以色列及周边地区野生大麦群体遗传多态性分析
发布时间：2021-08-29 17:39
本研究以源自大麦起源及多样性中心--以色列南部、中部和北部的9个不同自然群体144个生态型的野生二棱大麦为材料,采用SSR标记在DNA分子水平对该材料进行遗传多样性和群体遗传结构分析研究。主要研究结果如下:1.从大麦全基因组染色体的120对SSR标记中筛选出42对多态性高、重复性好的SSR引物,这些引物均匀分布在7条染色体上,平均每条染色体上有6对,且位于染色体不同Bin位置上。2.利用筛选的42对SSR引物对以色列9个野生二棱大麦自然群体进行多态性研究,共检测到189个等位变异,平均每个标记有4.5个,变幅为37个。标记多态性信息含量（PIC）平均值为0.6968,变幅为0.52990.8233。其中,Bmag0812的PIC值最大,其次是HVM74;PIC值最小的是Bmag0105。本实验的PIC值均大于0.5,表明所选SSR标记多态性都比较明显。另外我们发现位于染色体5H上的SSR标记等位基因位点多,多态性信息含量也较大。3.通过聚类分析144个野生二棱大麦生态型可知,遗传相似性指数介于0.55030.9365间,...
【文章来源】：贵州大学贵州省 211工程院校
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
以色列9个野生大麦群体地理分布
数量Quantity基因型GenotypeSBH9 SBH10 SBH11 SBH09-1 SBHSBH09-5 SBH09-6 SBH09-7 SBH09-8 11 Nah20 Nah21 Nah22 Nah23 Nah24 NNah29 Nah3018 SBW1 SBW2 SBW3 SBW5 SBW6 SBW09-2 SBW09-3 SBW09-5 SBWSBW09-10 SBW09-13 SBW09-14 SBW10 GN1 GN2 GN3 GN4 GN5 GN6 GN7 GN群体北不同地区的 9 个野生大麦群体共 101 个基因(Baek, 2003)，各位点地理名称及生态地理数据
置为 100000，做遗传结构图。第三章 结果分析3.1 SSR 引物的筛选3.1.1 琼脂糖电泳初筛本 实 验 所 用 引 物 序 列 信 息 均 从 GrainGenes 数 据 库 获 得 (http://wheat.pw.usda.gov/GG2/index.shtml )，由上海生工生物技术服务公司合成。从以色列野生二棱大麦 28 个群体中随机抽取一个基因型作为筛选引物的样本，用琼脂糖凝胶电泳对合成的 150 对 SSR 引物多态性进行初筛 (图 3-1) ，根据条带清晰度可以优化 PCR 程序，选择各引物合适的退火温度。最终筛选出具有多态性且均匀分布在大麦基因组的 7 条染色体的引物 42 对，其在染色体上的位置如图 3-2，从图中可得，扩增片段大小在 100~300bp之间。
【参考文献】：
期刊论文
[1]小麦籽粒蛋白含量相关基因NAM新等位变异的挖掘[J]. 朱娉,冯波,徐智斌,樊小莉,王涛. 麦类作物学报. 2016(07)
[2]微卫星DNA进化特征研究进展[J]. 柳莹,唐永政,高丽. 基因组学与应用生物学. 2014(06)
[3]西藏青稞种质资源醇溶蛋白遗传多样性分析[J]. 曾兴权. 西藏科技. 2014(06)
[4]大麦遗传多样性及连锁不平衡分析[J]. 赖勇,孟亚雄,王晋,范贵强,司二静,王鹏喜,李葆春,马小乐,杨轲,尚勋武,王化俊. 作物学报. 2013(12)
[5]大麦DUS测试标准品种的遗传多样性分析及指纹图谱的构建[J]. 王艳平,沈奇,张继红,李华勇,吴燕. 麦类作物学报. 2013(02)
[6]大麦SSR标记遗传多样性及其与农艺性状关联分析[J]. 赖勇,王鹏喜,范贵强,司二静,王晋,杨轲,孟亚雄,李葆春,马小乐,尚勋武,王化俊. 中国农业科学. 2013(02)
[7]野生大麦种质在大麦育种中的利用研究[J]. 牛小霞,吕建敏,郭天云. 现代农业科技. 2012(20)
[8]CAPS标记技术及其应用进展[J]. 邢延豪,周延清,楚素霞,郭静佩,周鹏,范念斯. 江苏农业科学. 2011(05)
[9]起源地生态地理因素对野生二棱大麦生长的影响[J]. 严俊,王莹,Y.Gutterman,E.Nevo,程剑平. 西南农业学报. 2010(06)
[10]植物遗传多样性及其影响因素[J]. 文亚峰,韩文军,吴顺. 中南林业科技大学学报. 2010(12)
博士论文
[1]以色列野生二粒小麦遗传多样性及模式种短柄草幼苗和根系研究[D]. 董攀.四川农业大学 2010
硕士论文
[1]大麦黄花叶病抗性鉴定及关联SSR标记的筛选[D]. 刘志敏.扬州大学 2011
[2]甘啤系列啤酒大麦品种（系）与国外引进品种遗传多样性的SSR分析[D]. 杨振华.甘肃农业大学 2009
[3]一个野生大麦群体与栽培大麦品种间遗传多样性的比较[D]. 佘奎军.西北农林科技大学 2008
[4]贵州省部分小麦种质资源SSR遗传多样性研究及指纹图谱构建[D]. 张敏.贵州大学 2007
本文编号：3371090
【文章来源】：贵州大学贵州省 211工程院校
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
以色列9个野生大麦群体地理分布
数量Quantity基因型GenotypeSBH9 SBH10 SBH11 SBH09-1 SBHSBH09-5 SBH09-6 SBH09-7 SBH09-8 11 Nah20 Nah21 Nah22 Nah23 Nah24 NNah29 Nah3018 SBW1 SBW2 SBW3 SBW5 SBW6 SBW09-2 SBW09-3 SBW09-5 SBWSBW09-10 SBW09-13 SBW09-14 SBW10 GN1 GN2 GN3 GN4 GN5 GN6 GN7 GN群体北不同地区的 9 个野生大麦群体共 101 个基因(Baek, 2003)，各位点地理名称及生态地理数据
置为 100000，做遗传结构图。第三章 结果分析3.1 SSR 引物的筛选3.1.1 琼脂糖电泳初筛本 实 验 所 用 引 物 序 列 信 息 均 从 GrainGenes 数 据 库 获 得 (http://wheat.pw.usda.gov/GG2/index.shtml )，由上海生工生物技术服务公司合成。从以色列野生二棱大麦 28 个群体中随机抽取一个基因型作为筛选引物的样本，用琼脂糖凝胶电泳对合成的 150 对 SSR 引物多态性进行初筛 (图 3-1) ，根据条带清晰度可以优化 PCR 程序，选择各引物合适的退火温度。最终筛选出具有多态性且均匀分布在大麦基因组的 7 条染色体的引物 42 对，其在染色体上的位置如图 3-2，从图中可得，扩增片段大小在 100~300bp之间。
【参考文献】：
期刊论文
[1]小麦籽粒蛋白含量相关基因NAM新等位变异的挖掘[J]. 朱娉,冯波,徐智斌,樊小莉,王涛. 麦类作物学报. 2016(07)
[2]微卫星DNA进化特征研究进展[J]. 柳莹,唐永政,高丽. 基因组学与应用生物学. 2014(06)
[3]西藏青稞种质资源醇溶蛋白遗传多样性分析[J]. 曾兴权. 西藏科技. 2014(06)
[4]大麦遗传多样性及连锁不平衡分析[J]. 赖勇,孟亚雄,王晋,范贵强,司二静,王鹏喜,李葆春,马小乐,杨轲,尚勋武,王化俊. 作物学报. 2013(12)
[5]大麦DUS测试标准品种的遗传多样性分析及指纹图谱的构建[J]. 王艳平,沈奇,张继红,李华勇,吴燕. 麦类作物学报. 2013(02)
[6]大麦SSR标记遗传多样性及其与农艺性状关联分析[J]. 赖勇,王鹏喜,范贵强,司二静,王晋,杨轲,孟亚雄,李葆春,马小乐,尚勋武,王化俊. 中国农业科学. 2013(02)
[7]野生大麦种质在大麦育种中的利用研究[J]. 牛小霞,吕建敏,郭天云. 现代农业科技. 2012(20)
[8]CAPS标记技术及其应用进展[J]. 邢延豪,周延清,楚素霞,郭静佩,周鹏,范念斯. 江苏农业科学. 2011(05)
[9]起源地生态地理因素对野生二棱大麦生长的影响[J]. 严俊,王莹,Y.Gutterman,E.Nevo,程剑平. 西南农业学报. 2010(06)
[10]植物遗传多样性及其影响因素[J]. 文亚峰,韩文军,吴顺. 中南林业科技大学学报. 2010(12)
博士论文
[1]以色列野生二粒小麦遗传多样性及模式种短柄草幼苗和根系研究[D]. 董攀.四川农业大学 2010
硕士论文
[1]大麦黄花叶病抗性鉴定及关联SSR标记的筛选[D]. 刘志敏.扬州大学 2011
[2]甘啤系列啤酒大麦品种（系）与国外引进品种遗传多样性的SSR分析[D]. 杨振华.甘肃农业大学 2009
[3]一个野生大麦群体与栽培大麦品种间遗传多样性的比较[D]. 佘奎军.西北农林科技大学 2008
[4]贵州省部分小麦种质资源SSR遗传多样性研究及指纹图谱构建[D]. 张敏.贵州大学 2007
本文编号：3371090
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3371090.html
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