蓖麻胚与胚愈伤基因组甲基化的变化及和差异表达基因的关联分析

发布时间：2021-09-22 11:59

　　DNA甲基化是一种重要的表观修饰,有一定的保守性。在植物中,DNA甲基化能够稳定地遗传,同时也有组织特异性以及发育阶段特异性。相关研究发现,植物细胞在不同组织分化后基因组DNA甲基化经常会发生一定变化。然而,植物细胞在分化或脱分化过程中基因组DNA甲基化的变化规律及其对基因表达影响等方面的研究非常有限,而且不同植物基因组DNA甲基化的式样有一定的物种特异性,这些物种特异性在细胞分化或脱分化过程中对基因表达是否有影响一直缺乏关注。本实验以典型的油料种子植物蓖麻为实验材料,以胚和胚诱导愈伤为材料进行转录组全基因组DNA甲基化的高通量测序,以期探索蓖麻组培过程中DNA甲基化的改变模式,及其对基因表达的调控。这不但增加了对不同植物组织DNA甲基化发生的多样性认识,而且对理解DNA甲基化产生的生物学功能具有重要的参考意义。主要研究结果如下:1为了获得蓖麻胚愈伤组织,我们首先优化蓖麻胚愈伤组织的培养体系,设置不同浓度梯度的萘乙酸（1-Naphthaleneaceticacid,NAA）和噻重氮苯基脲（Thidiazuron,TDZ）,蓖麻胚愈伤诱导结果表明当6-苄氨基腺嗓（6-Benzylamin... 

【文章来源】：云南大学云南省 211工程院校

【文章页数】：57 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１－１植物基因组ＤＮＡ甲基化的维持［６］??Ｆｉｇｕｒｅ?１－１?Ｍａｉｎｔｅｎａｎｃｅ?ｏｆ?ｐｌａｎｔ?ｇｎｏｍｉｃ?ＤＮＡ?ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ??１．３植物去甲基化调控机制??

Ｉ?Ｉ?＾?Ｉ?ＩＩ?Ｉ?Ｉ?Ｉ?〇Ｈ??ＣＭ?ｉ?ｉ?９?ｉ?ｉ?ｉ?ｉ?ｉ?ｉ??图１－２植物中ＢＥＲ介导的主动ＤＮＡ去甲基化??Ｆｉｇ．?１－２?Ｂａｓｅ?ｅｘｃｉｓｉｏｎ?ｒｅｐａｉｒ?（ＢＥＲ）－ｍｅｄｉａｔｅｄ?ａｃｔｉｖｅ?ＤＮＡ?ｄｅｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ?ｉｎ?ｐｌａｎｔｓ．??目前认为，被动和主动去甲基化途径共同作用。首先，相比全甲基化ＤＮＡ，?＿??在半甲基化ＤＮＡ上更活跃；其次，半甲基化ＤＮＡ的富集降低不利于ＤＳＢｓ（ｄｏｕｂｌｅ?ｓｔｒａｎｄ??ｂｒｅａｋｓ）发生，推测是由ＤＭＥ在对称情况下移除胞嘧啶甲基化导致的［２６］。确实，ＤＭＥ??虽能降低ＤＳＢｓ的产生，但在脱碱基位点去除甲基化的胞嘧啶的效率并不高ｔ２２］。最后，??除了有降低和ＤＳＢｓ工作效率风险，ＭＥＴ１的下调或许也能导致ＤＮＡ单链上由??ＤＭＥ活性作用所产生的半甲基化ＣＧ位点不能有效地被修复成全甲基化，而这可通过??４??

果和分析??组织的获得??验选６－ＢＡ为细胞分裂素，设置０．１?ｍｇ／Ｌ－０．５?ｍｇ／Ｌ多浓度梯度的ＮＡＡ和的胚愈伤组织的诱导情况。在诱导过程中，在同种条件下，ＮＡＡ诱导－Ｄ。因此本试验中选取ＮＡＡ作为愈伤组织形成诱导形成的最佳生长素，升，愈伤组织诱导率呈现出先升后降规律。当６－ＢＡ２ｍｇ／Ｌ和ＮＡＡ０．３?ｍｇ／伤长势最佳（表３－１）。在最佳激素配比下，愈伤组织大量产生，愈伤率１７??

【参考文献】：
期刊论文
[1]蓖麻GATA基因家族的鉴定和特征分析[J]. 敖涛,廖晓佳,徐伟,刘爱忠.  植物分类与资源学报. 2015(04)
[2]植物DNA甲基化与体细胞无性系变异的研究进展[J]. 陈强,毕晓华,徐昕,陶思源,李雪梅.  贵州农业科学. 2011(11)
[3]DNA甲基化在动植物遗传育种中的研究进展[J]. 徐青,余云舟,赵萌,孙东晓.  生物技术通讯. 2011(01)
[4]沙棘苗木繁殖技术研究综述与展望[J]. 刘丽颖.  国际沙棘研究与开发. 2006(02)

博士论文
[1]丹参全基因组DNA甲基化谱及DNA甲基转移酶与去甲基化酶基因的系统分析[D]. 李江.北京协和医学院 2018
[2]蓖麻胚乳表观调控与基因组印迹研究[D]. 徐伟.云南大学 2016

硕士论文
[1]玉米体细胞胚胎发生的转录组分析及相关基因克隆[D]. 丁美琪.吉林大学 2017



本文编号：3403724