利用剩余杂合体衍生的近等基因系精细定位水稻粒长微效QTL qGL1.1
发布时间：2021-12-16 03:57
【目的】本研究旨在对前期在水稻第1染色体长臂521.8 kb的区间内定位到的q TGW1.1b进行精细定位。【方法】从qTGW1.1和qTGW1.2所在区间分别呈杂合的2个BC2F9单株配组衍生的F4群体中,筛选到Wn28826-RM1231区间内杂合片段呈梯系排列的3个单株,构建了3套F5:6近等基因系。2017年种植于浙江杭州,考查千粒重、粒长和粒宽。利用SAS软件的GLM程序进行双因素方差分析,对qTGW1.1b的效应进行了验证。在此基础上,筛选出杂合片段更小且呈交迭排列的6个剩余杂合体,发展了6套F8:9近等基因系,2018年种植于海南陵水。对每套近等基因系中双亲基因型株系的表型差异进行双因素方差分析。【结果】qTGW1.1b在2个试验中对粒长和千粒重均呈极显著差异,效应方向一致且大小稳定。密阳46等位基因能分别增加粒长0.027 mm和提高千粒重0.17 g,贡献率分别达到27.12%和19.09%。【结论】鉴于qTGW1.1b在前后试验中对粒长影响最为显著,而对粒宽作用不显著,故将qTGW1.1b重新命名为qGL1.1。通过比较各套近等基因系的分离区间的基因组位置,最终将q...
【文章来源】：中国水稻科学. 2020,34(02)北大核心CSCD
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
9套近等基因系在目标区间的基因型组成
按2种基因型划分，比较各套近等基因系同一性状双亲基因型分布，发现千粒重和粒长存在明显的群体间差异(图3)。Y1和LP4中2种基因型株系在千粒重和粒长性状上，表现出珍汕97纯合型株系趋向于低值区而密阳46纯合型株系趋向于高值区的特点，特别是粒长，呈现出孟德尔式分离。表明Y1和LP4的分离区间可能存在控制粒长和千粒重的QTL。2.2 QTL效应验证
利用珍汕97///珍汕97//珍汕97/密阳46组合衍生的1个BC2F9群体，从中挑选在q TGW1.1区间(RM11437-RM11615)和q TGW1.2区间(RM11615-RM11800)[32]分别呈杂合的2个单株，配组衍生1个F4群体。经分离区间标记检测，筛选到Wn28826-RM1231区间内杂合片段呈梯系排列的3个单株，自交形成3个NIL-F2型的F5群体，分别从每个群体中挑选分离区间呈母本纯合型(即珍汕97纯合型)和父本纯合型(即密阳46纯合型)的单株，自交后构建了3套F5:6近等基因系，命名为Y1、Y2和Y3。Y1包含珍汕97纯合型株系30个和密阳46纯合型株系29个，Y2和Y3分别包含珍汕97纯合型和密阳46纯合型株系各30个。3套近等基因系的分离区间分别为Wn28826-RM1231、Wn28990-RM1231和Wn29154-RM1231(图2-A)。同时，为进一步筛选杂合区间更为精细的梯系剩余杂合体材料，从衍生出Y1的F5群体中挑选整个分离区间(Wn28826-RM1231)呈杂合的2个单株，经过“剩余杂合体-NIL-F2型群体-剩余杂合体-NIL-F2型群体”2次标记筛选，获得了杂合片段更小且呈交叠排列的6个F7单株，自交形成6个NIL-F2型F8群体。从中挑选珍汕97纯合型和密阳46纯合型单株，自交后构建了6套F8:9近等基因系，分别命名为LP1、LP2、LP3、LP4、LP5和LP6，每套近等基因系分别包含珍汕97纯合型株系和密阳46纯合型株系各30个。LP3和LP5来源于同一个F5单株，LP1、LP2、LP4和LP6则来源于另一个F5单株。6套近等基因系的分离区间分别为Wn28826-Wn28893、Wn28826-Wn28990、Wn28990-Wn29048、Wn29048-Wn29125、Wn29125-RM1231和Wn29154-RM1231(图2-B)。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Fine-Mapping of qTGW1.2a, a Quantitative Trait Locus for 1000-Grain Weight in Rice[J]. WANG Wenhui,WANG Linlin,ZHU Yujun,FAN Yeyang,ZHUANG Jieyun. Rice Science. 2019(04)
[2]水稻粒型基因克隆和调控机制研究进展[J]. 刘喜,牟昌铃,周春雷,程治军,江玲,万建民. 中国水稻科学. 2018(01)
[3]Dissection of two quantitative trait loci for grain weight linked in repulsion on the long arm of chromosome 1 of rice（Oryza sativa L.）[J]. Liang Guo,Kai Wang,Junyu Chen,Derun Huang,Yeyang Fan,Jieyun Zhuang. The Crop Journal. 2013(01)
本文编号：3537433
【文章来源】：中国水稻科学. 2020,34(02)北大核心CSCD
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
9套近等基因系在目标区间的基因型组成
按2种基因型划分，比较各套近等基因系同一性状双亲基因型分布，发现千粒重和粒长存在明显的群体间差异(图3)。Y1和LP4中2种基因型株系在千粒重和粒长性状上，表现出珍汕97纯合型株系趋向于低值区而密阳46纯合型株系趋向于高值区的特点，特别是粒长，呈现出孟德尔式分离。表明Y1和LP4的分离区间可能存在控制粒长和千粒重的QTL。2.2 QTL效应验证
利用珍汕97///珍汕97//珍汕97/密阳46组合衍生的1个BC2F9群体，从中挑选在q TGW1.1区间(RM11437-RM11615)和q TGW1.2区间(RM11615-RM11800)[32]分别呈杂合的2个单株，配组衍生1个F4群体。经分离区间标记检测，筛选到Wn28826-RM1231区间内杂合片段呈梯系排列的3个单株，自交形成3个NIL-F2型的F5群体，分别从每个群体中挑选分离区间呈母本纯合型(即珍汕97纯合型)和父本纯合型(即密阳46纯合型)的单株，自交后构建了3套F5:6近等基因系，命名为Y1、Y2和Y3。Y1包含珍汕97纯合型株系30个和密阳46纯合型株系29个，Y2和Y3分别包含珍汕97纯合型和密阳46纯合型株系各30个。3套近等基因系的分离区间分别为Wn28826-RM1231、Wn28990-RM1231和Wn29154-RM1231(图2-A)。同时，为进一步筛选杂合区间更为精细的梯系剩余杂合体材料，从衍生出Y1的F5群体中挑选整个分离区间(Wn28826-RM1231)呈杂合的2个单株，经过“剩余杂合体-NIL-F2型群体-剩余杂合体-NIL-F2型群体”2次标记筛选，获得了杂合片段更小且呈交叠排列的6个F7单株，自交形成6个NIL-F2型F8群体。从中挑选珍汕97纯合型和密阳46纯合型单株，自交后构建了6套F8:9近等基因系，分别命名为LP1、LP2、LP3、LP4、LP5和LP6，每套近等基因系分别包含珍汕97纯合型株系和密阳46纯合型株系各30个。LP3和LP5来源于同一个F5单株，LP1、LP2、LP4和LP6则来源于另一个F5单株。6套近等基因系的分离区间分别为Wn28826-Wn28893、Wn28826-Wn28990、Wn28990-Wn29048、Wn29048-Wn29125、Wn29125-RM1231和Wn29154-RM1231(图2-B)。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Fine-Mapping of qTGW1.2a, a Quantitative Trait Locus for 1000-Grain Weight in Rice[J]. WANG Wenhui,WANG Linlin,ZHU Yujun,FAN Yeyang,ZHUANG Jieyun. Rice Science. 2019(04)
[2]水稻粒型基因克隆和调控机制研究进展[J]. 刘喜,牟昌铃,周春雷,程治军,江玲,万建民. 中国水稻科学. 2018(01)
[3]Dissection of two quantitative trait loci for grain weight linked in repulsion on the long arm of chromosome 1 of rice（Oryza sativa L.）[J]. Liang Guo,Kai Wang,Junyu Chen,Derun Huang,Yeyang Fan,Jieyun Zhuang. The Crop Journal. 2013(01)
本文编号：3537433
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3537433.html
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