棉花磷脂酶D基因家族的分子特征及其GhPLDα1功能分析
发布时间：2021-12-23 05:35
磷脂酶D（Phospholipase D,PLD）是植物体内最主要的一类磷脂水解酶,它可以特异性地催化磷脂分子末端的磷酸二酯键水解,产生磷脂酸和一个自由基团,如胆碱、乙胺醇等。植物PLD调节细胞膜脂质代谢,并参与生长发育和胁迫响应等多种生理过程。目前,棉花PLD基因家族组成和分子特征的研究尚无报道,其在纤维发育中的作用也未被揭示。本研究首次在全基因组水平上解析了棉花PLD基因家族,并对其重要成员GhPLDα1在纤维细胞次生壁增厚中的作用进行了分析。首先,本研究从陆地棉（Gossypium hirsutum）、雷蒙德氏棉（Gossypium raimondii）和亚洲棉（Gossypium arboreum）中分别鉴定到40、20和19个PLD基因（GhPLD、Gr PLD和GaPLD）。系统进化树分析表明,这些PLD基因可被分为α、β/γ、δ、ε、ζ和φ等6个不均等的亚组。同一亚组的棉花PLD基因具有相似的内含子-外显子组成,其氨基酸序列具有相同的功能结构域组成并含有亚组特异性的保守氨基酸位点。三种棉花PLD基因家族扩张过程中共发生了16次基因片段复制事件和3次基因串联复制事件,所有复...
【文章来源】：清华大学北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：110 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
磷脂分子发生水解反应的位置特异性（Chenetal.,2011）
图 1.2 拟南芥 PLD 的结构域组成 （Wang et al., 2014）2 是指 Ca2+依赖性的磷脂结合结构域。PH 是指 pleckstrin 同源结构域。PX 是指域。HKD 是指 HxKxxxxD 结构域，它是 PLD 催化磷脂水解反应的活性中心。 G 蛋白发生相互作用的结构域。值得注意的是，不同的配体结合基序已经在相 家族成员中被实验所验证。
图 1.3 植物 PLD 行使信号传导功能的分子机制模型 （Wang et al., 2014）植物 PLD 行使信号传导功能的分子机制模型可以分为以下几类：（1）PLD 通过其产A 与 PDK1（磷酸肌醇依赖的蛋白激酶 1）、MPK6（促分裂原活化蛋白激酶 6）、PEPC（烯醇式丙酮酸）等下游靶蛋白结合，发挥调控作用。（2）PLD 与 GAPC（细胞质甘油醛酶）、G 蛋白、actin（肌动蛋白）等效应蛋白直接结合，发挥调控作用。（3）PLD 通产物 PA 与 SPHK（鞘氨醇激酶）等蛋白结合，从而使 PLD 与 SPHK/phyto-S1P（鞘氨醇
【参考文献】：
期刊论文
[1]SCFP, a novel fiber-specific promoter in cotton[J]. HOU Lei, LIU Hao, LI JiaBao, YANG Xia, XIAO YueHua, LUO Ming, SONG ShuiQing, YANG GuangWei & PEI Yan↑ Key Laboratory of Biotechnology and Crop Quality Improvement of the Ministry of Agriculture, Biotechnology Research Center, Southwest University, Chongqing 400716, China. Chinese Science Bulletin. 2008(17)
[2]KaKsCalculator:Calculating Ka and Ks Through Model Selection and Model Averaging[J]. Gane Ka-Shu Wong. Genomics Proteomics & Bioinformatics. 2006(04)
本文编号：3547889
【文章来源】：清华大学北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：110 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
磷脂分子发生水解反应的位置特异性（Chenetal.,2011）
图 1.2 拟南芥 PLD 的结构域组成 （Wang et al., 2014）2 是指 Ca2+依赖性的磷脂结合结构域。PH 是指 pleckstrin 同源结构域。PX 是指域。HKD 是指 HxKxxxxD 结构域，它是 PLD 催化磷脂水解反应的活性中心。 G 蛋白发生相互作用的结构域。值得注意的是，不同的配体结合基序已经在相 家族成员中被实验所验证。
图 1.3 植物 PLD 行使信号传导功能的分子机制模型 （Wang et al., 2014）植物 PLD 行使信号传导功能的分子机制模型可以分为以下几类：（1）PLD 通过其产A 与 PDK1（磷酸肌醇依赖的蛋白激酶 1）、MPK6（促分裂原活化蛋白激酶 6）、PEPC（烯醇式丙酮酸）等下游靶蛋白结合，发挥调控作用。（2）PLD 与 GAPC（细胞质甘油醛酶）、G 蛋白、actin（肌动蛋白）等效应蛋白直接结合，发挥调控作用。（3）PLD 通产物 PA 与 SPHK（鞘氨醇激酶）等蛋白结合，从而使 PLD 与 SPHK/phyto-S1P（鞘氨醇
【参考文献】：
期刊论文
[1]SCFP, a novel fiber-specific promoter in cotton[J]. HOU Lei, LIU Hao, LI JiaBao, YANG Xia, XIAO YueHua, LUO Ming, SONG ShuiQing, YANG GuangWei & PEI Yan↑ Key Laboratory of Biotechnology and Crop Quality Improvement of the Ministry of Agriculture, Biotechnology Research Center, Southwest University, Chongqing 400716, China. Chinese Science Bulletin. 2008(17)
[2]KaKsCalculator:Calculating Ka and Ks Through Model Selection and Model Averaging[J]. Gane Ka-Shu Wong. Genomics Proteomics & Bioinformatics. 2006(04)
本文编号：3547889
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3547889.html
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