大豆微核心种质群体产量相关性状的全基因组关联分析
发布时间：2021-06-16 02:32
大豆[Glycine Max（L.）Merr.]是我国非常重要的粮油兼用作物,其产量的高低与大多数农艺性状有着间接或者直接联系,如:株高、主茎节数、分枝等。目前大豆相比于水稻、小麦等高产作物,产量偏低,育种进程相对缓慢。而借助分子标记与目标性状间的关联,深入剖析性状表型变异的遗传基础,对产量相关性状进行基因定位,不仅为分子标记辅助选择和基因克隆奠定基础,而且大大提高大豆高产育种的效率。大豆微核心种质（minicorecollection）代表了我国2.3万余份栽培大豆种质资源大约63.5%的遗传多样性,是用于大豆基因挖掘和品种改良的优异材料。本研究以224份大豆微核心种质为试验材料,并对表型数据进行了描述性统计分析和方差分析,探讨了产量相关性状之间的相互关系。利用覆盖全基因组1749个单核苷酸多态性（SNP）标记,对株高、主茎节数、分枝、茎粗、平均节间长和有效荚数等6个性状进行全基因组关联分析。在此基础上,对两种模型共同定位到的产量相关性状SNP位点进行优异等位变异的挖掘以及优异种质的筛选。通过对大豆产量相关性状紧密关联的SNPs进行全基因组的鉴定研究,为下一步进行大豆产量相关候选基因...
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１大豆微核心种质群体产量相关性状频率分布图??Ｆｉｇ?２－１?Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ｙｅｉｌ?
Ｎｏｔｅ：?（Ａ）?ＭＡＦ?（Ｂ）?ＰＩＣ?（Ｃ）?Ｈ?（Ｄ）?ＧｅｎｅＤｉｖｅｒｓｉｔｙ??１．４．２连锁不平衡分析??参考本课题组黄婧博士研宄结果（图３－２，图３－３）：通过计算标记两两之间的连??锁不平衡，共获得ＳＮＰｓ组合１１４５３４１对。标记的ＬＤ程度用等位基因亲率相关系数ｒ２来??表示。所有ＳＮＰｓ位点间的ｒ２均值为０．０１３，连锁ＳＮＰ和非连锁ＳＮＰ的ｒ２平均值分别为??０．０３１、０．０１２。存在显著连锁不平衡的ＳＮＰｓ位点间／＊２均值为０．１２８，而存在强连锁不平??衡（？＞０．３３）的ＳＮＰｓ位点有１１７３对，完全连锁（Ｚ＝ｌ）的ＳＮＰ标记共６０对。由ＬＤ值衰??减曲线得出其衰减距离为２４９．２０Ｋｂ。??２８??
0一工0一15Q‘20一25Q一30350一40.450_50‘550一60.650一70.75住80.85D一90一951K加翻峋
【参考文献】：
期刊论文
[1]广西水稻地方品种耐冷性鉴定及相关分析[J]. 夏秀忠,张宗琼,杨行海,农保选,曾宇,刘开强,邓国富,李丹婷. 植物遗传资源学报. 2016(06)
[2]栽培大豆农艺性状的关联分析及优异等位变异挖掘[J]. 杨胜先,牛远,李梦,魏世平,刘晓芬,吕海燕,章元明. 中国农业科学. 2014(20)
[3]大豆全基因组分枝相关基因发掘及与QTL共定位[J]. 谭冰,郭勇,邱丽娟. 遗传. 2013(06)
[4]分子标记技术及其研究进展[J]. 许洹瑞. 黑龙江环境通报. 2013(01)
[5]大豆分枝数和叶柄夹角的相关野生片段分析[J]. 王吴彬,何庆元,杨红燕,向仕华,赵团结,邢光南,盖钧镒. 中国农业科学. 2012(23)
[6]多环境条件下大豆倒伏性相关形态性状的QTL分析[J]. 范冬梅,杨振,马占洲,曾庆力,杜翔宇,蒋洪蔚,刘春燕,韩冬伟,栾怀海,裴宇峰,陈庆山,胡国华. 中国农业科学. 2012(15)
[7]运用关联分析定位栽培大豆蛋白11S、7S组分的相关基因位点[J]. 简爽,文自翔,李海朝,袁道华,李金英,张辉,叶永忠,卢为国. 作物学报. 2012(05)
[8]大豆品质及农艺性状的QTL分析[J]. 蒋春志,裴翠娟,荆慧贤,张孟臣,王涛,邸锐,刘兵强,闫龙. 华北农学报. 2011(05)
[9]分子标记技术及其在水稻基因定位上的应用[J]. 孙正文,黄兴奇,李维蛟,钟巧芳,余腾琼,郭怡卿,李定琴,殷富有,程在全. 基因组学与应用生物学. 2011(01)
[10]大豆产量有关性状QTL的检测[J]. 黄中文,赵团结,喻德跃,陈受宜,盖钧镒. 中国农业科学. 2009(12)
博士论文
[1]大豆对大豆疫霉根腐病抗性基因和QTL的定位[D]. 黄婧.南京农业大学 2015
[2]大豆种质遗传多样性及表型性状关联位点发掘与优异位点序列分析[D]. 李强.内蒙古农业大学 2014
[3]大豆产量相关性状QTL的关联分析及候选基因GmGA3ox单倍型鉴定[D]. 郝德荣.南京农业大学 2011
硕士论文
[1]大豆品种群体株高、分枝数、主茎节数、茎粗和单株荚数的关联分析[D]. 杨胜先.南京农业大学 2011
[2]新型特早熟春性甘蓝型油菜的遗传多样性及其杂种优势的研究[D]. 姚艳梅.青海大学 2008
[3]不同发育时期玉米籽粒品质性状的QTLs动态分析[D]. 赵素贞.新疆农业大学 2007
[4]若干玉米自交系杂种优势群划分的研究[D]. 刘希慧.中国农业大学 2004
本文编号：3232180
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１大豆微核心种质群体产量相关性状频率分布图??Ｆｉｇ?２－１?Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ｙｅｉｌ?
Ｎｏｔｅ：?（Ａ）?ＭＡＦ?（Ｂ）?ＰＩＣ?（Ｃ）?Ｈ?（Ｄ）?ＧｅｎｅＤｉｖｅｒｓｉｔｙ??１．４．２连锁不平衡分析??参考本课题组黄婧博士研宄结果（图３－２，图３－３）：通过计算标记两两之间的连??锁不平衡，共获得ＳＮＰｓ组合１１４５３４１对。标记的ＬＤ程度用等位基因亲率相关系数ｒ２来??表示。所有ＳＮＰｓ位点间的ｒ２均值为０．０１３，连锁ＳＮＰ和非连锁ＳＮＰ的ｒ２平均值分别为??０．０３１、０．０１２。存在显著连锁不平衡的ＳＮＰｓ位点间／＊２均值为０．１２８，而存在强连锁不平??衡（？＞０．３３）的ＳＮＰｓ位点有１１７３对，完全连锁（Ｚ＝ｌ）的ＳＮＰ标记共６０对。由ＬＤ值衰??减曲线得出其衰减距离为２４９．２０Ｋｂ。??２８??
0一工0一15Q‘20一25Q一30350一40.450_50‘550一60.650一70.75住80.85D一90一951K加翻峋
【参考文献】：
期刊论文
[1]广西水稻地方品种耐冷性鉴定及相关分析[J]. 夏秀忠,张宗琼,杨行海,农保选,曾宇,刘开强,邓国富,李丹婷. 植物遗传资源学报. 2016(06)
[2]栽培大豆农艺性状的关联分析及优异等位变异挖掘[J]. 杨胜先,牛远,李梦,魏世平,刘晓芬,吕海燕,章元明. 中国农业科学. 2014(20)
[3]大豆全基因组分枝相关基因发掘及与QTL共定位[J]. 谭冰,郭勇,邱丽娟. 遗传. 2013(06)
[4]分子标记技术及其研究进展[J]. 许洹瑞. 黑龙江环境通报. 2013(01)
[5]大豆分枝数和叶柄夹角的相关野生片段分析[J]. 王吴彬,何庆元,杨红燕,向仕华,赵团结,邢光南,盖钧镒. 中国农业科学. 2012(23)
[6]多环境条件下大豆倒伏性相关形态性状的QTL分析[J]. 范冬梅,杨振,马占洲,曾庆力,杜翔宇,蒋洪蔚,刘春燕,韩冬伟,栾怀海,裴宇峰,陈庆山,胡国华. 中国农业科学. 2012(15)
[7]运用关联分析定位栽培大豆蛋白11S、7S组分的相关基因位点[J]. 简爽,文自翔,李海朝,袁道华,李金英,张辉,叶永忠,卢为国. 作物学报. 2012(05)
[8]大豆品质及农艺性状的QTL分析[J]. 蒋春志,裴翠娟,荆慧贤,张孟臣,王涛,邸锐,刘兵强,闫龙. 华北农学报. 2011(05)
[9]分子标记技术及其在水稻基因定位上的应用[J]. 孙正文,黄兴奇,李维蛟,钟巧芳,余腾琼,郭怡卿,李定琴,殷富有,程在全. 基因组学与应用生物学. 2011(01)
[10]大豆产量有关性状QTL的检测[J]. 黄中文,赵团结,喻德跃,陈受宜,盖钧镒. 中国农业科学. 2009(12)
博士论文
[1]大豆对大豆疫霉根腐病抗性基因和QTL的定位[D]. 黄婧.南京农业大学 2015
[2]大豆种质遗传多样性及表型性状关联位点发掘与优异位点序列分析[D]. 李强.内蒙古农业大学 2014
[3]大豆产量相关性状QTL的关联分析及候选基因GmGA3ox单倍型鉴定[D]. 郝德荣.南京农业大学 2011
硕士论文
[1]大豆品种群体株高、分枝数、主茎节数、茎粗和单株荚数的关联分析[D]. 杨胜先.南京农业大学 2011
[2]新型特早熟春性甘蓝型油菜的遗传多样性及其杂种优势的研究[D]. 姚艳梅.青海大学 2008
[3]不同发育时期玉米籽粒品质性状的QTLs动态分析[D]. 赵素贞.新疆农业大学 2007
[4]若干玉米自交系杂种优势群划分的研究[D]. 刘希慧.中国农业大学 2004
本文编号：3232180
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3232180.html
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