大豆蔓生性和株高QTL定位
发布时间：2021-09-11 20:36
野生大豆是拓宽栽培大豆遗传基础、提供优异基因的重要资源,但蔓生习性极大限制其在栽培大豆育种改良中的利用。不同遗传背景栽培大豆与野生大豆杂交后代蔓生性状分离各异,暗示着大豆蔓生性调控的复杂性。深入了解蔓生性的遗传规律有助于全面解析蔓生性状调控机理,为野生资源高效利用奠定基础。本研究以栽培大豆中黄39（ZH39）为母本,野生大豆ZYD2738和ZYD3687为父本分别构建分离群体,通过BSA法和遗传连锁图谱两种方法,发掘蔓生性与株高性状相关QTL位点。主要研究结果如下:1.利用ZH39×ZYD2738 F2群体中的极端个体分别构建直立和蔓生DNA池,用200 K SNP芯片检测DNA池,在第2、5、8、12、13、15、17和19染色体上,检测到8个可能与蔓生性状相关的染色体区间,利用这8个区间的60个SSR标记对F2群体进行基因分型,在第2、17和19号染色体检测到蔓生性QTL qVG-2、qVG-17和qVG-19。利用190个SSR标记构建F6群体遗传连锁图谱,在2、17和19染色体检测到3个蔓生性相关QTL,分别为q...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：55 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
亲本表型鉴定和各群体表型频数分布
中国农业科学院硕士学位论文第二章野生大豆ZYD2738蔓生性和株高QTL定位152.2.2基于BSA法进行QTL定位利用200KSNP芯片检测ZH39×ZYD2738F2群体直立DNA池1和蔓生DNA池2，结果显示在大豆2、5、8、12、13、15、17和19号染色体上检测DNA池间SNP分布存在显著差异的区间（图2-2）。利用分布在2、5、8、12、13、15、17和19号染色体60对多态性SSR标记检测ZH39×ZYD2738F2群体，结合2016年三亚田间表型，进行蔓生性和株高相关QTL定位，在2、17和19号染色体上共检测到6个QTL，而5、8、12、13和15号染色体上未检测到QTL。蔓生性定位结果显示，qVG-19的表型贡献率最大为19.30%，qVG-2和qVG-17贡献率较低，分别为6.79%和2.77%；qVG-2、qVG-19加性效应为负值，蔓生性增效基因来自父本ZYD2738，而qVG-17加性效应为正，蔓生性增效基因来自母本ZH39。株高定位结果显示，qPH-19的表型贡献率最大为25.44%，qPH-2和qPH-17贡献率较低，分别为5.09%和7.63%；qPH-2、qPH-19加性效应为负值，蔓生性增效基因来自父本ZYD2738，而qPH-17加性效应为正，蔓生性增效基因来自母本ZH39。6个QTL中，qVG-2、qVG-17、qVG-19分别与qPH-2、qPH-17、qPH-19定位区间完全一致，表明这三个位点能同时控制蔓生性和株高性状（表2-2）。图2-2利用BSA法鉴定蔓生连锁位点Fig.2-2IdentificationoflocuslinkedwithvininggrowthhabitbyusingBSAmethod
中国农业科学院硕士学位论文第二章野生大豆ZYD2738蔓生性和株高QTL定位17图2-3864对SSR标记在大豆染色体的分布Fig.2-3Distributionof864SSRmarkerson20soybeanchromosomes表2-2利用不同分离群体定位到QTLTable2-2SummaryofQTLsdetectedindifferentpopulations群体Population性状（年份）Traits（Year）QTL标记区间Markerinterval区间大小Intervalsize(Mb)LODPVE(%)ADDF2VG(2016)qVG-2ssr_02_13-ssr_02_161.86.346.79-1.12qVG-17ssr_17_09-ssr_02_131.63.362.770.55qVG-19ssr_19_09-ssr_19_111.620.3719.30-1.89PH(2016)qPH-2ssr_02_13-ssr_02_161.86.875.09-5.05qPH-17ssr_17_09-ssr_02_131.610.567.635.05qPH-19ssr_19_09-ssr_19_111.629.6425.44-11.27F6VG(2017)qVG-2ssr_02_14-ssr_02_150.24.477.91-0.82qVG-17ssr_17_09-ssr_17_100.13.936.690.78qVG-19ssr_19_09-ssr_19_100.27.7915.10-1.18PH(2017)qPH-2ssr_02_12-ssr_02_130.23.585.24-3.51qPH-17ssr_17_09-ssr_17_100.17.1610.905.14qPH-19ssr_19_09-ssr_19_111.610.0016.97-6.52F6VG(2018)qVG-2ssr_02_14-ssr_02_150.25.6810.11-1.52qVG-17ssr_17_10-ssr_17_110.12.604.360.96qVG-19ssr_19_09-ssr_19_100.28.7715.28-1.94PH(2018)qPH-2ssr_02_12-ssr_02_130.24.155.60-3.67qPH-17ssr_17_10-ssr_17_110.15.497.174.24qPH-19ssr_19_09-ssr_19_100.214.0721.81-7.56
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物关联分析应用研究进展[J]. 岳庆春,傅迦得,章辰飞,吴月燕. 江苏农业科学. 2019(18)
[2]全基因组关联分析在作物育种研究中的应用[J]. 曹英杰,杨剑飞,王宇. 核农学报. 2019(08)
[3]野生大豆利用价值的研究进展[J]. 王付娟,刘书含,李娟,周强. 信阳农林学院学报. 2019(02)
[4]野生大豆PI342618B蔓生性QTL定位研究[J]. 刘莉,邢光南,栗旭亮,许志永,孔杰杰,盖钧镒,赵团结. 大豆科学. 2015(06)
[5]基于基因组学的作物种质资源研究:现状与展望[J]. 黎裕,李英慧,杨庆文,张锦鹏,张金梅,邱丽娟,王天宇. 中国农业科学. 2015(17)
[6]大豆种质资源遗传多样性研究进展[J]. 何真,韵晓东,武凯,姬虎太,常建忠,乔麟轶,郑军. 生物技术进展. 2015(02)
[7]全基因组关联分析在植物中的应用[J]. 涂雨辰,田云,卢向阳. 化学与生物工程. 2013(06)
[8]野生大豆在大豆育种中的应用[J]. 马晓萍,杨光宇,杨振宇,王洋,陈健. 作物研究. 2009(01)
[9]野生大豆、黑豆和大豆的异黄酮类成分比较[J]. 周三,关崎春雄,岳旺,泽聪子,杨志宏. 大豆科学. 2008(02)
[10]中国野生大豆的遗传多样性和生态特异性分析[J]. 丁艳来,赵团结,盖钧镒. 生物多样性. 2008(02)
硕士论文
[1]小麦骨干亲本周8425B白粉病成株抗性QTL定位[D]. 贾奥琳.中国农业科学院 2018
本文编号：3393678
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：55 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
亲本表型鉴定和各群体表型频数分布
中国农业科学院硕士学位论文第二章野生大豆ZYD2738蔓生性和株高QTL定位152.2.2基于BSA法进行QTL定位利用200KSNP芯片检测ZH39×ZYD2738F2群体直立DNA池1和蔓生DNA池2，结果显示在大豆2、5、8、12、13、15、17和19号染色体上检测DNA池间SNP分布存在显著差异的区间（图2-2）。利用分布在2、5、8、12、13、15、17和19号染色体60对多态性SSR标记检测ZH39×ZYD2738F2群体，结合2016年三亚田间表型，进行蔓生性和株高相关QTL定位，在2、17和19号染色体上共检测到6个QTL，而5、8、12、13和15号染色体上未检测到QTL。蔓生性定位结果显示，qVG-19的表型贡献率最大为19.30%，qVG-2和qVG-17贡献率较低，分别为6.79%和2.77%；qVG-2、qVG-19加性效应为负值，蔓生性增效基因来自父本ZYD2738，而qVG-17加性效应为正，蔓生性增效基因来自母本ZH39。株高定位结果显示，qPH-19的表型贡献率最大为25.44%，qPH-2和qPH-17贡献率较低，分别为5.09%和7.63%；qPH-2、qPH-19加性效应为负值，蔓生性增效基因来自父本ZYD2738，而qPH-17加性效应为正，蔓生性增效基因来自母本ZH39。6个QTL中，qVG-2、qVG-17、qVG-19分别与qPH-2、qPH-17、qPH-19定位区间完全一致，表明这三个位点能同时控制蔓生性和株高性状（表2-2）。图2-2利用BSA法鉴定蔓生连锁位点Fig.2-2IdentificationoflocuslinkedwithvininggrowthhabitbyusingBSAmethod
中国农业科学院硕士学位论文第二章野生大豆ZYD2738蔓生性和株高QTL定位17图2-3864对SSR标记在大豆染色体的分布Fig.2-3Distributionof864SSRmarkerson20soybeanchromosomes表2-2利用不同分离群体定位到QTLTable2-2SummaryofQTLsdetectedindifferentpopulations群体Population性状（年份）Traits（Year）QTL标记区间Markerinterval区间大小Intervalsize(Mb)LODPVE(%)ADDF2VG(2016)qVG-2ssr_02_13-ssr_02_161.86.346.79-1.12qVG-17ssr_17_09-ssr_02_131.63.362.770.55qVG-19ssr_19_09-ssr_19_111.620.3719.30-1.89PH(2016)qPH-2ssr_02_13-ssr_02_161.86.875.09-5.05qPH-17ssr_17_09-ssr_02_131.610.567.635.05qPH-19ssr_19_09-ssr_19_111.629.6425.44-11.27F6VG(2017)qVG-2ssr_02_14-ssr_02_150.24.477.91-0.82qVG-17ssr_17_09-ssr_17_100.13.936.690.78qVG-19ssr_19_09-ssr_19_100.27.7915.10-1.18PH(2017)qPH-2ssr_02_12-ssr_02_130.23.585.24-3.51qPH-17ssr_17_09-ssr_17_100.17.1610.905.14qPH-19ssr_19_09-ssr_19_111.610.0016.97-6.52F6VG(2018)qVG-2ssr_02_14-ssr_02_150.25.6810.11-1.52qVG-17ssr_17_10-ssr_17_110.12.604.360.96qVG-19ssr_19_09-ssr_19_100.28.7715.28-1.94PH(2018)qPH-2ssr_02_12-ssr_02_130.24.155.60-3.67qPH-17ssr_17_10-ssr_17_110.15.497.174.24qPH-19ssr_19_09-ssr_19_100.214.0721.81-7.56
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物关联分析应用研究进展[J]. 岳庆春,傅迦得,章辰飞,吴月燕. 江苏农业科学. 2019(18)
[2]全基因组关联分析在作物育种研究中的应用[J]. 曹英杰,杨剑飞,王宇. 核农学报. 2019(08)
[3]野生大豆利用价值的研究进展[J]. 王付娟,刘书含,李娟,周强. 信阳农林学院学报. 2019(02)
[4]野生大豆PI342618B蔓生性QTL定位研究[J]. 刘莉,邢光南,栗旭亮,许志永,孔杰杰,盖钧镒,赵团结. 大豆科学. 2015(06)
[5]基于基因组学的作物种质资源研究:现状与展望[J]. 黎裕,李英慧,杨庆文,张锦鹏,张金梅,邱丽娟,王天宇. 中国农业科学. 2015(17)
[6]大豆种质资源遗传多样性研究进展[J]. 何真,韵晓东,武凯,姬虎太,常建忠,乔麟轶,郑军. 生物技术进展. 2015(02)
[7]全基因组关联分析在植物中的应用[J]. 涂雨辰,田云,卢向阳. 化学与生物工程. 2013(06)
[8]野生大豆在大豆育种中的应用[J]. 马晓萍,杨光宇,杨振宇,王洋,陈健. 作物研究. 2009(01)
[9]野生大豆、黑豆和大豆的异黄酮类成分比较[J]. 周三,关崎春雄,岳旺,泽聪子,杨志宏. 大豆科学. 2008(02)
[10]中国野生大豆的遗传多样性和生态特异性分析[J]. 丁艳来,赵团结,盖钧镒. 生物多样性. 2008(02)
硕士论文
[1]小麦骨干亲本周8425B白粉病成株抗性QTL定位[D]. 贾奥琳.中国农业科学院 2018
本文编号：3393678
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3393678.html
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