半枝莲、夏枯草萜类生物合成相关基因的鉴定及功能研究

发布时间：2024-04-20 11:18

　　半枝莲Scutella barbata 和夏枯草Prunella vulgaris属于唇形科植物。半枝莲是一种重要的药用植物,广泛应用于中国、韩国、印度等亚洲国家。新克罗烷型二萜类化合物是半枝莲中主要的活性成分,对多种癌细胞具有良好的细胞毒性。夏枯草是唇形科分布最广泛的物种,是一种常用的中药材及草药制剂。三萜类化合物是夏枯草的主要活性成分。本论文通过对半枝莲和夏枯草不同组织进行Illumina测序及分析,系统克隆萜类化合物生物合成途径中的基因,并对部分二萜合酶基因进行了功能鉴定,为唇形科植物萜类化合物多样性的产生机制以及特定萜类化合物的生物合成途径研究奠定了基础。主要研究结果如下:1、首先对半枝莲和夏枯草的不同组织进行转录组测序及组装。提取半枝莲的根(BZLR)、茎叶(BZLS)、花(BZLF)三个组织的RNA;夏枯草的根(XKCR)、茎叶(XKCS)、花穗(XKCF)以及未成熟的种子(XKCZ)四个组织的RNA。每个组织分别进行两次重复。将半枝莲中121,958,564条clean RNA-sequence reads 组装成 88,980 个转录本,共计 52,211 个 unig...

【文章页数】：78 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１－３．半枝莲主要的具有药用活性的二萜类化合物

和灌木［３８］。《中国药典》［３９］收录了半枝莲ｉＳｃｗｆｅ／Ｚａｒ／ｆｌ?和黄岑５１．?Ａａ／ｃａ／ｅｒａｈ??两种植物，并从该属植物中分离出１５０多种新克罗烷型二萜。这些新克罗烷型二萜??类化合物对多种癌细胞系具有明显的细胞毒性［４０－４４］。Ｓｃｕｔｅｂａｔｉｎ?Ａ?（图１....

图１－４．夏枯草植物及其代表性蔽类化合物

?ＳｃｕｔｅｂａｒｂａｔｉｎＥ?ＳｃｕｔｅｂａｒｂａｔｉｎＦ??图１－３．半枝莲主要的具有药用活性的二萜类化合物。Ａ：典型的新克罗烷型二萜类化合物??ｓｃｕｔｅｂａｔｉｎ?Ａ，?ｓｃｕｔｅｂａｔｉｎ?Ｂ，ｓｃｕｔｅｂａｔｉｎ?Ｃ?和?ｓｃｕｔｅｂａｔｉｎ?Ｄ。Ｂ：新克罗院型二￥５....

图３－１．半枝莲、夏枯草植株及总ＲＮＡ琼脂糖凝胶电泳图??Ｆｉｇｕｒｅ?３－１．?Ｔｈｅ?ｐｌａｎｔ?ａｎｄ?ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ?ｏｆ?Ｓ．?ｂａｒｂａｔａ?ａｎｄ?Ｐ．?ｖｕｌｇａｒｉｓ??

图３－１．半枝莲、夏枯草植株及总ＲＮＡ琼脂糖凝胶电泳图??Ｆｉｇｕｒｅ?３－１．?Ｔｈｅ?ｐｌａｎｔ?ａｎｄ?ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ?ｏｆ?Ｓ．?ｂａｒｂａｔａ?ａｎｄ?Ｐ．?ｖｕｌｇａｒｉｓ??总ＲＮＡ进行琼脂糖凝胶电泳检测可见除个别样品外，总ＲＮＡ基本完整（图??３－１．Ｃ）。随....

图３－３．半枝莲（Ａ）和夏枯草（Ｂ）的ＧＯ注释结果??Ｆｉｕｒｅ３－３．?Ｓｕｍｍａｒｏｆ?Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏａｎｎｏｔａｔｉｏｎ?ｆｏｒ?ａｌｌ?ＵｎｉＧｅｎｅｓ??

??３３３２３个ｕｎｉｇｅｎｅｓ?（５４．４７％）至少在其中的某一个数据库中得到了注释（图３－２Ｂ，??３－３Ｂ）?〇??表３－３．夏枯草组装ｄｅ?ｎｏｖｏ组装结果??Ｔａｂｌｅ?３－３．?Ｓｔａｔｓ?ｆｏｒ?ａｌｌ?ｄｅ?ｎｏｖｏ?ａｓｓｅｍｂｌｅｄ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ?ｃｏ....

本文编号：3959332