基于Rpb2基因序列的燕麦属物种关系研究及中国裸燕麦种质资源遗传多样性分析

发布时间：2021-07-11 02:57

　　燕麦属（Avena L.）隶属于禾本科（Poaceae）,目前发现约30个物种。其染色体基数为7。燕麦属物种中包含A、B、C、D四种主要的染色体类型,并构成三种染色体倍性。燕麦属中,许多物种在形态特征上十分相似、并且地理分布重叠,加之染色体间存在高度的同源性等,使得燕麦物种间的亲缘关系十分复杂,特别是仅存在于多倍体中的B、D基因组来源更是目前燕麦系统发育研究的焦点问题。普通栽培燕麦作为一种粮草兼用型作物,在农业生产中占据重要地位。普通栽培燕麦又可分为裸燕麦和皮燕麦。裸燕麦相比皮燕麦,具有更高的营养价值,但裸燕麦产量较低。因此培育高产优质的裸燕麦品种是裸燕麦发展的关键。遗传多样性是作物育种的基础,为新品种选育提供了可能。我国是裸燕麦的起源中心,具有丰富的裸燕麦遗传资源,但关于我国裸燕麦资源的遗传多样性的研究还鲜有报道。基于此,本研究通过核基因Rpb2的序列比对,对燕麦属物种及基因组系统进化关系进行研究。同时利用大规模简化基因组测序（GBS）对中国裸燕麦种质资源的遗传多样性以及群体结构进行研究,旨在为裸燕麦种质资源评价、利用、保护提供理论依据。主要的研究结果如下:1.A基因组二倍体的Rpb... 

【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校

【文章页数】：58 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１－２你Ｗ基因Ｃ基因组拷贝类型间的主要序列差异??Ｆｉｇ．?１－２?Ｔｈｅ?ｍａｊｏｒ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓ?ａｍｏｎｇ?Ｒｐｂ２?ｇｅｎｅ?ｃｏｐｙ?ｏｒｉｇｉｎａｔ?

共获得２１７４个ＭＡＦ大于０．０５，且ｃａｌｌ?ｒａｔｅ大于０．８的单倍型标记。２１７４个单倍型的??平均ＭＡＦ为０．３１，平均ｃａｌｌ?ｒａｔｅ为０．８９。对２１７４个单倍型的ＭＡＦ区间分布作图后??发现，在不同的ＭＡＦ区间不尽相同（图２－１）。其中ＭＡＦ在０．４０－０．５０区间的标记??０．３??５９２??０．２５?；??４８４??：｜?Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ??：：—＿Ｉ—Ｉ—１—．．．．Ｉ—．Ｉ—??０．０５－０．１０?０．１０－０．２０?０．２０－０．３０?０．３０－０．４０?０．４００．５０??图２－１?２１７４个单倍型ＭＡＦ区间分布。ＭＡＦ低于０．０５的单倍型不在统计范围内，图中柱上数字??为此区间单倍型数量。??Ｆｉｇ．?２－１?Ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅ?ｏｆ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ＭＡＦ?ｏｆ?２１７４?ｈａｐｌｏｔｙｐｅｓ．?Ｈａｐｌｏｔｙｐｅｓ?ｗｉｔｈ?ＭＡＦ?ｌｏｗｅｒ?ｔｈａｎ?０．０５??ｗｅｒｅ?ｅｘｃｌｕｄｅｄ?ｉｎ?ｔｈｉｓ?ａｎａｌｙｓｉｓ．?Ｔｈｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｎ?ｔｈｅ?ｂａｒ?ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ?ｔｈｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｈａｐｌｏｔｙｐｅｓ?ｉｎ?ｔｈｉｓ??ｉｎｔｅｒｖａｌ．??３４??

３．３群体遗传结构分析??３．３．１聚类分析??采用ＵＰＧＭＡ法的聚类结果显示（图２－２），１６１份来自１２个地理种群的材料，??被分成了?Ａ、Ｂ两大支，Ａ支中共有８７份材料，其中３５份来自山西、５份来自河北、??２０份来自内蒙古、２份来自四川、８份来自陕西、５份来自甘肃、４份来自青海、３??份来自贵州、３份来自云南、１份来自青海及１份来自西藏，除了６份来自内蒙古以??及２份来自山西的材料为栽培燕麦外，其余均为地方品种。Ｂ支中共包括７４份材料，??其中２８份来自山西、１６份来自河北、１５份来自内蒙古、７份来自四川和８份来自吉??林。??３６??


本文编号：3277190