四倍体冰草超高密度分子遗传连锁图谱构建及产量与蛋白质含量等品质性状的QTL定位

发布时间：2021-09-17 10:19

　　四倍体杂交冰草是二倍体的蒙古冰草与航道冰草经种间杂交、染色体加倍获得的优良饲草,结合了蒙古冰草抗旱耐寒、适应性强、耐贫瘠与航道冰草分蘖性强、叶量大、营养价值较高等优点,具有很强的杂种优势。本试验以四倍体杂交冰草F₂群体的246个分离单株及其亲本为材料,结合SRAP、SSR和SNP三种分子标记,利用Join Map 4.0作图软件构建了四倍体冰草超高密度的分子遗传连锁图谱,并对单株产量、茎叶比、粗蛋白质含量等11个性状进行QTL定位分析,以期为下一步深入开展冰草产量、品质等重要相关性状的基因克隆与功能分析、QTL精细定位及分子标记辅助育种等提供理论依据。本研究主要结果如下:1.筛选出42对适宜引物（SRAP引物32对、SSR引物10对）。利用这些引物对四倍体杂交冰草246个F₂群体单株及其双亲的基因组DNA进行PCR扩增,共获得多态性标记位点997个,其中含SRAP标记753个、SSR标记244个,其多态性位点比率分别为88.8%和92.4%。2.基于简化基因组测序（GBS）技术,共得到上图SNP标记5035个。3.偏分离分析结果表明,在603... 

【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】：120 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略语表
1 前言
    1.1 冰草概述
    1.2 冰草属植物育种研究
    1.3 冰草的主要营养成分
    1.4 遗传标记的发展及其在冰草上的应用
        1.4.1 遗传标记
        1.4.2 DNA分子标记的发展及在牧草上的应用
    1.5 分子遗传连锁图谱
        1.5.1 分子遗传图谱构建的主要步骤
        1.5.2 亲本选配
        1.5.3 作图群体类型
        1.5.4 群体大小
        1.5.5 牧草分子遗传连锁图谱构建的研究
    1.6 QTL定位研究
        1.6.1 QTL定位常用软件选择
        1.6.2 QTL定位的分析方法
        1.6.3 QTL定位与比较基因组学
        1.6.4 QTL定位与MAS育种
        1.6.5 QTL定位与基因图位克隆
        1.6.6 牧草重要性状QTL的定位研究
    1.7 本研究目的及意义
    1.8 主要研究内容及技术路线
        1.8.1 主要内容
        1.8.2 技术路线
2 四倍体杂交冰草超高密度分子遗传图谱构建
    2.1 试验地概况
    2.2 供试材料及其田间管理
    2.3 试验方法
        2.3.1 DNA提取与检测
        2.3.2 SRAP分析
        2.3.3 SSR分析
        2.3.4 SRAP及SSR标记的数据统计与分析处理
        2.3.5 SNP分析
        2.3.6 四倍体冰草分子遗传连锁图谱的构建
    2.4 结果与分析
        2.4.1 供试材料的基因组DNA纯度检测
        2.4.2 SRAP适宜引物的筛选及多态性分析
        2.4.3 SSR标记的引物筛选及其多态性分析
        2.4.4 SNP标记分析
        2.4.5 偏分离分析
        2.4.6 四倍体杂交冰草的超高密度遗传图谱构建及其重要特征
    2.5 讨论
        2.5.1 GBS与SNP标记的开发
        2.5.2 多种分子标记技术的应用与图谱构建
    2.6 小结
3 冰草产量及其蛋白质含量等11个重要性状的QTL定位分析
    3.1 材料与方法
        3.1.1 试验材料
        3.1.2 重要性状测定
        3.1.3 各性状的表型分析及其QTL定位
    3.2 结果与分析
        3.2.1 四倍体杂交冰草F_2群体产量和蛋白质含量等性状的相关性分析
        3.2.2 四倍体杂交冰草F_2群体各性状的测定值分析及其正态性检验
        3.2.3 四倍体冰草重要性状的QTL定位分析
    3.3 讨论
        3.3.1 QTLs的稳定性
        3.3.2 稳定QTLs的成簇分布与性状表型的相关性
    3.4 小结
4 结论与主要创新点
    4.1 结论
    4.2 主要创新点
致谢
参考文献
附表
附图
作者简介


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于SNP遗传图谱对甘蓝型油菜部分脂肪酸组成性状的QTL定位[J]. 叶桑,崔翠,郜欢欢,雷维,王刘艳,王瑞莉,陈柳依,曲存民,唐章林,李加纳,周清元.  中国农业科学. 2019(21)
[2]小麦遗传改良中的重要基因源——冰草[J]. 韩冉,刁瑞宁,梁海凡,訾妍,汪晓璐.  山东农业科学. 2019(08)
[3]蒙古冰草SSR遗传完整性分析中适宜样本量及标记数量筛选[J]. 迟恩惠,李俊,李鸿雁,黄帆,米福贵.  中国草地学报. 2019(04)
[4]SSR分子标记的研究进展[J]. 杨梦婷,黄洲,干建平,徐君驰,庞基良.  杭州师范大学学报(自然科学版). 2019(04)
[5]冰草蛋白质含量等4个重要性状的QTL定位研究[J]. 杨东升,于卓,于肖夏,李佳奇,吴国芳,牛亚青青.  麦类作物学报. 2019(07)
[6]利用CRISPR/Cas9技术对蒙古冰草落粒相关基因Sh1的编辑[J]. 张文静,融晓萍,田青松,李婷婷,武志娟,刘慧艳,韩冰.  分子植物育种. 2019(15)
[7]冰草种质资源的评价与利用[J]. 富海江,米褔贵,王晓龙.  草原与草业. 2018(04)
[8]鸭茅的分子育种[J]. 唐露,张新全,黄琳凯,张旭,赵欣欣,聂刚,许蕾.  草业科学. 2018(09)
[9]小麦—冰草T7PL·7AL罗伯逊易位系的分子细胞学鉴定[J]. 孙洋洋,陈红新,刘伟华,韩海明,周升辉,杨欣明,李秀全,张锦鹏,李立会.  植物遗传资源学报. 2018(06)
[10]蒙古冰草MYB转录因子基因的序列分析[J]. 马艳红,刘旭婷,张旭婷,高慧,张海霞.  基因组学与应用生物学. 2019(05)

博士论文
[1]高丹草高密度遗传连锁图谱构建及氢氰酸含量等性状的QTL定位[D]. 石悦.内蒙古农业大学 2018
[2]四倍体杂交冰草高密度分子遗传图谱构建及重要农艺性状QTL定位[D]. 姜志艳.内蒙古农业大学 2015
[3]鸭茅分子遗传连锁图谱构建及开花基因定位[D]. 谢文刚.四川农业大学 2013
[4]小麦遗传连锁图谱构建及主要农艺和品质性状QTL定位[D]. 王霖.山东农业大学 2012
[5]小麦主要产量和品质性状的QTL鉴定及ZDS功能标记的开发[D]. 张彩英.河北农业大学 2010
[6]冰草属和鹅观草属部分植物种质资源遗传分析[D]. 闫伟红.中国农业科学院 2010
[7]几种披碱草种间杂种F1遗传特性及冰草分子图谱构建研究[D]. 李小雷.内蒙古农业大学 2008
[8]高丹草遗传图谱构建及重要农艺性状的基因定位研究[D]. 逯晓萍.内蒙古农业大学 2005

硕士论文
[1]冰草主要农艺性状的QTL定位及动态遗传分析[D]. 宋楠.河北科技师范学院 2019
[2]柱花草遗传图谱构建和重要性状的QTL定位[D]. 丁泽婷.海南大学 2017
[3]新疆杂草黑麦遗传多样性分析[D]. 代明.河北科技师范学院 2014
[4]9个居群蒙古冰草染色体倍性检测及遗传多样性SSR分析[D]. 高友汉.内蒙古农业大学 2013
[5]利用DH和IF2两群体进行小麦主要农艺和品质性状的QTL分析[D]. 李文福.山东农业大学 2012
[6]四倍体杂交冰草新品系农艺及分子细胞遗传学特性的研究[D]. 苏和.内蒙古农业大学 2012
[7]根茎冰草新品系生物学性状的研究[D]. 徐娜.内蒙古农业大学 2011
[8]基于连锁图的QTL综合分析方法研究[D]. 匡峰磊.南京农业大学 2009
[9]扁穗冰草种质材料研究与株系筛选[D]. 温超.内蒙古农业大学 2008
[10]冰草生态生物学及细胞学初步研究[D]. 高海娟.内蒙古农业大学 2007



本文编号：3398521