粳稻云引免疫应答相关基因OsGT64A的克隆及功能初步分析

发布时间：2021-12-02 09:50

　　云引是本实验室引进的一个广谱抗稻瘟病粳稻品种,通过与普感稻瘟病品种丽江新团黑谷进行杂交及多轮回交后构建了相应的近等基因系,并在抗、感病子代全基因组重测序的基础上,从G0:0045087分类单元里筛选出一个可能参与水稻抗病过程的基因OsGT64A,结合分子生物学技术对该基因进行克隆与功能初步分析,主要的研究内容及结果如下:1.以日本晴基因组为参考,设计引物,在云引和丽江新团黑谷的基因组中分别克隆了该基因,通过测序比对后发现,丽江新团黑谷与日本晴的序列完全一致,但云引与它们之间存在一定差异,其中,云引在基因编码区（CDS）上共缺失了12个碱基,同时还存在4处单碱基位点的替换,且有3处造成蛋白编码氨基酸的改变。另外,还有4处单碱基的突变位于内含子中;2.设计引物,分别在云引和丽江新团黑谷中扩增出该基因的启动子序列,经测序比对后发现,丽江新团黑谷与日本晴一致,而云引与二者之间仍有少量的SNP（单核苷酸多态性）及Indel（插入缺失）,通过Plantcare启动子元件分析网站预测,发现该基因的启动子序列存在多种已知的响应元件,包括各种激素、防御、光、生理周期等响应元件,由于云引启动子序列存在的突... 

【文章来源】：福建师范大学福建省

【文章页数】：101 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图３：三类糖基转移酶的蛋白质三维构造Ｐｉ??Ｆｉｇ．３?Ｔｈｅ?ｐｒｏｔｅｉｎ?ｔｅｒｔｉａｒｙ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ｔｈｒｅｅ?ｇｌｙｃｏｓｙｌｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅｓ１２８】??－

（＞．２．１．２?ＧＴ６４糖基转移酶家族??糖基转移酶ＧＴ６４家族广泛存在于各种物种中，包括人、果蝇、拟南芥、??白杨等。通常为ＧＴ－Ａ蛋白结构（图４），具有ａ?－?１?，?４－Ｎ－乙酰葡糖氨基转移酶??活性，但动物中的ＧＴ６４成员多数是具有双功能的，它们同时包含了?ＧＴ－Ａ和??ＧＴ－Ｂ的结构域１３２＿明，兼有Ｐ－１，４－葡萄糖醛酸转移酶活性，即一种蛋白可能具??有多种糖基转移酶活性。而绝大多数植物中的ＧＴ６４成员目前未被发现同时具??有两种蛋白功能域，只是少数成员除了?Ｃ端的ＧＴ６４结构域外，在Ｎ端还具有??一个未知的结构域，该结构域与已知或预测的结构域都不相似，比如拟南芥??五ＰＣ－Ｌ２基因，这种可能的双模结构仍然需要更多的证据支持【３，３４］。??Ｎ?赢－、??ｆ．…．．．．ｆ??Ｃ７?／?２，??＂??图４：?ＧＴ－Ａ蛋白结构模式示意图［３１】??蓝色柱子：ａ螺旋；橙色箭头：０折叠；红色实线：ＤｘＤ模体；??Ｆｉｇ．４?Ｔｈｅ?ｓｃｈｅｍａ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ＧＴ－Ａ?ｐｒｏｔｅｉｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ［川??Ｂｌｕｅ?ｃｙｌｉｎｄｅｒｓ：?ａ?－ｈｅｌｉｃｅｓ?；?Ｍａｇｅｎｔａ?ａｒｒｏｗｓ：?Ｐ?－ｌｉｐ；?Ｒｅｄ?ｌｉｎｅ：?ＤｘＤ?ｍｏｔｉｆ??目前，对ＧＴ６４糖基转移酶家族的研究集中在动物中，包括人和小鼠，人??类中的ＧＴ６４成员也称之为Ｅｘｏｓｔｏｓｉｎ家族

ＥＴ（ｅｔｈｙｌｅｎｅ，乙稀）等，它们都在植物体响应生物及Ｉ丨生物胁边巾扮演心：取耍的??角色，除了乙烯外，它们多数都还拥有糖基化衍生化合物【３７＿３９】。其中，ＳＡ、ＪＡ??介导的抗病途径是植物中十分重要的防御途径（

【参考文献】：
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硕士论文
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本文编号：3528197