小麦TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2基因的克隆与表达分析

发布时间：2024-03-27 23:58

　　为了探究小麦(Triticum aestivum L.)WRKY基因的功能,采用同源克隆的方法,从小麦品种‘科农199’中克隆得到2个WRKY基因,分别命名为TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2,并对其进行生物信息学分析和不同逆境胁迫下的表达分析。生物信息学分析显示,TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2基因都含有2个内含子和3个外显子,分别编码206和138个氨基酸,编码蛋白都属于亲水性不稳定非分泌型的核蛋白。系统进化分析表明,TaWRKYⅢ-A37蛋白与其两个同源拷贝的亲缘关系最近,而TaWRKYⅡc-D2蛋白与粗山羊草亲缘关系最近。qRT-PCR结果表明,TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2基因在小麦根、茎和叶中均有表达,前者在根中表达量最高,后者在叶中表达量最高,二者均在茎中低表达;在苗期TaWRKYⅢ-A37基因受到PEG、H₂O₂和ABA胁迫后表达上调,NaCl处理后4～8 h内表达下调且低于对照表达水平,而且在灌浆期受到PEG、NaCl、H₂O₂和ABA胁迫...

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【部分图文】：

图1小麦TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2

利用DNAMAN8.0对2条氨基酸序列比对分析后发现TaWRKYⅢ-A37基因含有一个位于第39～45个氨基酸之间的WRKYGEK保守结构域和位于第58～93个氨基酸之间C2HC型的锌指结构,属于第Ⅲ类WRKY基因家族。TaWRKYⅡc-D2基因含有一个位于第51～57个氨基酸之....

图2TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2蛋白亲/

为了探究TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2基因的表达与调控,通过PlantCARE网站分析了2个基因启动子区的顺式作用元件。如图5所示,2个基因均有34种顺式作用元件,其中参与光响应的顺式作用元件种类最多,各有5种,Box4和G-box是2个基因共有的光响应顺式作....

图3TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2蛋白磷酸化位点预测

将TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2氨基酸序列提交到NCBI-Blast中比对,发现2条氨基酸序列与葡萄(Vitisvinifera)、糜子(Panicummiliaceum)和弯叶画眉草(Eragrostiscurvula)等的氨基酸序列相似性较高,下载这13....

图4TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2蛋白二级结构预测

图3TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2蛋白磷酸化位点预测图5TaWRKYⅢ-A37和TaWRKYⅡc-D2基因启动子区的顺式作用元件

本文编号：3940691