四翅滨藜蛋白激酶、转录因子和抗氧化系统响应盐处理的转录组分析
发布时间:2021-06-18 20:59
四翅滨藜(Atriplex canescens)又称灰毛滨藜,为藜科(Chenopodiaceae)滨藜属多年生C4半常绿灌木,其生长速度快,营养价值较高、叶片四季常绿,是一种极具利用价值的优良饲草资源。同时,四翅滨藜还具有超强的耐旱性和抗盐性,可作为盐渍化荒漠地区植被恢复和防风固沙的重要物种。在长期适应盐渍环境过程中,四翅滨藜进化出了独特的抗盐机理,蕴含着丰富的抗逆基因资源。实验室前期研究已初步阐明了四翅滨藜抗盐的生理机制,并筛选到参与其离子转运、光合作用、水分平衡以及有机渗透调节物质合成等过程的功能基因。但是,目前对四翅滨藜适应盐渍环境过程中的蛋白激酶、转录因子和抗氧化系统相关的分子基础还不清楚,对此展开深入研究将有望为系统揭示该物种的逆境适应机理和挖掘关键抗逆基因奠定基础,这对于四翅滨藜这一资源植物自身的开发利用以及优良牧草的遗传改良均具有十分重要的理论意义。本论文采用RNA-seq高通量测序技术,对盐处理下四翅滨藜的转录组进行测序,在此基础上分析并初步筛选了蛋白激酶、转录因子、抗氧化酶和抗氧化剂合成等相关的差异表达基因,取得如下主要结果:1.对100 mm...
【文章来源】:兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:69 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
转录组测序流程
图 3-1 转录组测序流程Figure 3-1 Transcriptome sequencing process藜根和叶的转录组测序数据进行 Unigene 的过程如图 3-2 所示:
文 四翅滨藜蛋白激酶、转录因子和抗氧化系统响ll-Unigene 从 nr、Swiss-Prot、KEGG、COG,从而确定其蛋白功能注释。最后跟所有TScan 预测其序列信息(熊丽东,2011)。达谱测序。100 mmol/L NaCl 处理 6 h、24 h 的四翅滨行表达谱测序并筛选差异表达基因(Diff体流程如图 3-3 所示:差异表达基因,并对其进行 GO 富集分析,能的生物学功能(Wang 等,2013)。具体分ene Ontology 数据库中的各条目(Term)进;(2)用超几何检验,找出基因显著富集的
【参考文献】:
期刊论文
[1]黄酮类物质的生物合成及对干旱胁迫响应的研究进展[J]. 白禹,卯丹,王继玥. 安徽农业科学. 2018(16)
[2]棉花过表达超氧化物歧化酶基因对植株耐盐性的影响[J]. 胡根海,张晓红,付远志,董娜,王清连. 华北农学报. 2017(06)
[3]活性氧与植物抗氧化系统研究进展[J]. 白英俊,李国瑞,黄凤兰,李威,丛安琪,陈永胜. 安徽农业科学. 2017(36)
[4]四翅滨藜生理生化特征对盐胁迫的响应[J]. 张震中,张潭,李倩,唐达,李思思,王池宇,贺康宁. 西北植物学报. 2017(12)
[5]西北地区种植甘草对土壤次生盐渍化的影响[J]. 李昂,吴应珍,马明广,张鸣,孙海丽,闫立本. 水土保持通报. 2016(06)
[6]逆境胁迫对苦荞花期总黄酮含量及关键酶基因表达的影响[J]. 侯伶俐,杨雄榜,董雪妮,丁梦琦,朱雪梅,邵继荣. 核农学报. 2016(01)
[7]秋茄硫氧还蛋白调控活性氧平衡增强烟草耐盐机制研究[J]. 荆晓姝,孙苑玲,向敏,钱泽勇,郎涛,赵瑞,沈昕,陈少良. 北京林业大学学报. 2015(06)
[8]盐渍化土壤改良的研究进展[J]. 顾文婷,董喜存,李文建,刘瑞媛,金文杰. 安徽农业科学. 2014(06)
[9]甘肃沿黄灌区土壤盐渍化特征及其成因[J]. 杨思存,车宗贤,王成宝,霍琳,姜万礼. 干旱区研究. 2014(01)
[10]土壤盐分对三角叶滨藜抗旱性能的影响[J]. 谭永芹,柏新富,侯玉平,张振华. 生态学报. 2013(23)
博士论文
[1]三种滨藜的旱盐逆境胁迫及其引种适应性评价[D]. 胡生荣.内蒙古农业大学 2008
硕士论文
[1]四翅滨藜耐盐抗旱的生理机制研究[D]. 潘雅清.兰州大学 2016
[2]拟南芥黄烷酮-3-羟化酶调控非生物胁迫抗性机理研究[D]. 孙鹏.山东农业大学 2014
[3]亚麻芥不同发育时期种子转录组测序及分析[D]. 李雨霖.吉林农业大学 2013
[4]植物盐分吸收和积累对其抗旱性能的影响[D]. 谭永芹.鲁东大学 2012
[5]红花转录组测序分析及其油体蛋白全长的获得[D]. 熊丽东.吉林农业大学 2011
[6]盐胁迫对中亚滨藜营养器官内部结构的影响及其盐囊泡发育过程研究[D]. 杨美娟.山东师范大学 2005
本文编号:3237372
【文章来源】:兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:69 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
转录组测序流程
图 3-1 转录组测序流程Figure 3-1 Transcriptome sequencing process藜根和叶的转录组测序数据进行 Unigene 的过程如图 3-2 所示:
文 四翅滨藜蛋白激酶、转录因子和抗氧化系统响ll-Unigene 从 nr、Swiss-Prot、KEGG、COG,从而确定其蛋白功能注释。最后跟所有TScan 预测其序列信息(熊丽东,2011)。达谱测序。100 mmol/L NaCl 处理 6 h、24 h 的四翅滨行表达谱测序并筛选差异表达基因(Diff体流程如图 3-3 所示:差异表达基因,并对其进行 GO 富集分析,能的生物学功能(Wang 等,2013)。具体分ene Ontology 数据库中的各条目(Term)进;(2)用超几何检验,找出基因显著富集的
【参考文献】:
期刊论文
[1]黄酮类物质的生物合成及对干旱胁迫响应的研究进展[J]. 白禹,卯丹,王继玥. 安徽农业科学. 2018(16)
[2]棉花过表达超氧化物歧化酶基因对植株耐盐性的影响[J]. 胡根海,张晓红,付远志,董娜,王清连. 华北农学报. 2017(06)
[3]活性氧与植物抗氧化系统研究进展[J]. 白英俊,李国瑞,黄凤兰,李威,丛安琪,陈永胜. 安徽农业科学. 2017(36)
[4]四翅滨藜生理生化特征对盐胁迫的响应[J]. 张震中,张潭,李倩,唐达,李思思,王池宇,贺康宁. 西北植物学报. 2017(12)
[5]西北地区种植甘草对土壤次生盐渍化的影响[J]. 李昂,吴应珍,马明广,张鸣,孙海丽,闫立本. 水土保持通报. 2016(06)
[6]逆境胁迫对苦荞花期总黄酮含量及关键酶基因表达的影响[J]. 侯伶俐,杨雄榜,董雪妮,丁梦琦,朱雪梅,邵继荣. 核农学报. 2016(01)
[7]秋茄硫氧还蛋白调控活性氧平衡增强烟草耐盐机制研究[J]. 荆晓姝,孙苑玲,向敏,钱泽勇,郎涛,赵瑞,沈昕,陈少良. 北京林业大学学报. 2015(06)
[8]盐渍化土壤改良的研究进展[J]. 顾文婷,董喜存,李文建,刘瑞媛,金文杰. 安徽农业科学. 2014(06)
[9]甘肃沿黄灌区土壤盐渍化特征及其成因[J]. 杨思存,车宗贤,王成宝,霍琳,姜万礼. 干旱区研究. 2014(01)
[10]土壤盐分对三角叶滨藜抗旱性能的影响[J]. 谭永芹,柏新富,侯玉平,张振华. 生态学报. 2013(23)
博士论文
[1]三种滨藜的旱盐逆境胁迫及其引种适应性评价[D]. 胡生荣.内蒙古农业大学 2008
硕士论文
[1]四翅滨藜耐盐抗旱的生理机制研究[D]. 潘雅清.兰州大学 2016
[2]拟南芥黄烷酮-3-羟化酶调控非生物胁迫抗性机理研究[D]. 孙鹏.山东农业大学 2014
[3]亚麻芥不同发育时期种子转录组测序及分析[D]. 李雨霖.吉林农业大学 2013
[4]植物盐分吸收和积累对其抗旱性能的影响[D]. 谭永芹.鲁东大学 2012
[5]红花转录组测序分析及其油体蛋白全长的获得[D]. 熊丽东.吉林农业大学 2011
[6]盐胁迫对中亚滨藜营养器官内部结构的影响及其盐囊泡发育过程研究[D]. 杨美娟.山东师范大学 2005
本文编号:3237372
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