陆海渐渗系纤维长度QTL(qFL-12-2)精细定位与候选基因鉴定
【文章页数】:123 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图2-1棉花染色体片段代换系的培育方案??Fig.2.1?The?cultivating?program?of?the?CSSLs??2.1.4基因组DNA提取??
实验的亲本材料为优质渐渗系MBI7747和中棉所45?(表2-1)。MBI7747??是以陆地棉中棉所45为受体和海岛棉海1为供体构建的由332个染色体片??段渐渗系组成的群体(BC4F3:5)中选取的一个纤维品质优异渐渗系(图2.1)。??中棉所45抗虫性强,产量高,纤维品质性....
图4-1生物信息分析流程图??Fig?4-1?The?flow?chart?of?bioinformatics?analysis??4.1.4.2差异表达基因分析??[184]
4.1.4生物信息学分析??研宄用的实验材料主要为陆地棉及陆地棉背景下的海陆渐渗系材料,故本研??宄后续分析以陆地棉基因组为参考基因组[157]。整个分析思路及流程见图4-1。??4.1.4.1数据过滤与处理??利用Hiseq2000?v4测序平台完成样品的转录组测序,测序模式为....
图4,3不同祥本间主成分分析
Fig?4-3?The?principal?component?analysis?among?different?samples??结果显示,在取样的的6个时间点(7DPA、10DPA、15DPA、20DPA、25DPA),??2优质渐渗系MBI7747与MBI7561更多的聚合....
图4-5纤维伸长期4个阶段差异基因交集
XLOC_025348与XLOC_026944,全为?LncRNA,这?2?个?LncRN还需要进一步的研宄。另外,还可以看出,在纤维伸长期的各阶特有的差异基因的数量明显高于与其它阶段共有的差异基因,这纤维伸长的调控是个动态变化的过程。??1QDPA?15DPA??^^""""^....
本文编号:3926254
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