转录组测序辅助预测甘蓝型油菜黄籽基因
发布时间：2021-10-26 16:40
油菜的抗逆性强,适应范围广,是我国区域分布最广的油料作物。与黑籽相比,黄籽油菜具有含油量高、蛋白质含量高、纤维素和多酚含量低、油质清亮等优点。油菜的种皮颜色受多基因控制,黑籽一般为显性,多个位点都为隐性纯合时才表现为黄籽,所以选育高产优质的黄籽甘蓝型油菜品种非常困难。人工合成的甘蓝型油菜品系No.2127-17的籽粒纯黄,其黄籽性状受一对不完全显性基因控制,这种遗传模式明显不同于油菜中的其它黄籽材料。前期的研究中,我们完成了显性黄籽基因的精细定位。本研究中,我们对黄籽材料NO.2127-17和黑籽材料ZY821以及黄籽近等基因系ZY821（Y）进行了转录组测序,旨在阐明该基因控制的代谢途径及其调控规律,并结合定位结果、qRT-PCR结果以及BAC序列鉴定黄籽候选基因,为最终克隆到该黄籽基因提供依据。本研究主要结果如下:1.对黄籽材料NO.2127-17和黑籽材料ZY821以及黄籽近等基因系ZY821（Y）开花后12天（12DAP）、19天（19DAP）、26天（26DAP）和33天（33DAP）的种皮进行转录组测序。分析发现,各个时间点的差异表达基因都极特异的聚类在类黄酮合成相关通路中...
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
珠被在甘蓝型油菜种子发育过程中的分化（Nesietal2009）
转录组测序辅助预测甘蓝型油菜黄籽基因种皮颜色有很大影响，而棕色种皮中不含山奈酚。唐志东（2013）通过CMS-IT-TOF定性检测四川黄籽及其黑籽近等基因系种皮中类黄酮提取物的种，发现杨梅酮、茶黄素、山奈酚-3-葡萄糖苷、槲皮素某种衍生物和表儿茶素5种类黄酮只存在于黑籽种皮中，表明这几种物质可能是黑籽与黄籽间种皮差异形成的决定性色素。虽然对于影响种皮颜色的色素物质仍有争论，但现在研究人员普遍认为影皮颜色形成的主要是类黄酮类化合物，并且对油菜种子发育时期类黄酮代谢究主要集中在PA的积累。
图 2-2 植株材料表型Fig. 2-2 The phenotype of plant material试剂试剂： 连接酶（New England Biolabs）s 高保真酶（TOYOBO）aster Mix（Vazyme）（Monad）取试剂盒（Tiangen）剂盒（Qiagene）剂盒（Thermo Fisher Scientific）
【参考文献】：
期刊论文
[1]肿瘤抑制因子CYLD与泛素化及相关疾病研究进展[J]. 蒋佳纯,张澄,叶孟. 现代实用医学. 2014(01)
[2]依托科技创新与服务加快油菜产业发展方式转变[J]. 官春云. 湖南农业大学学报(社会科学版). 2010(04)
[3]我国油菜产业发展的历史回顾与展望[J]. 王汉中. 中国油料作物学报. 2010(02)
[4]甘蓝型油菜粒色与含油量的研究[J]. 薛汉军,孙利军,梁升平,白红涛,董振生,苏波. 西北农业学报. 2010(01)
[5]芥菜型油菜黄黑种皮色泽特征的分析化学研究[J]. 曾盔,刘忠松,严明理,曾笑. 中国油料作物学报. 2006(04)
[6]甘蓝型黑籽和黄籽油菜种子发育过程中种皮色泽差异研究 Ⅱ.黑色素、酪氨酸和酪氨酸酶的变化及相关性[J]. 叶小利,李加纳,唐章林,谌利. 中国油料作物学报. 2001(03)
[7]甘蓝型油菜黄籽和黑籽皮壳中花色素、多酚、苯丙烯酸含量和PAL酶活性的变异[J]. 王汉中,刘后利. 华中农业大学学报. 1996(06)
[8]甘蓝型油菜种子发育过程中种皮颜色变化[J]. 陈玉萍,刘后利. 中国油料. 1995(02)
[9]甘蓝型黄籽油菜的遗传研究[J]. 刘后利. 作物学报. 1992(04)
[10]油菜皮壳中多酚氧化酶活性的组织化学检定及其与粒色的关系[J]. 王汉中,刘后利. 中国油料. 1991(01)
博士论文
[1]基于RNAi揭示BnTT1参与油菜种子发育与代谢的功能特征[D]. 练剑平.西南大学 2017
[2]甘蓝籽粒色泽的遗传及其与甘蓝型油菜的比较[D]. 唐章林.西南大学 2012
硕士论文
[1]基于高通量表型检测平台解析甘蓝型油菜表型性状的遗传基础[D]. 杨山井.华中农业大学 2018
[2]延边黄牛和韩延牛血液外胞体中miRNA的差异表达分析[D]. 张睿.延边大学 2018
[3]芥菜型油菜黄籽基因定位及其功能验证[D]. 王阳.西北农林科技大学 2018
[4]BnaA.BAN.a调控甘蓝型油菜种皮色素成分的研究[D]. 朱宝.扬州大学 2016
[5]人工合成甘蓝型油菜的创建及其表观遗传分析[D]. 孔月琴.扬州大学 2015
[6]油菜荚果转录组测序分析及油分相关候选基因的鉴别[D]. 孔祥东.浙江大学 2015
[7]油菜种皮颜色与含油量、色素含量的关系研究[D]. 唐志东.湖南农业大学 2013
[8]人工合成甘蓝型黄籽油菜No.2127-17粒色基因差异表达研究[D]. 陈丽.华中农业大学 2010
[9]甘蓝型油菜及其亲本物种TT12基因家族的克隆与比较基因组学研究[D]. 黄华磊.西南大学 2007
[10]甘蓝型油菜编码WIP-锌指蛋白的TT1基因家族的克隆及在黄、黑籽之间的差异表达[D]. 路小春.云南农业大学 2006
本文编号：3459844
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
珠被在甘蓝型油菜种子发育过程中的分化（Nesietal2009）
转录组测序辅助预测甘蓝型油菜黄籽基因种皮颜色有很大影响，而棕色种皮中不含山奈酚。唐志东（2013）通过CMS-IT-TOF定性检测四川黄籽及其黑籽近等基因系种皮中类黄酮提取物的种，发现杨梅酮、茶黄素、山奈酚-3-葡萄糖苷、槲皮素某种衍生物和表儿茶素5种类黄酮只存在于黑籽种皮中，表明这几种物质可能是黑籽与黄籽间种皮差异形成的决定性色素。虽然对于影响种皮颜色的色素物质仍有争论，但现在研究人员普遍认为影皮颜色形成的主要是类黄酮类化合物，并且对油菜种子发育时期类黄酮代谢究主要集中在PA的积累。
图 2-2 植株材料表型Fig. 2-2 The phenotype of plant material试剂试剂： 连接酶（New England Biolabs）s 高保真酶（TOYOBO）aster Mix（Vazyme）（Monad）取试剂盒（Tiangen）剂盒（Qiagene）剂盒（Thermo Fisher Scientific）
【参考文献】：
期刊论文
[1]肿瘤抑制因子CYLD与泛素化及相关疾病研究进展[J]. 蒋佳纯,张澄,叶孟. 现代实用医学. 2014(01)
[2]依托科技创新与服务加快油菜产业发展方式转变[J]. 官春云. 湖南农业大学学报(社会科学版). 2010(04)
[3]我国油菜产业发展的历史回顾与展望[J]. 王汉中. 中国油料作物学报. 2010(02)
[4]甘蓝型油菜粒色与含油量的研究[J]. 薛汉军,孙利军,梁升平,白红涛,董振生,苏波. 西北农业学报. 2010(01)
[5]芥菜型油菜黄黑种皮色泽特征的分析化学研究[J]. 曾盔,刘忠松,严明理,曾笑. 中国油料作物学报. 2006(04)
[6]甘蓝型黑籽和黄籽油菜种子发育过程中种皮色泽差异研究 Ⅱ.黑色素、酪氨酸和酪氨酸酶的变化及相关性[J]. 叶小利,李加纳,唐章林,谌利. 中国油料作物学报. 2001(03)
[7]甘蓝型油菜黄籽和黑籽皮壳中花色素、多酚、苯丙烯酸含量和PAL酶活性的变异[J]. 王汉中,刘后利. 华中农业大学学报. 1996(06)
[8]甘蓝型油菜种子发育过程中种皮颜色变化[J]. 陈玉萍,刘后利. 中国油料. 1995(02)
[9]甘蓝型黄籽油菜的遗传研究[J]. 刘后利. 作物学报. 1992(04)
[10]油菜皮壳中多酚氧化酶活性的组织化学检定及其与粒色的关系[J]. 王汉中,刘后利. 中国油料. 1991(01)
博士论文
[1]基于RNAi揭示BnTT1参与油菜种子发育与代谢的功能特征[D]. 练剑平.西南大学 2017
[2]甘蓝籽粒色泽的遗传及其与甘蓝型油菜的比较[D]. 唐章林.西南大学 2012
硕士论文
[1]基于高通量表型检测平台解析甘蓝型油菜表型性状的遗传基础[D]. 杨山井.华中农业大学 2018
[2]延边黄牛和韩延牛血液外胞体中miRNA的差异表达分析[D]. 张睿.延边大学 2018
[3]芥菜型油菜黄籽基因定位及其功能验证[D]. 王阳.西北农林科技大学 2018
[4]BnaA.BAN.a调控甘蓝型油菜种皮色素成分的研究[D]. 朱宝.扬州大学 2016
[5]人工合成甘蓝型油菜的创建及其表观遗传分析[D]. 孔月琴.扬州大学 2015
[6]油菜荚果转录组测序分析及油分相关候选基因的鉴别[D]. 孔祥东.浙江大学 2015
[7]油菜种皮颜色与含油量、色素含量的关系研究[D]. 唐志东.湖南农业大学 2013
[8]人工合成甘蓝型黄籽油菜No.2127-17粒色基因差异表达研究[D]. 陈丽.华中农业大学 2010
[9]甘蓝型油菜及其亲本物种TT12基因家族的克隆与比较基因组学研究[D]. 黄华磊.西南大学 2007
[10]甘蓝型油菜编码WIP-锌指蛋白的TT1基因家族的克隆及在黄、黑籽之间的差异表达[D]. 路小春.云南农业大学 2006
本文编号：3459844
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