盐胁迫下水稻体内miRNA表达谱分析

发布时间：2023-01-15 18:40

　　miRNA是生物体内起重要调控作用的一类非编码小RNA分子,在转录后水平调控基因表达,参与生长发育、抗逆等生物学过程。高通量测序法是鉴定植物中miRNA最有效的方法之一。提取盐胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶部的总RNA,从中分离18～30 nt小分子RNA构建文库,进行高通量测序,对miRNA表达谱特性进行了分析。结果表明,所有样品共检测到248个已知的miRNA,来源于132个不同的家族,根、茎、叶中分别有31、11、9个差异表达miRNA,分属于29个家族,靶向592个功能基因,并对其中5个差异显著且与非生物胁迫相关的重要miRNA进行了qPCR分析检测,结果显示Osa-miR166h、Osa-miR166k上调表达,Osa-miR169h、Osa-miR530下调表达,针对Osa-miR169h的4个靶基因进一步定量检测,其中的3个靶基因上调表达,这与Osa-miR169h的下调表达结果相一致,以上结果说明miRNA在植物抵御非生物逆境胁迫的过程中扮演重要角色。 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
        1.1.1 供试水稻材料
        1.1.2 试剂与试剂盒
    1.2 水稻材料的培养与处理
    1.3 小RNA文库构建
    1.4 已知miRNA的获取
    1.5 差异表达miRNA分析
    1.6 靶基因预测及功能分类
    1.7 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)
2 结果与分析
    2.1 不同组织盐处理条件下的小RNA高通量测序
    2.2 水稻中小RNA的丰度变化
    2.3 差异表达的已知miRNA
        2.3.1 根部差异表达miRNA
        2.3.2 茎部差异表达miRNA
        2.3.3 叶部差异表达miRNA
    2.4 miRNA的靶基因预测与GO分类
    2.5 荧光定量分析差异基因
        2.5.1 miRNA验证
        2.5.2 靶基因验证
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]盐、干旱胁迫下水稻相关miRNA的鉴定及表达分析[J]. 彭廷,文慧丽,赵亚帆,王博博,金玉蔓,孙红正,赵全志.  华北农学报. 2018(02)
[2]盐穗木miRNA417的克隆及对种子萌发和幼苗成活率的影响[J]. 鲍乾,徐涛,张富春.  植物研究. 2011(04)
[3]盐胁迫条件下不同耐盐棉花miRNA差异表达研究[J]. 李春贺,阴祖军,刘玉栋,沈法富.  山东农业科学. 2009(07)



本文编号：3731367