苎麻叶毡毛性状QTL定位分析

发布时间：2023-01-12 18:22

　　苎麻是我国特有的天然纤维作物,在我国南方地区也被广泛用作饲草。叶毡毛（属于表皮毛）性状是区别栽培苎麻和它的野生祖先青叶苎麻的一个显著形态特征,栽培种苎麻叶背布满白色而浓密的叶毡毛,而野生青叶苎麻叶背无白色叶毡毛。当苎麻被用作饲草时,过多的叶毡毛会影响它的粉碎加工性、饲用适口性等。故解析叶毡毛形成的遗传机制,并实现该性状遗传改良,将有助于改善苎麻的饲用品质。因此本研究深入开展了苎麻叶毡毛性状遗传基础研究,取得如下进展:（1）以无叶毡毛的野生青叶苎麻（QYZM）和有叶毡毛的栽培种中饲苎1号（ZSZ1）为亲本构建的叶毡毛性状F₂分离群体为材料,开展群体及两个亲本共113个家系高通量转录组测序,完成群体SNP分型,并构建绘制了苎麻高密度遗传图谱,图谱全长2118.8 cM,含1085个分子标记,在14个连锁群中分布均匀,标记间平均距离为1.98 cM。（2）收集F₂分离群体叶毡毛等性状表型数据结合遗传图谱完成了苎麻叶毡毛性状QTL定位,共检测到9个目的性状QTL,其中在第7和第13染色体分别检测到一个主效的叶毡毛性状QTL,qLT7和qLT13。同时... 

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
1.绪论
    1.1 苎麻简介
    1.2 表皮毛形成的调控机制
        1.2.1 拟南芥表皮毛起始的分子模型
        1.2.2 拟南芥表皮毛的发育
        1.2.3 转录因子对拟南芥表皮毛形成的影响
        1.2.4 非模式生物表皮毛的形成
    1.3 作物数量性状的遗传分析
        1.3.1 基于连锁作图的QTL定位
        1.3.2 基于连锁不平衡关联分析
        1.3.3 数量性状基因(QTL)克隆
    1.4 研究目的与意义
    1.5 研究内容和技术路线
        1.5.1 研究内容
        1.5.2 技术路线
2.材料和方法
    2.1 实验试剂与仪器
    2.2 群体构建与性状考察
    2.3 群体转录组测序
        2.3.1 cDNA文库构建
        2.3.2 测序
        2.3.3 基因表达定量分析
        2.3.4 差异表达基因分析
    2.4 SNP检测
    2.5 构建遗传连锁图谱
    2.6 QTL定位及GWAS分析
    2.7 BSA分析
    2.8 SSR分析
        2.8.1 群体基因组DNA提取
        2.8.2 SSR标记筛选
        2.8.3 凝胶电泳及银染分析
    2.9 候选基因筛选
        2.9.1 全基因组表达-性状相关性分析
        2.9.2 同源性分析
        2.9.3 序列变异分析
3 结果与分析
    3.1 群体表型数据
    3.2 转录组分析
        3.2.1 群体转录组测序
        3.2.2 亲本差异表达基因
    3.3 遗传连锁图谱
    3.4 叶毡毛及纤维相关农艺性状QTL定位
    3.5 定位qLT7和qLT13 物理区间
        3.5.1 BSA测序
        3.5.2 基于隐性重组单株确定QTL物理区间
    3.6 qLT13区间基因分析
        3.6.1 亲本间差异表达分析
        3.6.2 群体表达与性状相关性分析
        3.6.3 注释信息分析
        3.6.4 同源性分析
        3.6.5 亲本序列变异分析
4.讨论与结论
    4.1 讨论
        4.1.1 分子遗传图谱的构建
        4.1.2 叶毡毛和纤维及其性状的QTL定位
        4.1.3 叶毡毛性状主效QTL(q LT13)置信区间候选基因筛选
    4.2 结论
参考文献
致谢
作者简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]利用BSA-Seq方法鉴定向日葵耐盐候选基因[J]. 贾秀苹,卯旭辉,岳云,陈炳东,梁根生,王兴珍.  中国油料作物学报. 2018(06)
[2]玉米穗粗性状的全基因组关联分析及QTL元分析[J]. 邵晓宇,宋希云,潘顺祥,赵美爱.  植物生理学报. 2017(12)
[3]黄秋葵新品系比较试验[J]. 姚运法,李和平,练冬梅,赖正锋,洪建基.  福建农业科技. 2017(10)
[4]几种南方非常规饲料作物的营养成分及氨基酸组成[J]. 吴端钦,王郝为,侯振平,张旭,戴求仲.  草业科学. 2017(06)
[5]水稻数量性状（QTL）定位主要作图群体及统计方法概述[J]. 孙佳丽,彭锐,彭既明.  湖南农业科学. 2016(07)
[6]氮肥用量、刈割高度对饲用苎麻产量、营养品质及败蔸的影响[J]. 白玉超,郭婷,杨瑞芳,佘玮,曹诣,肖呈祥,崔国贤.  草业学报. 2015(12)
[7]不同苎麻与精料配合比饲粮对朗德鹅生长性能和肠道黏膜形态结构发育的影响[J]. 蒋桂韬,林谦,李闯,张旭,吴端钦,王向荣,黄璇,戴求仲.  家畜生态学报. 2015(11)
[8]牧苎0904饲用苎麻品种比较试验报告[J]. 汪红武,田宏,熊常财,涂修亮,付聪,李景柱,汤涤洛.  湖北农业科学. 2015(20)
[9]籼型恢复系镇恢46的选育[J]. 李闯,曾生元,盛生兰,周义文,林添资,景德道,余波,钱华飞,龚红兵.  杂交水稻. 2015(04)
[10]小麦株高相关性状与SNP标记全基因组关联分析[J]. 陈广凤,陈建省,田纪春.  作物学报. 2015(10)

博士论文
[1]水稻黄绿叶基因ygl1的图位克隆及功能分析[D]. 吴自明.南京农业大学 2007

硕士论文
[1]棉花分子遗传图谱构建和纤维品质QTL定位[D]. 王志伟.河北农业大学 2007
[2]苎麻纤维改性及染色性能的研究[D]. 杨亚妮.陕西师范大学 2007



本文编号：3730268