谷子淀粉合成酶家族分析

发布时间：2021-10-21 22:55

　　淀粉是植物光合作用的产物,主要在叶绿体中合成,是人类膳食的重要能量来源,同时也是一种重要的工业原料,被广泛应用于造纸、燃料、制药等行业。研究表明植物的淀粉合成与淀粉合成酶及一些其他关键酶有关。本研究以已知的水稻中淀粉合成酶基因为模板,鉴定出小麦、玉米、二穗短柄草、高粱和谷子淀粉合成酶家族的基因。我们分析了淀粉合成酶基因家族的系统进化树,结果发现它们在进化上具有高度的保守性。通过对保守基序进行分析,不同的基因所含有的保守motif的数目和位置差异很小,谷子淀粉合成酶的基序特征与其进化树基本一致。通过染色体定位分析,可以直观看出淀粉合成酶基因在每条染色体上分布不均匀。利用蛋白互作分析,可知淀粉的合成与多种酶相关,其中最主要的是与AGP酶相互作用。最后,用Cluster和Treeview程序构建了Heatmap图,发现淀粉合成酶基因在植物的生长和发育时期具有高度组织表达的特异性。由于谷子中淀粉含量的高低直接影响谷子的产量,因此,提高谷子淀粉含量和改良谷子淀粉品质已成为重要议题,对于谷子淀粉合成酶的研究具有显著的社会效益和经济效益。 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(16)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 谷子淀粉合成酶基因的系统进化树分析
    1.2 谷子淀粉合成酶基因保守motif分析
    1.3 谷子淀粉合成酶基因结构分析
    1.4 淀粉合成酶基因染色体定位分析
    1.5 淀粉合成酶蛋白互作分析
    1.6 淀粉合成酶家族在谷子不同组织中的表达模式分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 数据下载
    3.2 淀粉合成酶基因的鉴定
    3.3 淀粉合成酶基因理化性质分析
    3.4 淀粉合成酶基因系统进化树的构建
    3.5 淀粉合成酶基因保守motif分析
    3.6 淀粉合成酶基因结构分析
    3.7 淀粉合成酶基因染色体定位分析
    3.8 淀粉合成酶基因在不同组织中的表达模式分析
    3.9 淀粉合成酶基因蛋白互作分析
作者贡献


【参考文献】：
期刊论文
[1]几种植物淀粉合成酶的生物信息学分析[J]. 田亚珍,武国凡,秦绪军,牛世全,孔维宝.  食品与生物技术学报. 2018(09)
[2]谷物胚乳中淀粉合成酶及其同工型的研究进展[J]. 万峰,孙春玉,李闯,别枫桥,张美萍,王义.  分子植物育种. 2017(11)
[3]药用野生稻叶中淀粉合成酶基因家族的序列分化和特异表达[J]. 包颖,杜家潇,景翔,徐思.  植物学报. 2015(06)
[4]河北产区9个谷子品种淀粉性质的研究[J]. 刘成,张佩丽,沈群.  食品工业科技. 2010(01)
[5]作物淀粉合成关键酶及其基因表达的研究进展[J]. 谭彩霞,封超年,陈静,郭静,郭文善,朱新开,李春燕,彭永欣.  麦类作物学报. 2008(05)
[6]小麦淀粉合成酶研究进展[J]. 宋健民,李豪圣,戴双,刘爱峰,刘建军,赵振东.  湖南农业大学学报(自然科学版). 2007(S1)
[7]GSDS:基因结构显示系统[J]. 郭安源,朱其慧,陈新,罗静初.  遗传. 2007(08)
[8]玉米可溶性淀粉合成酶研究进展[J]. 张军杰,黄玉碧.  玉米科学. 2006(06)
[9]小麦胚乳淀粉合成酶基因研究进展[J]. 余春梅,陈佩度,季本华.  麦类作物学报. 2004(04)
[10]颗粒结合型淀粉合成酶研究进展[J]. 时岩玲,田纪春.  麦类作物学报. 2003(03)



本文编号：3449876