马铃薯ARGONAUTE基因家族成员的克

发布时间：2021-09-01 21:57

　　Argonaute蛋白是RNA诱导沉默复合体（RISC）的核心蛋白,它联合不同小RNA参与植物体内各种RNA沉默通路,在植物生长发育、抗逆境胁迫和抗病毒防御等生命过程发挥重要作用。本研究利用生物信息学方法在马铃薯中鉴定并克隆了14个StAGOs基因,并通过表达分析初步探究其基因功能。主要结果如下:1.通过生物信息学方法找到了14个潜在的马铃薯AGO基因,分别编码475（StAGO4-3）到1127个氨基酸（StAGO1-2）。这些StAGOs基因分布在马铃薯第1、2、3、6、7、9、12号染色体上,对其编码蛋白的保守结构域分析发现StAGO4-3缺少PAZ结构域,可能为假基因,其余13个StAGOs基因包含AGO蛋白典型的保守结构域,鉴定确实为AGO基因家族的成员。2.根据NCBI和PGSC数据库中StAGOs基因转录本序列信息,设计特异性引物,从马铃薯中克隆得到了14个StAGOs基因的全长cDNA序列,测序结果表明克隆的序列与数据库中的序列相似度从83.15%（StAGO2-2）到99.59%（StAGO1-2）,编码蛋白的相似度从66.22%（StAGO2-2）到99.73%（S... 

【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：73 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

pHELLSGATE8载体结构

图 3.1 StAGOs 基因外显子/内含子结构分析。黄色条：外显子，黑线：内含子Fig.3.1 Exon/intron organizations of StAGOs. Yellow bars: exons; black lines: introns.表 3-2 StAGOs 的蛋白相关信息

图3.2 StAGOs基因在染色体上的分布。箭头代表基因的转录方向Fig.3.2 Genomic distributions of StAGOs on potato chromosomes. The arrows next to genenames show the direction of transcription为研究确定的StAGOs 基因是否为能发挥其家族正常功能的功能基因而非假

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]长期干旱条件下苹果水分利用效率调控的蛋白组学研究及相关基因鉴定[D]. 周莎莎.西北农林科技大学 2016
[2]马铃薯Y病毒新变异株系的克隆鉴定及马铃薯—病毒互作机制研究[D]. 聂碧华.华中农业大学 2010



本文编号：3377758