大豆DNA去甲基化酶GmDMEs的功能解析

发布时间：2024-07-05 19:19

　　表观遗传学是指在基因的DNA序列不发生改变的情况下,基因的表达或表型发生可遗传改变的现象。甲基化是DNA的一种化学修饰,是一种相对稳定和可遗传的表观遗传标记,对许多生物过程至关重要。在生物体内DNA甲基化和去甲基化的动态平衡控制着基因表达强度。DME(DEMETER)是DNA去甲基化所需的一种糖基酶,在拟南芥中dme突变体使胚乳中的DNA甲基化升高,并且影响胚乳的发育。在苜蓿中dme突变后会影响根瘤的发育。但大豆中DME蛋白的具体功能尚不清楚。因此在本研究中,以大豆为试验材料,利用CRISPR/Cas9技术构建了 GmDME突变体,并对突变体进行甲基化分析和表型观察,以进一步解析DME的功能。本研究主要结论如下:1、生物信息学分析显示,在大豆基因中存在两个较高相似度的拷贝,GmDMEa(Glyma.20G1 88300)和GmDMEb(Glyma.10G202200),都具有 ENDO3c 结构域和RRM_DME结构域。GmDMEa基因CDS区全长5553bp编码1850个氨基酸,GmDMEb基因CDS区全长4290bp编码1429个氨基酸。DME在植物界是比较保守...

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【部分图文】：

图１－１?ＲＯＳｌ／ＤＭＥ介导的植物主动ＤＮＡ去甲基化??

３’－０Ｈ基团［２４，２６］，而??ＡＰＥ１Ｌ蛋白可以加工３＇－ＰＵＡ末端产生Ｖ－ＯＨ末端［２７］，所以ＺＤＰ和ＡＰＥ１Ｌ产生３’－０Ｈ??的反应是作为两个独立的分支共同参与ＲＯＳ１／ＤＭＥ介导的ＤＮＡ去甲基化过程的。甲基??化的胞嘧啶被切除以后，未甲基化的胞嘧啶如何填补缝隙这一....

图１－３改良后ＣＲＪＳＰＲ７Ｃａｓ９作用机制图（引自ＣｈｅｎＷｅｔａｌ．?２０１７）??１．７研究的目的与意义??

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图２－１拟南芥、苜蓿、大豆基因结构图??２．４．１．２大豆ＤＭＥ蛋白的结构预测和多序比对??

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图２－２拟南芥、苜蓿、大豆ＤＭＥ蛋白结构预测??

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本文编号：4001406