氮胁迫下小麦叶片转录组分析

发布时间：2023-04-25 03:08

　　氮素是小麦生长发育过程中重要的营养元素,利用转录组技术鉴定参与小麦低氮胁迫分子调控网络的基因,对揭示小麦耐低氮分子机理、开展耐低氮育种具有重要参考意义。采用Illumina Hiseq^TM 2500高通量测序技术,对小麦品种晋麦47正常生长和低氮胁迫下的叶片进行转录组测序,筛选差异表达基因并在GO、KEGG数据库中进行比对注释,分析小麦低氮胁迫响应相关基因。结果显示,对照组与低氮组分别获得高质量序列52 383 726和52 192 061条,检测到差异表达基因1 267个,其中上调表达基因179个,下调表达基因1 088个。差异基因GO功能注释到3个大类的44个功能组。差异表达基因被注释到178个途径上,主要富集于氨基酸代谢、碳水化合物代谢、脂类代谢和信号传导等途径。转录因子分析发现,在低氮条件下变化明显的转录因子家族包括WRKY、MYB和NAC等。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料培养及处理
    1.2 转录组测序
    1.3 转录组数据的组装
    1.4 差异表达基因分析
2 结果与分析
    2.1 测序数据分析
    2.2 转录组NR库注释
    2.3 转录组COG注释
    2.4 低氮胁迫下差异表达基因的筛选
    2.5 叶片差异表达基因GO富集分析
    2.6 叶片差异表达基因KEGG通路显著性富集分析
    2.7 转录因子
    2.8 差异表达基因蛋白互作网络分析
3 讨论



本文编号：3800579