小麦、百萨偃麦草和花生染色体荧光原位杂交寡核苷酸探针(套)开发与应用
发布时间:2022-02-26 09:36
小麦(Triticum aestivum,2n=6x=42,AABBDD)是我国重要的粮食作物。百萨偃麦草(2n=2x=14,JJ)具有很强的耐盐性和抗多种小麦病害,是小麦改良的重要基因资源。染色体工程是小麦改良的有效途径,然而由于传统荧光原位杂交(FISH)所用的质粒探针数目有限,制备程序繁琐、成本高,因此限制了染色体工程效率的提高。寡核苷酸(single strand oligonucleotide,SSON)探针是人工合成的一种带有荧光集团的单链DNA或RNA片段,其长度通常为20~60 nt,具有易设计、合成和修饰,成本低、灵敏度高、重复性好等特点。基于寡核苷酸探针的寡核苷酸FISH技术省去了传统FISH制备探针必需的质粒引进、繁殖、提取、标记或PCR扩增等程序,具有简单、经济和高效的特点,是新一代染色体鉴定技术,具有很大的研究和应用潜力。(1)通过探针长度和浓度效应分析,发现29~59 nt比14~15 nt SSON探针在低浓度下更容易产生清晰稳定的信号,据此建立了利用已知重复序列、小麦染色体3B和百萨偃麦草染色体4JL基因组序列开发重复序列SSON探针的方法:在王艳芝(2...
【文章来源】:南京农业大学江苏省211工程院校教育部直属院校
【文章页数】:134 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略词表
第一章 文献综述
1 染色体分带
2 荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization, FISH)
3 单拷贝基因(序列)FISH
3.1 gDNA FISH
3.2 cDNA FISH
4 寡核苷酸FISH
4.1 寡核苷酸探针类型与开发方法
4.2 寡核苷酸探针标记物和标记方法
4.3 非变性FISH(ND-FISH)
4.4 影响寡核苷酸FISH因素
4.5 寡核苷酸FISH的应用
5. 本研究目的与意义
第二章 小麦和百萨偃麦草寡核苷酸探针(套)开发和应用
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 不同长度寡核苷酸探针FISH和ND-FISH分析
2.2 利用Afa family重复序列开发小麦新探针
2.3 小麦3B染色体特异重复序列寡核苷酸探针开发
2.4 百萨偃麦草基因组特异寡核苷酸探针开发
2.5 小麦和百萨偃麦草寡核苷酸探针套开发
2.6 栽培小麦品种染色体多样性分析
2.7 普通小麦-百萨偃麦草异染色体系分析
2.8 寡核苷酸探针染液染色体涂染技术
3 讨论
3.1 寡核苷酸FISH的优势与局限性
3.2 百萨偃麦草基因组和小麦染色体3B特异寡核苷酸探针开发
3.3 小麦和百萨偃麦草寡核苷酸探针套的开发和应用潜力
第三章 花生寡核苷酸探针(套)开发及应用
1. 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 花生寡核苷酸探针开发及定位
2.2 花生野生种染色体多样性分析
2.3 花生染色体结构变异分析
2.4 A.duranensis染色体序列图与核型对应
3 讨论
3.1 利用A.duranensis基因组测序开发花生寡核苷酸探针
3.2 花生染色体识别
3.3 花生染色体结构变异
3.4 不同花生种染色体组关系
3.5 花生序列图与染色体核型对应
第四章 结论与创新点
1 结论
2 创新点
3 不足之处
参考文献
致谢
攻读学位期间的研究成果
【参考文献】:
期刊论文
[1]小麦-黑麦1RS/1BL新易位系的创制和分子细胞遗传学鉴定[J]. 王静,王献平,纪军,王志国,安调过,李俊明,张相岐. 作物学报. 2006(01)
[2]利用高灵敏的TSA-FISH在玉米中定位bz1、bz2基因(英文)[J]. 李宗芸,宁顺斌,韩永华,刘立华,宋运淳. Developmental & Reproductive Biology. 2002(01)
[3]花生属栽培种和野生种间亲缘关系的研究Ⅰ.染色体Giemsa C-显带带型分析[J]. 詹英贤,吴爱忠,程明,周向臣. 北京农业大学学报. 1992(01)
[4]黑麦(Secale cereale)的染色体组型分析[J]. 李国珍. 作物学报. 1982(02)
[5]植物染色体标本制备的去壁、低渗法及其在细胞遗传学中的意义[J]. 陈瑞阳,宋文芹,李秀兰. 遗传学报. 1982(02)
[6]黑麦染色体的带型及其应用[J]. 陈瑞阳,宋文芹,徐悦凡. 遗传学报. 1979(01)
硕士论文
[1]百萨偃麦草染色体小片段易位的创制、鉴定与基因定位分析[D]. 王艳芝.南京农业大学 2013
[2]百萨偃麦草染色体1J和5J变异体的诱致与鉴定[D]. 谈丽君.南京农业大学 2011
[3]普通小麦—百萨偃麦草异染色体系选育及分子细胞遗传学研究[D]. 沈健.南京农业大学 2011
[4]石蒜属植物染色体分带和荧光原位杂交研究[D]. 王利平.南京林业大学 2007
本文编号:3644387
【文章来源】:南京农业大学江苏省211工程院校教育部直属院校
【文章页数】:134 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略词表
第一章 文献综述
1 染色体分带
2 荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization, FISH)
3 单拷贝基因(序列)FISH
3.1 gDNA FISH
3.2 cDNA FISH
4 寡核苷酸FISH
4.1 寡核苷酸探针类型与开发方法
4.2 寡核苷酸探针标记物和标记方法
4.3 非变性FISH(ND-FISH)
4.4 影响寡核苷酸FISH因素
4.5 寡核苷酸FISH的应用
5. 本研究目的与意义
第二章 小麦和百萨偃麦草寡核苷酸探针(套)开发和应用
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 不同长度寡核苷酸探针FISH和ND-FISH分析
2.2 利用Afa family重复序列开发小麦新探针
2.3 小麦3B染色体特异重复序列寡核苷酸探针开发
2.4 百萨偃麦草基因组特异寡核苷酸探针开发
2.5 小麦和百萨偃麦草寡核苷酸探针套开发
2.6 栽培小麦品种染色体多样性分析
2.7 普通小麦-百萨偃麦草异染色体系分析
2.8 寡核苷酸探针染液染色体涂染技术
3 讨论
3.1 寡核苷酸FISH的优势与局限性
3.2 百萨偃麦草基因组和小麦染色体3B特异寡核苷酸探针开发
3.3 小麦和百萨偃麦草寡核苷酸探针套的开发和应用潜力
第三章 花生寡核苷酸探针(套)开发及应用
1. 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 花生寡核苷酸探针开发及定位
2.2 花生野生种染色体多样性分析
2.3 花生染色体结构变异分析
2.4 A.duranensis染色体序列图与核型对应
3 讨论
3.1 利用A.duranensis基因组测序开发花生寡核苷酸探针
3.2 花生染色体识别
3.3 花生染色体结构变异
3.4 不同花生种染色体组关系
3.5 花生序列图与染色体核型对应
第四章 结论与创新点
1 结论
2 创新点
3 不足之处
参考文献
致谢
攻读学位期间的研究成果
【参考文献】:
期刊论文
[1]小麦-黑麦1RS/1BL新易位系的创制和分子细胞遗传学鉴定[J]. 王静,王献平,纪军,王志国,安调过,李俊明,张相岐. 作物学报. 2006(01)
[2]利用高灵敏的TSA-FISH在玉米中定位bz1、bz2基因(英文)[J]. 李宗芸,宁顺斌,韩永华,刘立华,宋运淳. Developmental & Reproductive Biology. 2002(01)
[3]花生属栽培种和野生种间亲缘关系的研究Ⅰ.染色体Giemsa C-显带带型分析[J]. 詹英贤,吴爱忠,程明,周向臣. 北京农业大学学报. 1992(01)
[4]黑麦(Secale cereale)的染色体组型分析[J]. 李国珍. 作物学报. 1982(02)
[5]植物染色体标本制备的去壁、低渗法及其在细胞遗传学中的意义[J]. 陈瑞阳,宋文芹,李秀兰. 遗传学报. 1982(02)
[6]黑麦染色体的带型及其应用[J]. 陈瑞阳,宋文芹,徐悦凡. 遗传学报. 1979(01)
硕士论文
[1]百萨偃麦草染色体小片段易位的创制、鉴定与基因定位分析[D]. 王艳芝.南京农业大学 2013
[2]百萨偃麦草染色体1J和5J变异体的诱致与鉴定[D]. 谈丽君.南京农业大学 2011
[3]普通小麦—百萨偃麦草异染色体系选育及分子细胞遗传学研究[D]. 沈健.南京农业大学 2011
[4]石蒜属植物染色体分带和荧光原位杂交研究[D]. 王利平.南京林业大学 2007
本文编号:3644387
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3644387.html
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