水稻种质资源外观和加工品质的全基因组关联分析

发布时间：2024-03-23 11:49

　　水稻是我国第一大粮食作物,随着人们生活水平的日益提高,优质高产已经成为国内外水稻育种的重要目标。稻米外观与加工品质性状是典型的数量性状,由多基因控制并且受环境影响。迄今利用不同定位群体和定位方法,一些重要的控制稻米外观与加工品质及其相关性状的位点和基因已经被克隆,然而真正应用到育种实践的位点或基因较少。起源于不同地域的种质资源中往往蕴藏着大量有利等位基因,基于变异丰富的种质资源的全基因组关联分析是当前有利基因挖掘方面热门方法,但该方法在稻米外观和加工品质性状上的研究尚不多。本研究以732份遗传变异丰富的水稻种质资源(来自3000份水稻重测序项目)为试验材料,在2个环境(海南三亚、广东深圳)下考察8个水稻外观与加工品质(粒长、粒宽、长宽比、垩白粒率、垩白度、糙米率、精米率和整精米率)的表型,结合全基因组分布的404 K高质量SNP全基因组关联分析,挖掘控制稻米外观和加工品质的关键位点,探讨控制稻米外观和加工品质的遗传机制,以期为通过分子途径加速培育优质高产水稻新品种提供指导信息。主要结论如下:1.试验材料起源地多样化,表型变异丰富。732份材料共来自56个国家或地区。在海南,表型范围分别...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1基于候选基因的关联分析技术路线

图1基于候选基因的关联分析技术路线Fig.1Theframeworkofassociationanalysisbasedoncandidate-genetesting

图2基于全基因组的关联分析技术路线

6图2基于全基因组的关联分析技术路线Fig.2Theframeworkofassociationanalysisbasedongenomescan

图4水稻种质资源分类Fig.4Classificationofriceaccessionsintofivedistinctvarietalgroups注：系统进化树引自http://gigascience.biomedcentral.com/Data:TheTreecomefromhttp://gigascience.biomedcentral.com/

图4水稻种质资源分类Fig.4Classificationofriceaccessionsintofivedistinctvarietalgroups注：系统进化树引自http://gigascience.biomedcentral.com/Data:....

图5籼稻亚群加工品质性状的曼哈顿散点图

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本文编号：3935875