两个水稻品系的穗部性状遗传分析及DNA多态性的分析
发布时间:2021-07-09 09:30
以两个遗传基础相近的水稻品系R4233和测679为材料,通过对其杂交F2代的穗长、一次枝梗数、二次枝梗数和每穗总粒数等性状的相关性分析和通径分析,探讨与两个品系每穗总粒数相关性状对每穗总粒数的影响能力。利用SSR标记检测R4233与测679的遗传相似系数,并利用全基因组重测序技术对R4233和测679进行重测序,用来发掘大量的变异位点。根据这些变异位点进行分子标记的设计,为构建遗传图谱和比较基因组分析提供帮助。主要结果如下:1.在与两品系每穗总粒数相关的性状中,穗长、一次枝梗数和二次枝梗数与每穗总粒数呈极显著正相关。通过对穗长、一次枝梗数、二次枝梗数和每穗总粒数的通径分析,发现二次枝梗数对每穗总粒数的直接通径系数最大,表明二次枝梗数对每穗总粒数的影响力最大。2.R4233和测679的遗传相似系数为85.81%,与根据该品系系谱得到的遗传相似系数89.9%相比较是在可接受范围,表明R4233和测679的系谱是符合预期的。3.本次重测序深度为50X,共获得68GB的数据。使用BWA软件将重测序数据比对到日本晴上,共鉴定出了 R4233和测679中12条染色体上的SNP位点分别有422086...
【文章来源】:广西大学广西壮族自治区 211工程院校
【文章页数】:67 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图3-1穗长频度分布
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【参考文献】:
期刊论文
[1]基于重测序的大豆新品种齐黄34的全基因组变异挖掘[J]. 张彦威,李伟,张礼凤,王彩洁,戴海英,徐冉. 中国油料作物学报. 2016(02)
[2]籼粳稻基因组295个InDel标记的开发[J]. 初志战,郭海滨,曾栋昌,刘耀光. 作物学报. 2016(06)
[3]分子标记在作物育种中应用价值研究[J]. 郝晓华,郝晓玲. 农业技术与装备. 2015(08)
[4]利用二代测序技术高通量分析水稻品种间抗病性差异的分子基础[J]. 刘永振,李构思,王晓宇,韩靖鸾,苏菁,朱小源,陈乐天. 西北植物学报. 2014(09)
[5]利用籼粳交RIL群体对水稻穗部性状的QTL分析[J]. 刘丹,刘进,王嘉宇,毛艇,陈温福. 沈阳农业大学学报. 2013(06)
[6]水稻产量性状相关基因的克隆及其机理研究进展[J]. 卢忠诚,戴超浩,张玉川,许永汉,於金生. 核农学报. 2013(10)
[7]利用染色体单片段代换系定位水稻穗粒数QTL[J]. 朱金燕,杨梅,王中德,王军,周勇,杨杰,范方军,李文奇,梁国华,仲维功. 华北农学报. 2013(04)
[8]水稻产量相关性状QTL定位[J]. 赵建国,蒋开锋,杨莉,杨乾华,万先齐,曹应江,游书梅,罗婧,张涛,郑家奎. 中国水稻科学. 2013(04)
[9]水稻穗粒数相关基因的初步定位[J]. 潘英华,余建平,张强,熊海燕,朱汝财,李自超. 华北农学报. 2013(03)
[10]SRAP分子标记分析广西糯玉米地方品种的遗传多样性[J]. 王兵伟,覃永嫒,覃嘉明,黄安霞,秦洪波,时成俏. 南方农业学报. 2013(01)
博士论文
[1]水稻每穗颖花数的遗传基础剖析及其主效QTLs精细定位[D]. 刘头明.华中农业大学 2009
硕士论文
[1]基于InDels分子标记的扁豆遗传多样性分析[D]. 王林晓.河南工业大学 2016
[2]水稻品种CO39及其NILs基因组重测序序列的组装与SNPs分析[D]. 陶欢.福建农林大学 2016
[3]基于SSR分子标记棉花品种DNA指纹图谱构建的研究[D]. 冯艳芳.新疆农业大学 2015
本文编号:3273492
【文章来源】:广西大学广西壮族自治区 211工程院校
【文章页数】:67 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图3-1穗长频度分布
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【参考文献】:
期刊论文
[1]基于重测序的大豆新品种齐黄34的全基因组变异挖掘[J]. 张彦威,李伟,张礼凤,王彩洁,戴海英,徐冉. 中国油料作物学报. 2016(02)
[2]籼粳稻基因组295个InDel标记的开发[J]. 初志战,郭海滨,曾栋昌,刘耀光. 作物学报. 2016(06)
[3]分子标记在作物育种中应用价值研究[J]. 郝晓华,郝晓玲. 农业技术与装备. 2015(08)
[4]利用二代测序技术高通量分析水稻品种间抗病性差异的分子基础[J]. 刘永振,李构思,王晓宇,韩靖鸾,苏菁,朱小源,陈乐天. 西北植物学报. 2014(09)
[5]利用籼粳交RIL群体对水稻穗部性状的QTL分析[J]. 刘丹,刘进,王嘉宇,毛艇,陈温福. 沈阳农业大学学报. 2013(06)
[6]水稻产量性状相关基因的克隆及其机理研究进展[J]. 卢忠诚,戴超浩,张玉川,许永汉,於金生. 核农学报. 2013(10)
[7]利用染色体单片段代换系定位水稻穗粒数QTL[J]. 朱金燕,杨梅,王中德,王军,周勇,杨杰,范方军,李文奇,梁国华,仲维功. 华北农学报. 2013(04)
[8]水稻产量相关性状QTL定位[J]. 赵建国,蒋开锋,杨莉,杨乾华,万先齐,曹应江,游书梅,罗婧,张涛,郑家奎. 中国水稻科学. 2013(04)
[9]水稻穗粒数相关基因的初步定位[J]. 潘英华,余建平,张强,熊海燕,朱汝财,李自超. 华北农学报. 2013(03)
[10]SRAP分子标记分析广西糯玉米地方品种的遗传多样性[J]. 王兵伟,覃永嫒,覃嘉明,黄安霞,秦洪波,时成俏. 南方农业学报. 2013(01)
博士论文
[1]水稻每穗颖花数的遗传基础剖析及其主效QTLs精细定位[D]. 刘头明.华中农业大学 2009
硕士论文
[1]基于InDels分子标记的扁豆遗传多样性分析[D]. 王林晓.河南工业大学 2016
[2]水稻品种CO39及其NILs基因组重测序序列的组装与SNPs分析[D]. 陶欢.福建农林大学 2016
[3]基于SSR分子标记棉花品种DNA指纹图谱构建的研究[D]. 冯艳芳.新疆农业大学 2015
本文编号:3273492
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