生长素反应因子ZmARF1的表达分析及互作网络探究

发布时间：2022-10-06 18:07

　　以抗旱型玉米自交系郑36和弱抗旱型玉米自交系B73为试验材料,利用克隆、qRT-PCR、亚细胞定位、互作蛋白预测等手段验证ZmARF1（GRMZM2G702026）对干旱胁迫的响应模式及初步探究ZmARF1基因的互作网络。克隆及测序分析表明,该基因含有1个2 034 bp的开放阅读框,翻译677个氨基酸。蛋白分析表明,该蛋白无跨膜域,属于高亲水性蛋白,亚细胞定位于细胞核。潜在磷酸化位点分析显示,ZmARF1蛋白含有潜在的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点数目分别为39、16、6个。复合进化树、功能域和保守motif分析表明,该基因蛋白与其他物种同源性较高,说明不同物种该基因在功能上较保守。ZmARF1属于组成型表达基因,受干旱胁迫的正向诱导,且郑36基因表达量上升幅度大于B73。预测的互作功能蛋白主要通过调节激素应答基因的表达、参与激素介导的信号等途径,来调控植物对逆境的胁迫应答和生长发育等过程。 

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 供试材料
    1.2 总RNA提取及cDNA的合成和qRT-PCR定量及数据分析
    1.3 ZmARF1转录因子cDNA克隆
    1.4 ZmARF1转录因子生物信息分析
    1.5 ZmARF1的亚细胞定位
2 结果与分析
    2.1 ZmARF1克隆和蛋白结构分析
    2.2 ZmARF1的系统进化及保守结构功能域分析
    2.3 ZmARF1基因组织表达模式分析
    2.4 ZmARF1基因对旱胁迫的响应分析
    2.5 ZmARF1基因的定位分析
    2.6 ZmARF1基因的互作蛋白网络预测
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]甘蓝ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析[J]. 卫聪聪,江定,吴根堃,陈长明.  北方园艺. 2017(19)
[2]辣椒ARF基因家族的鉴定与表达分析[J]. 魏瑞敏,谢玲玲,欧阳娴,张亚利,戴雄泽,刘峰.  西北植物学报. 2017(06)
[3]高粱生长素反应因子（ARF）基因的全基因组分析与进化研究[J]. 江海洋,魏巍,刘艳,朱苏文,程备久.  安徽农业大学学报. 2010(03)



本文编号：3687134