甘蔗属割手密种NBS-LRR家族基因的演化与表达分析

发布时间：2024-05-20 01:30

　　甘蔗是全世界最重要的糖料和能源作物。在自然栽培条件下,病虫害是影响甘蔗产量的重要因素。目前世界上已知的甘蔗病害已达160多种,我国发现的有60多种。其中大陆蔗区发生的大约50种,常见的甘蔗病害有宿根矮化病、凤梨病、线虫病等。一般为了控制植物疾病的发生和提高作物产量,人们会直接采用喷洒农药的方式,但农药的使用不仅会使病原体的耐药性增强,而且药物的累积,会造成土壤、水源以及空气污染,最终会对人体健康造成威胁。植物本身就有一系列抵御外界病原体侵害的系统,植物疾病抵抗基因可以编码抵抗蛋白用来阻止外源病原体入侵。这类基因中最为重要的便是NBS-LRR基因。现代甘蔗栽培种是由热带种和割手密种杂交而来,这些杂交栽培种的高糖特性来自于热带种,而抗病虫害等抗逆性的遗传属性来自于割手密。因此本研究选择抗逆性和抗病性较强的甘蔗割手密种为研究材料,综合应用生物信息学手段对甘蔗割手密种全基因组的NBS-LRR基因家族进行分类与演化分析,并与单双子叶代表性的植物,拟南芥、菠萝、无油樟、水稻、玉米和高粱进行聚类分析与结构比较。研究的结果将为甘蔗抗病基因的分子机制和分子育种提供重要的理论参考。本研究获得的主要结果如下...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图３两种主要的植物Ｒ蛋白结构示意图［４４］??

福建师范大学陈阳硕士学位论文??结合位点－Ｄ?（ＲＮＢＳ－Ｄ）和［３２，３３］。在ＡＲＣ１亚结构域中的两个主要基序是，ＧＬＰＬ??ＧｘＰ和ＶＩＩ，二者都参与核苷酸结合［２６，３５，３６］。分布在ＡＲＣ２亚结构域的基序为基??ＶＩＩＩ、ＲＮＢＳ－Ｄ、基序Ｘ和ＭＨＤ［２４－２６］。Ｍ....

图1.1无油樟IVBS基因系统演化关系(CNL",CN",TNL},TNT,NL",N)

福建师范大学陈阳硕士学位论文???根据ＮＢＳ结构域的同源性，可以通过序列比对和绘制系统发生树，来研究其演化过??程。通过对无油樟全基因组序列鉴定的结果，共得到了具有ＮＢＳ结构域的抗病基??因５１个，对分析得出的５１个无油樟ＮＢＳ类型抗病基因蛋白质序列中的ＴＮＬ??（ＴＩＲ－ＮＢＳ....

图1.2甘蔗割手密种NBS类型蛋白质系统发生树(CNL",CNo,NL和N")

ＣＮ?Ｉ＾ＮＬ＃和ｃｔｅｄ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ?ｆ

图I.3甘蔗割手密种全基因组NBS-LRR类型蛋白质系统发生树(CNL▲和NL1)

第一章甘蔗ＮＢＳ－ＬＲＲ家族基因的鉴定与演化分析??＝??

本文编号：3978751