水稻苗期耐冷性状的全基因组关联分析及主效QTL的精细定位与应用

发布时间：2021-09-30 16:58

　　植物在生长过程中会遇到各种变化的环境条件。其中,低温胁迫是影响作物生长、产量和限制作物地理分布的主要逆境环境因素之一。水稻是世界上最主要的粮食作物之一,世界上一半人口以大米为主食。水稻起源于热带和亚热带地区,相对于大麦、小麦等其它农作物,水稻对低温胁迫更为敏感,高纬度和高海拔地区的水稻也更容易遭受冷害的影响。即使在温度适宜区种植水稻,连续数天的低温也会对水稻的生长和产量造成重要影响。因此,发掘重要的水稻耐冷资源,并剖析其耐冷机制,有利于指导水稻耐冷分子设计育种。本研究利用全基因组关联分析方法,鉴定到一个主效的苗期耐冷QTL,并利用图位克隆方法对qCT11进行精细定位。主要结果如下:1.鉴定了550份来自53个国家的水稻种质苗期的耐冷性。结果表明大多数籼稻品种不耐冷,粳稻品种较耐冷。也发现了部分极耐冷的籼稻种质和极不耐冷的粳稻种质。水稻种质的耐冷性为育种等研究提供重要参考依据。2.过滤后用于GWAS分析的SNPs共有20,000个。SNP间距平均为18.6 kb,远远小于水稻的LD衰退值。利用Kinship计算的亲缘关系值表明,550份水稻种质中绝大多数种质的亲缘关系较远。群体结构对GW... 

【文章来源】：中国农业科学院北京市

【文章页数】：83 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

007-2016年中国农作物总成灾面积变化

中国农业科学院博士学位论文 第一章 引言化氢的清除能力，使幼穗免受脂质过氧化伤害，从而提高低温胁迫下小穗育性(Ns et al., 2003, Luet al., 2007, Sato et al., 2011, Garighan et al., 2014)。代谢组学和转录组学研究表明，活性氧信号途径应答是决定粳稻较强低温耐受性的关键，水稻在低温逆境下主要应答是抗氧化代谢响应(Zhanget al., 2016)。

科学院博士学位论文 第二章 水稻苗期耐冷性第二章 水稻苗期耐冷性状的全基因组材料与方法验材料用到的 550 份种质资源来源于 3000 份水稻基因组项目(3KRGP2中挑选的 550 份种质来自 53 个国家，包含了籼稻（Indica）、粳稻iatetype）、Aus/boro 和 Basmati/sadri 五个类型（图 2.1）。550 份种别占 46%和 33%。6%1%

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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本文编号：3416295