茶树R2R3-MYB类转录因子的鉴定及表达分析

发布时间：2021-11-01 02:43

　　茶树是典型的富铝（A1）嗜氟（F）的植物,铝和氟在茶树的生长发育过程中具有重要的作用。转录因子（transcription factors,TFs）在植物生理生长和胁迫生长中发挥着重要的作用,它参与植物逆境应答反应,是植物抗逆反应体系中调控功能基因表达的关键环节,如AP2/EREBP、MYB、NAC、WRKY和bZIP等。其中,MYB类转录因子是植物体内最大的转录因子家族之一,在植物抗逆胁迫过程中也起着重要的作用。作为MYB类转录因子中数目最多且功能多样化的一类MYB蛋白-R2R3-MYB亚类,其涉及植物中多个非生物胁迫的过程。然而,茶树中关于R2R3-MYB类转录因子的报道很少。因此,在本研究研究中,我们主要筛选和鉴定了茶树R2R3-MYB类转录因子,并且分析了其在不同组织和不同浓度的Al3+和F-处理下的相对表达量。本研究从本课题组已有的茶树转录组数据库中,利用NCBI数据库的在线搜索工具BLAST程序鉴定出43个属于R2R3-MYB类转录因子的CsMYB基因。这些基因被命名为CsMYB01至CsMYB43。另外,根据MEME在线软件预测了 43个茶树R2R3-MYB类转录因子的保... 

【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２－３?ＣｓＭＹＢ的Ｒ２Ｒ３结构域序列标识ｌｏｇｏ图

１２个拟南芥Ｒ２Ｒ３－ＭＹＢ类ＡｔＭＹＢ蛋白与４３个茶树Ｒ２Ｒ３－ＭＹＢ类ＣｓＭＹＢ蛋白进行??聚类，依据拟南芥Ｒ２Ｒ３－ＭＹＢ类转录因子的分类标准［２３１，茶树的４３个ＣｓＭＹＢ蛋白??被进一步分类成２５个亚族（如图２－１）。其中，亚族５，亚族６，亚族１０至亚族１２，??亚族１９，亚族２３没有比对上的ＣｓＭＹＢ蛋白，亚族７，亚族９，亚族１３，亚族１６，??亚族１７，亚族２０和亚族２５各有１个ＣｓＭＹＢ蛋白；亚族２，亚族３，亚族１５，亚族??１８，亚族２１和亚族２４各有２个ＣｓＭＹＢ蛋白；亚族１有３个ＣｓＭＹＢ蛋白；亚族８??有４个ＣｓＭＹＢ蛋白；亚族４有５个ＣｓＭＹＢ蛋白；亚族１４和亚族２２各有６个ＣｓＭＹＢ??蛋白［７］。为了进一步研究茶树ＣｓＭＹＢ蛋白的功能，根据前人的研宄报道，本研究从??４３个茶树ＣｓＭＹＢ蛋白中筛选出９个与非生物胁迫相关的ＣｓＭＹＢ候选蛋白进行下一??步研宄，它们分属于亚族４，亚族１３，亚族１７，亚族２２（ＣｙＭ７５／／，ＣｙＭｒ５ｉ７，ＣｖＭｙ＿ｆｉ２９，??卵至ＣｓＭＫＳＷ）。将这９个ＣｓＭＹＢ候选蛋白运用ＤＮＡＭＡＮ软??Ｒ２?ｄｏｍａｉｎ??ＣｓＭＹＢ?１７?？?ａｉＮＨＩＩＫ＇ｉ?ＪＨＧＣ?ｐＳＶＰＫＬＡＧＬＣＰＣ＾＾＾Ｓｌｆｆ?＾?ＩＰ?｜Ｄ?５１??ＣｓＭＹＢ２９?＼?ＩｉＥ＾ＦＬ｜?ｅＥＧＰ?ＩＦ?？Ｄ?５１??ＣＳＭＹＢ３８?ｇ?Ｊｓ?滅?ＳＣＦ?ｇ涵?薦顧讓?ｃｆｆｃ５。??ＣＳＭＹＢ３９?ｇ?ｊ?ｊ趣

图３－１?９个茶树ＣｓＭＹＢ基因在不同组织（根，茎，第一叶，花，果，芽，第四叶，花粉，花粉??管）中的相对表达量。??Ｆｉｇ．３－１?Ｔｈｅ?ｒｅｌａｔｉｖｅ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｌｅｖｅｌｓ?ｏｆ?ｎｉｎｅ?ＣｓＭＹＢ?ｇｅｎｅｓ?ｉｎ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｔｉｓｓｕｅｓ?（ｒｏｏｔ，?ｓｔｅｍ，?ｆｉｒｓｔ?ｌｅａｆ，??ｆｌｏｗｅｒ，?ｆｏｕｒｔｈ?ｌｅａｆ，?ｐｏｌｌｅｎ，?ｐｏｌｌｅｎ?ｔｕｂｅ）．??外（亚族２２）在茎中的表达量最高，在花粉中的表达量最低。ＣｖＭＴＢＷ?（亚??族２２）在花和花粉管的表达量都很高，几乎是相同的表达水平，茎次之。??（亚族２２）在花粉管中的表达量远远高于其它组织的表达水平，表明（亚??族２２）基因在花粉管中的特异性表达。（亚族２２）的表达主要集中在果实??和花粉管中，且（亚族２２）在果实中的表达水平明显高于花粉管中的表达??水平，在果实中的表达量是其根的１３倍，在花粉管中的表达量是其根的７倍，在其??它组织中几乎不表达＾??２４??


本文编号：3469366