（Watdeficit）”；WRKY 转录因子（WRKY transcription factors）为关键词进行检索。对检索到的 435 篇文献按照以下筛选标准进行筛选：（1）发表 2008-2018 年间的文章；（2）至少应包括一个表型评价指标（如株高，发芽率，脯氨酸含量，丙二醛含量等）；（3）剔除从不同数据库中检索到的相同研究；（4）剔除综述、会议报告等非研究型文章；（5）每一个研究应包含对照组和处理组；（6每一个处理应至少包含 3 个重复；（7）每一篇研究均是以英文的形式发表的。获得了符合上述标准的文献 47 篇，包含 158 个独立研究（附表 S1）。其中，涉及 19 个物种，其中单子叶植物 6 种双子叶植物 13 种。禾本科植物 5 种，豆科植物 3 种，茄科植物 2 种，菊科植物 2 种，其它植物种。纳入国内外干旱研究地理位置分布如图 2 所示。从图 2 中可以看出，本次纳入的干旱研究地点在世界地图上主要分布在亚欧大陆，在中国地图上主要集中在华北平原，少数分布在长江中下游平原。
转录因子应答非生物胁迫 Meta 分析及玉米耐旱候选基因挖掘.1.2 MYB 转录因子响应高盐胁迫数据搜集从 PubMed、Web of science、中国知网（CNKI）、万方（WanFang）4 个数据库中，以“Plant）”、“MYB 转录因子（MYB Transcription factors）”、“过表达（Overexpression）”、“盐Salt stress）”为关键词进行文献的检索。对所检索到的 632 篇文献再按照以下标准进行筛选表时间介于 2008-2018 年间；（2）剔除从不同数据库中检索到的相同研究；（3）研究应至脯氨酸含量、钠离子含量、钾离子含量、根长等 16 个表型评价指标之一；（4）每一个处少包含 3 个重复；（5）每一个研究应包含对照组和处理组；（6）剔除综述、会议报告等非文章。符合上述标准的文献有 70 篇，包含了 263 个独立研究（附表 S2）。其中，英文文，中文文献 27 篇；涉及 28 个物种，16 个科属；研究数量居多的科属包括禾本科（80）、（36）菊科（24）茄科（24）、豆科（19）等。纳入国内外高盐研究地理分布如图 3 所示 3 中可以看出，本次纳入的高盐研究地点在世界地图上主要分布在亚欧大陆，在中国地图集中在华北平原，少数分布在长江中下游平原和内陆地区。
【参考文献】：
期刊论文
[1]PtrMYB106通过抑制内源脱落酸调节植物高盐胁迫适应能力[J]. 汪琼,徐静,彭杰娣,唐晓雯,汪晶,刘驰,涂成杰,尹恒,方庆. 分子植物育种. 2019(23)
[2]植物盐胁迫响应的研究进展[J]. 胡涛,张鸽香,郑福超,曹钰. 分子植物育种. 2018(09)
[3]施用有机肥对中国农田土壤微生物量影响的整合分析[J]. 任凤玲,张旭博,孙楠,徐明岗,柳开楼. 中国农业科学. 2018(01)
[4]AtMYB73基因正调控拟南芥对盐胁迫的响应[J]. 庞茜,赵亚婷,樊锦涛,邢红侠,张靖,邢继红,董金皋. 河北农业大学学报. 2017(05)
[5]免耕及深松耕对黄土高原地区春玉米和冬小麦产量及水分利用效率影响的整合分析[J]. 魏欢欢,王仕稳,杨文稼,孙海妮,殷俐娜,邓西平. 中国农业科学. 2017(03)
[6]MdMYB73的分子克隆及其在苹果愈伤组织和拟南芥幼苗中的盐抗性功能鉴定[J]. 张全艳,刘晓,于建强,胡大刚,郝玉金. 园艺学报. 2016(11)
[7]玉米回交导入系BC1F2代吐丝期叶片光合参数与耐旱性的关系[J]. 赵晓亮,孙继颖,高聚林,苏治军,王志刚,于晓芳,胡树平. 内蒙古农业科技. 2015(05)
[8]植物盐胁迫抗性的分子机制研究进展[J]. 蔡晓锋,胡体旭,叶杰,张余洋,李汉霞,叶志彪. 华中农业大学学报. 2015(03)
[9]新疆干旱条件下常用玉米自交系耐旱性鉴定研究[J]. 韩登旭,杨杰,邵红雨,梁晓玲,阿布来提·阿布拉,李铭东,程慧金. 玉米科学. 2012(04)
[10]小麦逆境胁迫相关基因Ta14S的克隆及表达分析[J]. 任江萍,刘海伦,王新国,牛洪斌,李永春,王翔,陈新,尹钧. 中国农业科学. 2012(06)
博士论文
[1]番茄转录因子SlbZIP38响应干旱和高盐胁迫的功能研究[D]. 潘阳露.西南大学 2018
[2]水、旱稻种子萌发和叶片光合荧光的差异抗旱机理研究[D]. 滕开琼.河南农业大学 2014
[3]小麦MYB转录因子的功能研究[D]. 张立超.中国农业科学院 2013
[4]渗透胁迫下水稻体内多胺代谢及其生理功能研究[D]. 周小梅.湖南农业大学 2008
硕士论文
[1]玉米抗旱相关基因ZmMYB48你的功能分析[D]. 王彦.安徽农业大学 2018
[2]耐盐碱基因OsMYB56转化水稻的初步研究[D]. 王晓雪.吉林农业大学 2016
[3]转CBF3基因茄子后代植株抗寒性与分子检测研究[D]. 蔡霞.西南大学 2015
[4]玉米蔗糖代谢关键基因灌浆期动态表达及其调控的初步研究[D]. 任晓东.四川农业大学 2014
[5]玉米细胞壁转化酶基因Incw2在玉米籽粒中的过量表达[D]. 李淑君.四川农业大学 2011
[6]玉米酸转化酶基因（ivr2）的耐旱性关联分析及自交系耐旱性分析[D]. 李亮.新疆农业大学 2010
[7]我国常用玉米自交系耐旱性鉴定、评价与改良研究[D]. 李争光.石河子大学 2010
本文编号：3224942
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