谷子PEPC基因的鉴定及其对非生物逆境的响应特性
发布时间:2023-06-06 19:56
磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvatecarboxylase,PEPC)是C4植物光合作用关键酶,并在植物多种代谢途径及逆境信号应答过程中起重要作用。本研究通过序列比对,从谷子基因组中筛选出6个SiPEPC候选基因。SiPEPC蛋白特征参数相似度很高,序列非常保守,都含有PEPC基因特征功能域PEPcase Motif。SiPEPC成员主要被定位在细胞质、细胞核和线粒体。在SiPEPC成员启动子序列中含大量有光、激素、逆境以及其他生长调控相关的顺式应答元件。苗期逆境qRT-PCR表达谱分析表明,5个SiPEPC基因(SiPEPC1、SiPEPC2、SiPEPC3、SiPEPC5、SiPEPC6)不同程度受ABA、PEG、高盐和低温诱导表达,表明其参与了苗期对非生物逆境的响应。5个SiPEPC基因表达量在正常生长条件下随着谷子的生长呈增强趋势,且在不同生育时期干旱胁迫下明显增加,表明其参与了拔节、抽穗、灌浆期的干旱胁迫应答。拔节期弱光可诱导5个SiPEPC基因的表达,而在拔节期中等强度光照以及抽穗期和灌浆期的中等光照和弱光照下表达量均急剧降低,揭示光照强度严重影响...
【文章页数】:12 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验设计
1.3 谷子PEPC基因的鉴定及基因结构、蛋白序列分析
1.4 总RNA提取、cDNA合成及引物设计
1.5 Real-time PCR分析
2 结果与分析
2.1 谷子PEPC基因成员鉴定与参数分析
2.2 SiPEPC蛋白亚细胞定位预测和启动子区域顺式元件分析
2.3 PEPC序列比对及进化分析
2.4 SiPEPC家族基因苗期非生物逆境胁迫下表达分析
2.5 不同生育期干旱胁迫及不同光照强度下表达分析
3 讨论
4 结论
本文编号:3832120
【文章页数】:12 页
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1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验设计
1.3 谷子PEPC基因的鉴定及基因结构、蛋白序列分析
1.4 总RNA提取、cDNA合成及引物设计
1.5 Real-time PCR分析
2 结果与分析
2.1 谷子PEPC基因成员鉴定与参数分析
2.2 SiPEPC蛋白亚细胞定位预测和启动子区域顺式元件分析
2.3 PEPC序列比对及进化分析
2.4 SiPEPC家族基因苗期非生物逆境胁迫下表达分析
2.5 不同生育期干旱胁迫及不同光照强度下表达分析
3 讨论
4 结论
本文编号:3832120
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