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五味子科药用植物叶绿体基因组学研究与内南五味子的分子鉴定

发布时间:2021-07-30 05:47
  五味子科Schisandraceae隶属于木兰藤目Austrobaileyales,本文研究所用概念为狭义五味子科,包括五味子属Schisandra和南五味子属Kadsura。五味子科植物具有重要的药用价值,其中五味子(五味子S.chinensis)、南五味子(华中五味子S.sphenanthera)以及滇鸡血藤(内南五味子K.interior)已被收入《中国药典》一部(2015版)。然而,五味子科的系统学研究存在一些问题,例如:五味子属和南五味子属是否为单系类群、属下分类及物种归并是否合理等。这些问题在一定程度上影响到临床用药疗效。因此,本论文开展了五味子科叶绿体基因组学研究、DNA系统发育树的重建和谱系地理学方法的分析,以期通过上述新技术和新方法,对五味子科系统发育和物种鉴定进行探讨。叶绿体基因组属于母系遗传,具有遗传信息丰富、核苷酸置换率适中、在不同植物类群中有较好的共线性等优点,是植物系统发育研究的理想工具。本研究利用二代测序技术Illumina测序平台,对五味子科12物种16份样本进行测序,摸索出一套叶绿体基因组组装策略,并且通过一代测序的验证,组装正确率100%。通过长度比... 

【文章来源】:北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章页数】:83 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
    第一节 五味子科分类简史
        1 五味子科植物的传统应用
        2 五味子科植物的分布情况
        3 五味子科的系统位置
        4 五味子科属间关系
        5 五味子科的属下分类
        6 五味子科的物种分类及其对传统应用的影响
        7 小结
    第二节 叶绿体基因组研究进展
        1 叶绿体基因组结构及特点
        2 叶绿体基因组测序方法
        3 叶绿体基因组的应用
    第三节 本课题研究意义和创新
第二章 五味子科叶绿体基因组研究
    第一节 材料与方法
        1 实验材料、试剂与仪器
        2 方法
    第二节 结果与分析
        1 叶绿体基因组基本信息
        2 叶绿体基因组注释
        3 重复序列分析
        4 比较分析
        5 系统进化分析
    第三节 小结
        1 五味子科叶绿体基因组组装
        2 五味子科叶绿体基因组结构
        3 五味子科叶绿体基因组系统学发育重建
第三章 内南五味子分类与分子鉴定研究
    第一节 南五味子属植物形态特征
        1 雄花形态
        2 果实形态
        3 茎与叶形态
    第二节 DNA条形码鉴定
        1 材料与方法
        2 结果与分析
        3 讨论
    第三节 谱系地理分析方法在物种鉴定中的应用
        1 材料与方法
        2 结果与分析
        3 讨论
第四章 结论和展望
    第一节 结论
    第二节 展望
参考文献
缩略词
致谢
作者简介



本文编号:3310825

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