玉米株高和穗位高及其一般配合力的全基因组关联分析
发布时间：2021-07-29 13:14
在玉米育种和生产过程中,株高（PH）和穗位高（EH）是重要的农艺性状,在抗倒伏性状上起到非常重要的作用,进而影响玉米的产量和品质,从分子水平对玉米PH和EH及其一般配合力（GCA）效应进行遗传解析对这些性状的遗传改良具有重要意义。前期研究中,我们利用美国Illumina公司生产的maizeSNP50BeadChip芯片（包含56110个SNP标记）对362份玉米自交系的基因型进行了检测,本研究以其中340份自交系为材料,通过一年多点田间试验对供试自交系的PH和EH进行鉴定;同时以一个综合种CZ1302为母本,以供试自交系为父本,按顶交法配制测交种;通过多年多点田间试验,对供试自交系PH和EH的GCA效应进行测定;结合SNP分子标记数据与PH和EH表型鉴定结果及其GCA测定结果,进行全基因组关联分析。主要结果如下:1 通过筛选获得43979个具有多态性的高质量SNP,相邻标记间平均距离为47Kb,在全基因组上的连锁不平衡（LD）衰减距离为450-50QKb。群体结构分析结果表明,可将340份自交系材料分为三个亚群:Tropical群、NSS群和SS群,分别包括124、67和149份自交系...
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：97 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１关联分析基本原理（引自陈秀辰２０１２［４５］）??
另外，ＧＷＡＳ可以对控制ＩＩ标性状的基因更加精细的预测，精确度可以达到８０％，??因此做为一个全新的且先进的研究方法得到了国际上的认可。ＧＷＡＳ的技术路线图如??图２。??种质资源收集和选择??全基因组分子标记?确定目标性状??标记间ＬＤ分析ｊ?群体结构分析ｊ?｜表型性状鉴定??标记与表型性状间关联分析??图２全基因组关联分析技术路线（引自陈秀辰２０１２）?［４５１??Ｆｉｇ．２?Ｔｈｅ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏａｄｍａｐ?ｏｆ?ＧＷＡＳ??候选基因关联分析需要提前确定与Ｐ标相关的候选基因，包括候选坫？的功能预??测信息，这些资料只是关于被确定的候选蕋因本身而Ｂ。候选基因关联分析的技术路??线如图３。??１１??
候选基因关联分析需要提前确定与Ｐ标相关的候选基因，包括候选坫？的功能预??测信息，这些资料只是关于被确定的候选蕋因本身而Ｂ。候选基因关联分析的技术路??线如图３。??１１??
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genome-Wide Expression Profile of Maize Root Response to Phosphorus Deficiency Revealed by Deep Sequencing[J]. SU Shun-zhong,WU Ling,LIU Dan,LU Yan-li,LIN Hai-jian,ZHANG Shu-zhi,SHEN Ya-ou,LIU Hai-lan,ZHANG Zhi-ming,RONG Ting-zhao,ZHANG Xiao,TIAN Yue-hui,NIE Zhi,GAO Shi-bin. Journal of Integrative Agriculture. 2014(06)
[2]基于QTL定位分析策略的一般配合力遗传基础研究[J]. 胡文明,徐扬,张恩盈,徐辰武. 中国农业科学. 2013(16)
[3]中国玉米生产发展历程、存在问题及对策[J]. 赵久然,王荣焕. 中国农业科技导报. 2013(03)
[4]玉米穗位高全基因组关联分析及其候选基因预测[J]. 李博,张焕欣,杨小艳,吕颖颖,江培顺,郝转芳,吕香玲,王宏伟,翁建峰. 作物杂志. 2013(02)
[5]数量性状关联分析及其在蔬菜中的应用[J]. 陈秀辰,杨旭,成玉富,薛林宝,陈学好. 中国蔬菜. 2012(16)
[6]玉米论略[J]. 韩长赋. 农业经济问题. 2012(06)
[7]Conversion of the Statistical Combining Ability into a Genetic Concept[J]. LV Ai-zhi1, 2, ZHANG Hao1, ZHANG Zu-xin1, 2, TAO Yong-sheng1, YUE Bing2 and ZHENG Yong-lian2 1 College of Agronomy, Hebei Agricultural University/Hebei Sub-Center of National Maize Improvement Center, Baoding 071001, P.R. China 2 National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, P.R.China. Journal of Integrative Agriculture. 2012(01)
[8]Stability of QTL Across Environments and QTL-by-Environment Interactions for Plant and Ear Height in Maize[J]. ZHANG Yan1,LI Yong-xiang1,WANG Yang1,LIU Zhi-zhai1,3,LIU Cheng2,PENG Bo1,TAN Wei-wei1,WANG Di1,SHI Yun-su1,SUN Bao-cheng2,SONG Yan-chun1,WANG Tian-yu1 and LI Yu1 1 Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,P.R.China 2 Institute of Food Crops,Xinjiang Academy of Agricultural Sciences,Urumqi 830000,P.R.China 3 Maize Research Institute,Southwest University,Chongqing 400716,P.R.China. Agricultural Sciences in China. 2010(10)
[9]玉米株高和穗位高的QTL定位[J]. 杨晓军,路明,张世煌,周芳,曲延英,谢传晓. 遗传. 2008(11)
[10]玉米自交系主要数量性状配合力及利用潜力分析[J]. 赵保献,陈润玲,雷晓兵,梁晓伟,王向阳,李林,卫勇强. 中国农学通报. 2008(10)
博士论文
[1]玉米自交系遗传多样性与表型性状关联分析及分子ID构建[D]. 李伟忠.东北农业大学 2011
硕士论文
[1]利用重组自交系群体定位一般配合力相关性状QTL[D]. 张庆路.华中农业大学 2010
[2]玉米DH群体株高、节间长、穗部性状和一般配合力的分析及QTL定位[D]. 张建华.河北农业大学 2009
[3]利用水稻重组自交系进行配合力遗传效应分析[D]. 付新民.华中农业大学 2009
[4]玉米DH系的一般配合力分析及其QTL定位[D]. 顾丽香.河北农业大学 2007
本文编号：3309390
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：97 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１关联分析基本原理（引自陈秀辰２０１２［４５］）??
另外，ＧＷＡＳ可以对控制ＩＩ标性状的基因更加精细的预测，精确度可以达到８０％，??因此做为一个全新的且先进的研究方法得到了国际上的认可。ＧＷＡＳ的技术路线图如??图２。??种质资源收集和选择??全基因组分子标记?确定目标性状??标记间ＬＤ分析ｊ?群体结构分析ｊ?｜表型性状鉴定??标记与表型性状间关联分析??图２全基因组关联分析技术路线（引自陈秀辰２０１２）?［４５１??Ｆｉｇ．２?Ｔｈｅ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏａｄｍａｐ?ｏｆ?ＧＷＡＳ??候选基因关联分析需要提前确定与Ｐ标相关的候选基因，包括候选坫？的功能预??测信息，这些资料只是关于被确定的候选蕋因本身而Ｂ。候选基因关联分析的技术路??线如图３。??１１??
候选基因关联分析需要提前确定与Ｐ标相关的候选基因，包括候选坫？的功能预??测信息，这些资料只是关于被确定的候选蕋因本身而Ｂ。候选基因关联分析的技术路??线如图３。??１１??
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genome-Wide Expression Profile of Maize Root Response to Phosphorus Deficiency Revealed by Deep Sequencing[J]. SU Shun-zhong,WU Ling,LIU Dan,LU Yan-li,LIN Hai-jian,ZHANG Shu-zhi,SHEN Ya-ou,LIU Hai-lan,ZHANG Zhi-ming,RONG Ting-zhao,ZHANG Xiao,TIAN Yue-hui,NIE Zhi,GAO Shi-bin. Journal of Integrative Agriculture. 2014(06)
[2]基于QTL定位分析策略的一般配合力遗传基础研究[J]. 胡文明,徐扬,张恩盈,徐辰武. 中国农业科学. 2013(16)
[3]中国玉米生产发展历程、存在问题及对策[J]. 赵久然,王荣焕. 中国农业科技导报. 2013(03)
[4]玉米穗位高全基因组关联分析及其候选基因预测[J]. 李博,张焕欣,杨小艳,吕颖颖,江培顺,郝转芳,吕香玲,王宏伟,翁建峰. 作物杂志. 2013(02)
[5]数量性状关联分析及其在蔬菜中的应用[J]. 陈秀辰,杨旭,成玉富,薛林宝,陈学好. 中国蔬菜. 2012(16)
[6]玉米论略[J]. 韩长赋. 农业经济问题. 2012(06)
[7]Conversion of the Statistical Combining Ability into a Genetic Concept[J]. LV Ai-zhi1, 2, ZHANG Hao1, ZHANG Zu-xin1, 2, TAO Yong-sheng1, YUE Bing2 and ZHENG Yong-lian2 1 College of Agronomy, Hebei Agricultural University/Hebei Sub-Center of National Maize Improvement Center, Baoding 071001, P.R. China 2 National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, P.R.China. Journal of Integrative Agriculture. 2012(01)
[8]Stability of QTL Across Environments and QTL-by-Environment Interactions for Plant and Ear Height in Maize[J]. ZHANG Yan1,LI Yong-xiang1,WANG Yang1,LIU Zhi-zhai1,3,LIU Cheng2,PENG Bo1,TAN Wei-wei1,WANG Di1,SHI Yun-su1,SUN Bao-cheng2,SONG Yan-chun1,WANG Tian-yu1 and LI Yu1 1 Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,P.R.China 2 Institute of Food Crops,Xinjiang Academy of Agricultural Sciences,Urumqi 830000,P.R.China 3 Maize Research Institute,Southwest University,Chongqing 400716,P.R.China. Agricultural Sciences in China. 2010(10)
[9]玉米株高和穗位高的QTL定位[J]. 杨晓军,路明,张世煌,周芳,曲延英,谢传晓. 遗传. 2008(11)
[10]玉米自交系主要数量性状配合力及利用潜力分析[J]. 赵保献,陈润玲,雷晓兵,梁晓伟,王向阳,李林,卫勇强. 中国农学通报. 2008(10)
博士论文
[1]玉米自交系遗传多样性与表型性状关联分析及分子ID构建[D]. 李伟忠.东北农业大学 2011
硕士论文
[1]利用重组自交系群体定位一般配合力相关性状QTL[D]. 张庆路.华中农业大学 2010
[2]玉米DH群体株高、节间长、穗部性状和一般配合力的分析及QTL定位[D]. 张建华.河北农业大学 2009
[3]利用水稻重组自交系进行配合力遗传效应分析[D]. 付新民.华中农业大学 2009
[4]玉米DH系的一般配合力分析及其QTL定位[D]. 顾丽香.河北农业大学 2007
本文编号：3309390
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3309390.html
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