沙生牧草沙鞭的遗传多样性研究
发布时间：2021-09-27 21:24
沙鞭（Psammochloa villosa（Trin.）Bor）是禾本科（Gramineae）、沙鞭属（Psammochloa）一种多年生草本植物,主要依靠根状茎繁殖,具有较强的耐旱、耐寒、耐碱以及抗风沙能力,是极端沙地环境下分布的关键或唯一草本物种。它不仅具有重要的生态价值,而且也是重要的优势牧草,同时也是野生牧草利用、极端环境植物基因资源最具潜在价值的研究对象之一。据此,本研究在全面野外调查基础上,综合利用表型性状和DNA分子标记对沙生牧草沙鞭的遗传多样性及其分布格局进行研究,旨在为沙鞭种质资源的保护和利用提供科学依据。主要研究结果如下:1.通过对沙鞭的表型多样性研究,发现沙鞭具有丰富的表型多样性,居群间变异大于居群内变异。其中,旗叶长宽比变异系数最大,为32.44%,株系相关性状变异系数在20%左右;各表型性状间的相关系数范围为0.0020.875,株系相关性状（如株高、花序长度、小穗长度等）间差异极显著;主成分累计贡献率达73.447%,其中主成分1和4主要反映生殖器官性状,而主成分2和3主要反映营养器官性状;依据欧式距离对参试居群进行的聚类分析,结果表...
【文章来源】：青海师范大学青海省
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
沙鞭种质资源采集地理分布图
表 3-2 ITS 片段 PCR 扩增反应体系和扩增程序（25 μL 体系）Table 3-2 Reaction system and amplification procedure of ITS fragment (25 μL)反应体系Reaction system扩增程序Amplification procedureddH2O 17.25 μL 94℃ 5 min×PCR buffer 2.5 μL 94℃50 s4×dNTP 2 μL 54.6℃ 1 minPrimer-F 1 μL 72℃ 1 minPrimer-R 1 μL 72℃ 10 minTaq 酶 0.25 μL 4℃ endDNA 模板 1 μLPCR 扩增反应结束后，取 2 μL 扩增产物用 1.0%琼脂糖凝胶电泳检测后，提 DNA 的片段长度和 DNA 降解情况，然后用紫外凝胶成像系统观察并拍照 3-1）。最后将剩余的 PCR 产物送至北京华大基因测序有限公司进行常规测测序结果如图 3-2 所示。36 c
图 3-2 沙鞭 ITS 片段部分测序峰形图谱Fig.3-2 The partial sequence picture of ITS fragment of P. villosa 结果和分析.1 ITS 序列的多态性分析本研究用沙鞭叶片提取基因组 DNA，通过优化后的 PCR 反应体系，对 10鞭居群进行扩增，琼脂糖凝胶电泳后发现在 ITS 引物条件下，其所有个体均定扩增，片段长度介于750 bp ~1000 bp，共获得608个个体的沙鞭ITS序列，软件 MEGA6 对测序数据进行峰图比对校正，将两端切平后，片段总长为 bp。该区段的平均碱基含量，C>G>A>T，其 G+C 含量约为 62.7%，其中四基中 C 的平均含量最高，为 32.9%；而碱基 T 的平均含量最低，为 17.5%变异大部分在 A 与 G、T 与 C 之间，占总变异位点的 74.81%，故 nrITS 序变异大部分为转换（Transition），少数为颠换（Transversion）。详细信息如
【参考文献】：
期刊论文
[1]黄草乌与展毛黄草乌叶绿体全基因组结构的比较分析[J]. 李雪佩,孟静,张琳娜,何俊. 中药材. 2018(08)
[2]青藏高原特有种—藏扇穗茅叶绿体基因组测序及序列分析[J]. 刘玉萍,吕婷,朱迪,周勇辉,刘涛,苏旭. 植物研究. 2018(04)
[3]锁阳ITS序列遗传多样性分析[J]. 任梦云,杜乐山,陈彦君,张盾,沈奇,关潇,张银东. 植物学报. 2018(03)
[4]基于ITS序列的灵芝遗传多样性与群体遗传分化研究[J]. 刘雪莹,韩玉立,司静,李春道,崔宝凯. 菌物学报. 2018(05)
[5]基于AFLP的茶花种质资源遗传多样性研究[J]. 杨旭,吴德智,袁伟,胡孝枝. 江苏农业科学. 2018(03)
[6]基于ISSR标记的江西野生寒兰居群遗传多样性研究[J]. 江亚雯,孙小琴,罗火林,杨柏云,熊冬金. 园艺学报. 2017(10)
[7]柱花草种质资源表型性状的多样性分析[J]. 蒋亚君,申晴,丁西朋,严琳玲,刘国道,白昌军. 草业科学. 2017(05)
[8]贵州芝麻种质资源主要表型性状的遗传多样性[J]. 魏忠芬,杨胜先,李振动,李慧琳,奉斌,林涛. 贵州农业科学. 2016(11)
[9]苦玄参40个株系表型性状遗传多样性分析[J]. 谢阳姣,何志鹏,闫国跃,李耀燕,符标芳,白燕远,冯秋瑜. 广西植物. 2017(03)
[10]我国北方9份旱生—沙生植物蒙古冰草遗传多样性研究[J]. 李晓全,高有汉,刘扬,索培芬,韩冰. 草业学报. 2016(03)
博士论文
[1]青藏高原特有属固沙草属的物种界定与遗传多样性研究[D]. 刘玉萍.陕西师范大学 2015
[2]中型狼尾草种质特性及遗传多样性研究[D]. 张怀山.甘肃农业大学 2014
[3]玉米单向异交不亲和基因Ga1的遗传分析及精细定位[D]. 刘旭.山东农业大学 2013
[4]西藏圆柏复合体的群体遗传学与物种形成研究[D]. 李忠虎.兰州大学 2010
[5]厚朴遗传多样性研究及指纹图谱的构建[D]. 郑志雷.福建农林大学 2010
[6]沙芥属植物遗传多样性及其亲缘关系研究[D]. 张凤兰.内蒙古农业大学 2009
[7]用形态标记和分子标记研究蜡梅栽培种质的遗传多样性[D]. 赵凯歌.华中农业大学 2007
[8]披碱草属植物遗传多样性研究[D]. 严学兵.中国农业大学 2005
硕士论文
[1]羊草叶绿体全基因组分析及分子标记开发[D]. 杨艳婷.扬州大学 2018
[2]内蒙古入侵植物光梗蒺藜草遗传多样性与分子系统地理学研究[D]. 杨新英.内蒙古农业大学 2018
[3]青藏高原高寒草甸钝裂银莲花居群遗传多样性及其与生态因子的相关研究[D]. 刘志鹏.兰州理工大学 2017
[4]基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒兰群体遗传结构及遗传多样性研究[D]. 江亚雯.南昌大学 2017
[5]沙生植物大赖草种质资源遗传结构及克隆多样性的研究[D]. 蔡小霞.新疆农业大学 2016
[6]中国樱桃地方种质表型性状遗传多样性分析[D]. 刘胤.四川农业大学 2016
[7]竹节草种资源遗传多样性研究及抗性评价[D]. 张欣怡.海南大学 2016
[8]缙云黄芩（Scutellaria tsinyunensis C.Y.Wu et S.Chow）及近缘种基于ITS和cpDNA序列的遗传多样性研究[D]. 徐梦平.西南大学 2016
[9]基于ITS序列的栽培中国樱桃遗传多样性及其群体遗传结构分析[D]. 何文.四川农业大学 2014
[10]沙漠超旱生植物红砂的遗传多样性分析[D]. 苏愿.电子科技大学 2013
本文编号：3410640
【文章来源】：青海师范大学青海省
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
沙鞭种质资源采集地理分布图
表 3-2 ITS 片段 PCR 扩增反应体系和扩增程序（25 μL 体系）Table 3-2 Reaction system and amplification procedure of ITS fragment (25 μL)反应体系Reaction system扩增程序Amplification procedureddH2O 17.25 μL 94℃ 5 min×PCR buffer 2.5 μL 94℃50 s4×dNTP 2 μL 54.6℃ 1 minPrimer-F 1 μL 72℃ 1 minPrimer-R 1 μL 72℃ 10 minTaq 酶 0.25 μL 4℃ endDNA 模板 1 μLPCR 扩增反应结束后，取 2 μL 扩增产物用 1.0%琼脂糖凝胶电泳检测后，提 DNA 的片段长度和 DNA 降解情况，然后用紫外凝胶成像系统观察并拍照 3-1）。最后将剩余的 PCR 产物送至北京华大基因测序有限公司进行常规测测序结果如图 3-2 所示。36 c
图 3-2 沙鞭 ITS 片段部分测序峰形图谱Fig.3-2 The partial sequence picture of ITS fragment of P. villosa 结果和分析.1 ITS 序列的多态性分析本研究用沙鞭叶片提取基因组 DNA，通过优化后的 PCR 反应体系，对 10鞭居群进行扩增，琼脂糖凝胶电泳后发现在 ITS 引物条件下，其所有个体均定扩增，片段长度介于750 bp ~1000 bp，共获得608个个体的沙鞭ITS序列，软件 MEGA6 对测序数据进行峰图比对校正，将两端切平后，片段总长为 bp。该区段的平均碱基含量，C>G>A>T，其 G+C 含量约为 62.7%，其中四基中 C 的平均含量最高，为 32.9%；而碱基 T 的平均含量最低，为 17.5%变异大部分在 A 与 G、T 与 C 之间，占总变异位点的 74.81%，故 nrITS 序变异大部分为转换（Transition），少数为颠换（Transversion）。详细信息如
【参考文献】：
期刊论文
[1]黄草乌与展毛黄草乌叶绿体全基因组结构的比较分析[J]. 李雪佩,孟静,张琳娜,何俊. 中药材. 2018(08)
[2]青藏高原特有种—藏扇穗茅叶绿体基因组测序及序列分析[J]. 刘玉萍,吕婷,朱迪,周勇辉,刘涛,苏旭. 植物研究. 2018(04)
[3]锁阳ITS序列遗传多样性分析[J]. 任梦云,杜乐山,陈彦君,张盾,沈奇,关潇,张银东. 植物学报. 2018(03)
[4]基于ITS序列的灵芝遗传多样性与群体遗传分化研究[J]. 刘雪莹,韩玉立,司静,李春道,崔宝凯. 菌物学报. 2018(05)
[5]基于AFLP的茶花种质资源遗传多样性研究[J]. 杨旭,吴德智,袁伟,胡孝枝. 江苏农业科学. 2018(03)
[6]基于ISSR标记的江西野生寒兰居群遗传多样性研究[J]. 江亚雯,孙小琴,罗火林,杨柏云,熊冬金. 园艺学报. 2017(10)
[7]柱花草种质资源表型性状的多样性分析[J]. 蒋亚君,申晴,丁西朋,严琳玲,刘国道,白昌军. 草业科学. 2017(05)
[8]贵州芝麻种质资源主要表型性状的遗传多样性[J]. 魏忠芬,杨胜先,李振动,李慧琳,奉斌,林涛. 贵州农业科学. 2016(11)
[9]苦玄参40个株系表型性状遗传多样性分析[J]. 谢阳姣,何志鹏,闫国跃,李耀燕,符标芳,白燕远,冯秋瑜. 广西植物. 2017(03)
[10]我国北方9份旱生—沙生植物蒙古冰草遗传多样性研究[J]. 李晓全,高有汉,刘扬,索培芬,韩冰. 草业学报. 2016(03)
博士论文
[1]青藏高原特有属固沙草属的物种界定与遗传多样性研究[D]. 刘玉萍.陕西师范大学 2015
[2]中型狼尾草种质特性及遗传多样性研究[D]. 张怀山.甘肃农业大学 2014
[3]玉米单向异交不亲和基因Ga1的遗传分析及精细定位[D]. 刘旭.山东农业大学 2013
[4]西藏圆柏复合体的群体遗传学与物种形成研究[D]. 李忠虎.兰州大学 2010
[5]厚朴遗传多样性研究及指纹图谱的构建[D]. 郑志雷.福建农林大学 2010
[6]沙芥属植物遗传多样性及其亲缘关系研究[D]. 张凤兰.内蒙古农业大学 2009
[7]用形态标记和分子标记研究蜡梅栽培种质的遗传多样性[D]. 赵凯歌.华中农业大学 2007
[8]披碱草属植物遗传多样性研究[D]. 严学兵.中国农业大学 2005
硕士论文
[1]羊草叶绿体全基因组分析及分子标记开发[D]. 杨艳婷.扬州大学 2018
[2]内蒙古入侵植物光梗蒺藜草遗传多样性与分子系统地理学研究[D]. 杨新英.内蒙古农业大学 2018
[3]青藏高原高寒草甸钝裂银莲花居群遗传多样性及其与生态因子的相关研究[D]. 刘志鹏.兰州理工大学 2017
[4]基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒兰群体遗传结构及遗传多样性研究[D]. 江亚雯.南昌大学 2017
[5]沙生植物大赖草种质资源遗传结构及克隆多样性的研究[D]. 蔡小霞.新疆农业大学 2016
[6]中国樱桃地方种质表型性状遗传多样性分析[D]. 刘胤.四川农业大学 2016
[7]竹节草种资源遗传多样性研究及抗性评价[D]. 张欣怡.海南大学 2016
[8]缙云黄芩（Scutellaria tsinyunensis C.Y.Wu et S.Chow）及近缘种基于ITS和cpDNA序列的遗传多样性研究[D]. 徐梦平.西南大学 2016
[9]基于ITS序列的栽培中国樱桃遗传多样性及其群体遗传结构分析[D]. 何文.四川农业大学 2014
[10]沙漠超旱生植物红砂的遗传多样性分析[D]. 苏愿.电子科技大学 2013
本文编号：3410640
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3410640.html
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