结合关联与连锁分析剖析玉米籽粒生育酚含量的遗传基础及一个主效QTL的精细定位
发布时间：2021-08-17 09:53
生育酚在维持植物生长发育和人体健康中发挥着重要作用,而生育酚在蓝藻和拟南芥等模式植物中的合成途径也已经有较为详尽的研究,然而玉米（Zea mays L.）籽粒中生育酚含量的遗传基础至今仍不甚清楚。本研究将全基因组关联分析（GWAS）与连锁分析相结合,以剖析玉米籽粒生育酚的遗传基础。本研究以玉米籽粒中γ-生育酚、α-生育酚、δ-生育酚、总生育酚含量及α/γ-生育酚之比做为目标性状进行研究,主要结果如下:本研究采用6个遗传及生育酚表型变异丰富的重组自交系（RIL）群体用于连锁分析。基于实验室前期建立的高密度遗传连锁图进行QTL定位,共检测到89个QTL,其中有44个QTL在多个RIL群体中同时检测到,另有45个QTL仅在单个RIL群体中检测到。将影响不同性状的置信区间重叠的QTL合并,得到41个非重复QTL,其中有10个主效QTL——每个主效QTL可解释10%以上的表型变异,有11个非重复QTL可影响多个生育酚性状。经与之前研究比较,本研究检测到的10个非重复QTL为首次检测到,暗示不同遗传背景可能含有不同有利等位基因。通过上位性分析,本研究发现两个基因的互作对生育酚表型的贡献仅起次要作用...
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：139 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
生育酚与生育三烯酚的分子结构与活性（引自DellaPennaandMène-Saffrané2011）
图 2 高等植物中生育酚的合成途径DMPBQ，2,3-二甲基-5-植基-1,4-苯醌；D；GGPP，牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸；HG-6-植基-1,4-苯醌；PDP，植基二磷酸；P氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶；DXS，1儿基焦磷酸合酶；GGR，牻牛儿基牻牛儿iosynthetic pathway of tocopherols in higcompounds in this pathway are l-benzoquinol; DXP, 1-deoxy-D-xylulosGGPP, geranylgeranyl pyrophosphate; HGABQ, 2-methyl-6-phytyl-benzoquinol; PDP, piations for enzymes in the pathway reductoisomerase; DXS, deoxyoxylulose-5-phate synthase; GGR, geranylgeranygenase.
关联分析中的群体结构示例 （引自 Rafalski亚群，抗病表型（图中红圈表示）频率在两亚在两亚群中分布频率差异较大的位点均可能被f population structure in association mappingn be divided into two subpopulations. Since ther
【参考文献】：
期刊论文
[1]数量性状基因的完备区间作图方法[J]. 王建康. 作物学报. 2009(02)
[2]数量性状基因定位的混合线性模型分析方法[J]. 朱军. 遗传. 1998(S1)
博士论文
[1]玉米籽粒氨基酸全基因组关联分析与连锁分析及玉米和水稻代谢组的比较分析[D]. 邓敏.华中农业大学 2017
[2]一种交替运用固定效应和随机效应模型优化全基因组关联分析的算法开发[D]. 刘小磊.华中农业大学 2016
本文编号：3347551
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：139 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
生育酚与生育三烯酚的分子结构与活性（引自DellaPennaandMène-Saffrané2011）
图 2 高等植物中生育酚的合成途径DMPBQ，2,3-二甲基-5-植基-1,4-苯醌；D；GGPP，牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸；HG-6-植基-1,4-苯醌；PDP，植基二磷酸；P氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶；DXS，1儿基焦磷酸合酶；GGR，牻牛儿基牻牛儿iosynthetic pathway of tocopherols in higcompounds in this pathway are l-benzoquinol; DXP, 1-deoxy-D-xylulosGGPP, geranylgeranyl pyrophosphate; HGABQ, 2-methyl-6-phytyl-benzoquinol; PDP, piations for enzymes in the pathway reductoisomerase; DXS, deoxyoxylulose-5-phate synthase; GGR, geranylgeranygenase.
关联分析中的群体结构示例 （引自 Rafalski亚群，抗病表型（图中红圈表示）频率在两亚在两亚群中分布频率差异较大的位点均可能被f population structure in association mappingn be divided into two subpopulations. Since ther
【参考文献】：
期刊论文
[1]数量性状基因的完备区间作图方法[J]. 王建康. 作物学报. 2009(02)
[2]数量性状基因定位的混合线性模型分析方法[J]. 朱军. 遗传. 1998(S1)
博士论文
[1]玉米籽粒氨基酸全基因组关联分析与连锁分析及玉米和水稻代谢组的比较分析[D]. 邓敏.华中农业大学 2017
[2]一种交替运用固定效应和随机效应模型优化全基因组关联分析的算法开发[D]. 刘小磊.华中农业大学 2016
本文编号：3347551
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3347551.html
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