高粱硬脂酰-ACP脱氢酶基因（SbSAD）家族鉴定及不同发育阶段表达分析

发布时间：2021-09-11 17:26

　　硬脂酰-ACP脱氢酶是形成不饱和脂肪酸的关键酶。利用拟南芥蛋白序列作为比对序列在NCBI和Phytozome数据库进行Blastp同源比对,共鉴定11个SbSADs基因。对SbSAD基因家族进行蛋白特性、进化关系、不同发育阶段表达、基因结构、保守基序、染色体定位、基因二级和三级结构、启动子区的顺式元件及种子发育阶段表达分析,结果显示,SbSADs基因编码区为1 134～1 290bp,其编码蛋白的氨基酸数为377～449,分子量最大为48.0kDa,最小为39.8kDa,等电点为5.26～8.76;根据系统发育树,将SbSAD基因家族分为3个亚族,其中亚族I在不同组织发育阶段表达量较高;11个SbSADs基因不均等地定位在高粱1、2、3、4、6、7和10号染色体上;SbSADs蛋白二级结构均以α-螺旋和无规则卷曲为主,三级结构预测显示,除SbSAD8外,其余SbSADs的蛋白三级结构高度相似;11个SbSADs基因的启动子区与低温胁迫相关的元件数量高度富集。SbSAD5基因在种子发育5和10d均有较高的表达量。 

【文章来源】：作物杂志. 2020,(02)北大核心

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

水稻、玉米、拟南芥和高粱SADs蛋白系统进化关系

另外，利用高粱不同发育阶段Sb SADs的表达情况来进一步表征Sb SADs系统进化关系。图2为Sb SAD6和Sb SAD9在高粱的不同发育阶段的表达情况；其中Sb SAD9在开花期和幼嫩期的表达量较高，Sb SAD6在成熟期比在开花期表达量高。结合系统进化树与不同组织部位发育阶段Sb SADs的表达情况进行分析，结果表明，亚族I基因在不同发育阶段均有表达（图2）。2.3 Sb SADs基因结构分析

利用GSDS(http：//gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php）在线软件分析SbSAD基因家族内含子和外显子的数目，结果如图3所示，在SbSAD基因家族中，Sb SAD8的外显子数最多，含有6个外显子；Sb SAD2、Sb SAD4和Sb SAD11均仅含有1个外显子；其他基因含有2～3个外显子。同时发现，Sb SAD6和Sb SAD9的基因结构高度相似，表明Sb SAD基因家族在每个亚族相对保守。2.4 SbSADs蛋白保守基序分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]高粱抗旱研究综述[J]. 张国琴,葛玉彬,张正英,贺春贵.  甘肃农业科技. 2018(06)
[2]甜高粱籽粒中脂肪酸含量的气相色谱分析[J]. 杨士春.  中国粮油学报. 2012(11)
[3]高粱中脂肪酸和低分子有机酸气相色谱测定[J]. 袁蕊,敖宗华,丁海龙,沈才洪,黄治国,任剑波,付勋.  酿酒. 2011(04)



本文编号：3393414