小麦主栽品种济麦22与良星99的基因组序列多态性比较分析

发布时间：2022-06-24 09:45

　　济麦22和良星99是我国黄淮冬麦区和北部冬麦区大面积推广的高产小麦品种,也是目前小麦杂交育种的重要亲本。虽然济麦22和良星99的来源和系谱不同,但在重要农艺、产量等性状上存在较高的相似性。为了从全基因组水平研究其遗传组成的异同,本研究采用IlluminaHiSeq2500测序平台对上述两个品种进行了全基因组测序（平均测序深度为5.8×）,并系统地比较了两个品种拷贝数变异（CNV）、单核苷酸多态性（SNP）和插入/缺失（InDel）的序列差异。与中国春参考基因组序列相比,两个品种除了具有总长466 Mb的共有CNV变异区间外,济麦22和良星99的特有CNV变异区间的总长分别为91Mb和45Mb,这些特有CNV区间主要集中在2B和4B染色体上;济麦22和良星99间存在1,547,371个SNP差异位点和137,817个InDel差异位点。以差异SNP分布规律为依据,在全基因组水平鉴定出济麦22和良星99间存在14.2%的差异多态性热点区间,这些区间集中分布在1D、2B和4B染色体上。通过对5个控制小麦株高和穗长基因的序列分析,发现有2个位于多态性热点区间的基因在品种间存在移码突变。本研究为... 

【文章页数】：14 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 小麦材料及田间表型考察
    1.2 全基因组重测序与多态性位点鉴定
    1.3 拷贝数变异区间鉴定及比较分析
    1.4 品种间全基因组高频率SNP差异区段的鉴定
    1.5 差异CNV区间和基因序列差异差异位点的验证
2 结果与分析
    2.1 济麦22与良星99的农艺性状比较
    2.2 济麦22和良星99全基因组多态性位点检测
    2.3 济麦22与良星99的基因组CNV区间的鉴定与比较
    2.4 济麦22和良星99间的SNP多态性热点区间和序列相似区间分析
    2.5 济麦22和良星99的多态性热点区间和序列相似区间的突变类型分析
    2.6 株高候选基因在济麦22和良星99之间的序列差异分析及重测序结果验证
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
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[2]黄淮麦区300个小麦种质的主要农艺性状比较[J]. 张婷,逯腊虎,张伟,杨斌,袁凯,史晓芳.  小麦研究. 2018(01)
[3]黄淮麦区300个小麦种质的主要农艺性状比较[J]. 张婷,逯腊虎,张伟,杨斌,袁凯,史晓芳.  小麦研究. 2018 (01)
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[10]国审小麦新品种周麦18号丰产性、稳产性及适应性分析[J]. 曹廷杰,王西成,赵虹.  中国农业科技导报. 2007(01)

博士论文
[1]普通小麦2D染色体株高和穗长QTL的精细定位与图位克隆[D]. 柴岭岭.中国农业大学 2019



本文编号：3653834