普通小麦POD活性全基因组关联分析及功能标记开发
发布时间：2022-01-14 11:54
小麦是世界上主要的粮食作物之一,面粉颜色是衡量小麦品质的重要指标。小麦籽粒中过氧化物酶（Peroxidase,POD）活性是面粉及面制品在加工,储藏过程中发生褐变和被漂白的重要原因。因此,探究POD基因的特性已成为小麦品质改良的分子标记辅助育种的重要目标。本研究以黄淮麦区材料151份与北部冬麦区82份品种为材料,利用90K iSelect芯片对小麦品种籽粒POD活性基因进行GWAS;并利用同源克隆与PCR验证的方法克隆小麦7D染色体的POD活性基因,通过生物信息学分析了解不同品种间的等位变异编码蛋白的功能变化,根据等位变异之间的序列差异开发功能标记。主要结果如下:1.在黄淮冬麦区与北部冬麦区中均检测到20个与POD活性显著关联的位点（P<0.001）,单个位点可解释7.8-23.3%的表型变异。随着优异等位基因数量的增多,小麦籽粒POD活性越高。并且本研究发现了3个与POD活性有关的候选基因,分别编码磷酸甘露糖变位酶（PMM-D1）、辣根过氧化物酶（PER40）和烷基氢过氧化物还原酶（F77531640）。2.TaPod-D1基因全长为1124 bp,等位变...
【文章来源】：新疆农业大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
黄淮麦区品种在4个环境下的POD活性分布图
16图 2-2 北部冬麦区品种在 4 个环境下的 POD 活性分布图。Figure 2-2 Distributions POD activity of Northern China Plain Winter Wheat Region注：2013BBV：2013 北京，2013SBY：2013 石家庄，2014BBV：2014 北京，2014SBY：2014 石家庄和 Average：4 个环境的平均值.Note: 2013BBV: 2013Beijing，2013SBY: 2013 Shijiazhuang，2014BBV: 2014 Beijing，2014SBY: 2014Shijiazhuangand Average: Average of the fourenvironments.
图 2-3 使用 deltak 值估计黄淮冬麦区(a)和北部冬麦区(b)品种亚群数Figure 2-3 Estimation of number of sub-populations (K) in Yellow & Huai Facultative Winter WheatRegion (a) and Northern China Plain Winter Wheat Region (b)
【参考文献】：
期刊论文
[1]小麦燕大1817×北农6号重组自交系群体在正常和盐胁迫水培条件下苗期性状的QTL定位[J]. 周升辉,吴秋红,谢菁忠,陈娇娇,陈永兴,傅琳,王国鑫,于美华,王振忠,张德云,王令,王丽丽,张艳,梁荣奇,韩俊,刘志勇. 作物学报. 2016(12)
[2]高大平房仓仓顶遮阳网隔热控温储粮技术应用[J]. 宋锋,陈卫红,彭凌,丁学军,何艳平,袁军. 粮食加工. 2015(02)
[3]栽培大豆农艺性状的关联分析及优异等位变异挖掘[J]. 杨胜先,牛远,李梦,魏世平,刘晓芬,吕海燕,章元明. 中国农业科学. 2014(20)
[4]不同水氮管理下锌与氮磷肥配合喷施对冬小麦锌营养品质的影响[J]. 李宏云,王少霞,李萌,田霄鸿,赵爱青,国春慧. 中国农业科学. 2014(20)
[5]外显子组测序在人类疾病中的应用[J]. 饶书权,杜廷福,许琪. 遗传. 2014(11)
[6]利用连锁和关联分析定位粳稻芽期及幼苗前期耐盐性QTL[J]. 郑洪亮,刘博文,赵宏伟,王敬国,刘化龙,孙健,邢军,邹德堂. 中国水稻科学. 2014(04)
[7]小麦品种面粉白度的变异及其影响因素分析[J]. 姜小苓,董娜,丁位华,冯素伟,陈向东,茹振钢. 麦类作物学报. 2014(01)
[8]玉米穗行数全基因组关联分析[J]. 张焕欣,翁建峰,张晓聪,刘昌林,雍洪军,郝转芳,李新海. 作物学报. 2014(01)
[9]黄淮麦区小麦品种(系)产量性状与分子标记的关联分析[J]. 张国华,高明刚,张桂芝,孙金杰,靳雪梅,王春阳,赵岩,李斯深. 作物学报. 2013(07)
[10]全基因组关联分析在畜禽中的研究进展[J]. 王继英,王海霞,迟瑞宾,郭建凤,武英. 中国农业科学. 2013(04)
本文编号：3588459
【文章来源】：新疆农业大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
黄淮麦区品种在4个环境下的POD活性分布图
16图 2-2 北部冬麦区品种在 4 个环境下的 POD 活性分布图。Figure 2-2 Distributions POD activity of Northern China Plain Winter Wheat Region注：2013BBV：2013 北京，2013SBY：2013 石家庄，2014BBV：2014 北京，2014SBY：2014 石家庄和 Average：4 个环境的平均值.Note: 2013BBV: 2013Beijing，2013SBY: 2013 Shijiazhuang，2014BBV: 2014 Beijing，2014SBY: 2014Shijiazhuangand Average: Average of the fourenvironments.
图 2-3 使用 deltak 值估计黄淮冬麦区(a)和北部冬麦区(b)品种亚群数Figure 2-3 Estimation of number of sub-populations (K) in Yellow & Huai Facultative Winter WheatRegion (a) and Northern China Plain Winter Wheat Region (b)
【参考文献】：
期刊论文
[1]小麦燕大1817×北农6号重组自交系群体在正常和盐胁迫水培条件下苗期性状的QTL定位[J]. 周升辉,吴秋红,谢菁忠,陈娇娇,陈永兴,傅琳,王国鑫,于美华,王振忠,张德云,王令,王丽丽,张艳,梁荣奇,韩俊,刘志勇. 作物学报. 2016(12)
[2]高大平房仓仓顶遮阳网隔热控温储粮技术应用[J]. 宋锋,陈卫红,彭凌,丁学军,何艳平,袁军. 粮食加工. 2015(02)
[3]栽培大豆农艺性状的关联分析及优异等位变异挖掘[J]. 杨胜先,牛远,李梦,魏世平,刘晓芬,吕海燕,章元明. 中国农业科学. 2014(20)
[4]不同水氮管理下锌与氮磷肥配合喷施对冬小麦锌营养品质的影响[J]. 李宏云,王少霞,李萌,田霄鸿,赵爱青,国春慧. 中国农业科学. 2014(20)
[5]外显子组测序在人类疾病中的应用[J]. 饶书权,杜廷福,许琪. 遗传. 2014(11)
[6]利用连锁和关联分析定位粳稻芽期及幼苗前期耐盐性QTL[J]. 郑洪亮,刘博文,赵宏伟,王敬国,刘化龙,孙健,邢军,邹德堂. 中国水稻科学. 2014(04)
[7]小麦品种面粉白度的变异及其影响因素分析[J]. 姜小苓,董娜,丁位华,冯素伟,陈向东,茹振钢. 麦类作物学报. 2014(01)
[8]玉米穗行数全基因组关联分析[J]. 张焕欣,翁建峰,张晓聪,刘昌林,雍洪军,郝转芳,李新海. 作物学报. 2014(01)
[9]黄淮麦区小麦品种(系)产量性状与分子标记的关联分析[J]. 张国华,高明刚,张桂芝,孙金杰,靳雪梅,王春阳,赵岩,李斯深. 作物学报. 2013(07)
[10]全基因组关联分析在畜禽中的研究进展[J]. 王继英,王海霞,迟瑞宾,郭建凤,武英. 中国农业科学. 2013(04)
本文编号：3588459
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