艾草可燃性特征的转录组学研究

发布时间：2023-10-21 09:49

　　目的探讨艾草可燃性特征的转录组学基础。方法采摘新鲜艾草后分别提取叶、根、茎组织的总RNA并建立3个组织的cDNA文库,进行高通量测序。对测序后的原始读段进行过滤得到高质量读段,使用Trinity软件对高质量读段进行de novo组装得到功能基因,再对功能基因进行京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)注释和表达量的计算。结果艾草高通量测序获得99 807个功能基因,与KEGG数据库比对后得到萜类和纤维素合成的代谢通路,发现参与萜类物质合成的相关基因有116个,编码16种关键酶;参与纤维素合成相关基因有119个,编码5种关键酶。在萜类物质合成的关键酶基因中,叶、根、茎组织中都仅存在1个MVD基因和2个CMS基因,并且这3种关键酶基因均在叶中的表达水平最高。结论艾草中存在许多参与萜类和纤维素合成的关键酶基因,但其最关键的限速酶在艾叶中的表达量比根、茎高,这可能是艾叶作为灸材的关键因素之一。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 植物材料与cDNA文库的制备
    1.2 转录组测序与数据组装
    1.3 功能基因的KEGG注释与表达量计算
2 结果
    2.1 转录组测序结果
    2.2 代谢途径分析
        2.2.1 单萜类与倍半萜类生物合成相关基因的鉴定与分析
        2.2.2 纤维素合成途径分析
3 讨论



本文编号：3855598