小麦WRKY转录因子的全基因组鉴定及其水分亏缺下的差异表达

发布时间：2024-05-17 23:05

　　WRKY蛋白是植物中的大型转录因子,其N端保守七肽WRKYGQK可与靶基因的顺式作用元件W-box特异性结合调控下游基因表达,从而参与植物对于多种生物及非生物逆境的防御反应。近年来,WRKY转录因子在大豆、水稻、拟南芥等作物中的研究已比较广泛。对小麦基因组中WRKY基因进行全基因组鉴定和分析,有助于完善该家族信息,为进一步研究WRKY基因的功能奠定基础,本研究采用系统发育分析、基因结构分析、motif分析、顺式作用元件分析等生物信息学手段,对小麦中WRKY家族进行综合分析。以拟南芥干旱胁迫响应相关WRKY在小麦中的同源WRKY为候选基因,利用qRT-PCR技术探究水分亏缺下WRKY在小麦旗叶及穗部的表达模式。主要获得以下主要结果:1.在所选20种植物中共鉴定1113个WRKY转录因子,其中大部分陆生植物含有WRKY的数量为86-171,而水生植物中为0-6个,其中灰藻和红藻中未鉴定到WRKY。从水生植物到陆生植物,WRKY家族成员数量得到了扩增。在小麦中共鉴定到171个WRKY,依据其在染色体上的位置命名为TaWRKY1-171,获得较为完整的小麦WRKY转录因子家族信息。2.基于系统...

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2-120个物种的系统进化关系

10小麦WRKY转录因子的全基因组鉴定及其水分亏缺下的差异表达有氨基酸序列中都至少含有1个WRKY结构域。由这些现象可以发现：大多数高等植物中的WRKY数量多于低等植物，这表明WRKY转录因子在植物的进化进程中可能有重要作用。初步推测：植物WRKY基因家族....

图2-2小麦及拟南芥中WRKY结构域（WD）的系统进化树

图2-2小麦及拟南芥中WRKY结构域（WD）的系统进化树。Figure2-2PhylogenetictreeofWRKYdomains(WDs)fromwheatandArabidopsis.利用MEGA7.0，基于小麦（171）及拟南芥（91）WD....

图2-3小麦WRKY基因的染色体定位

图2-3小麦WRKY基因的染色体定位。Figure2-3ChromosomedistributionofTaWRKYgenes.每个TaWRKY基因在染色体上的排布依照小麦基因组定位。染色体编号位于染色体上端。56个（TaWRKY116-171）位于s....

图2-4小麦WRKY蛋白的保守motif示意图

图2-4小麦WRKY蛋白的保守motif示意图。Figure2-4SchematicdiagramofconservedmotifsinTaWRKYs.同家族或亚家族TaWRKY的motif分布。方块代表TaWRKY蛋白的保守motif，....

本文编号：3976101