微卫星标记对鲤的两个育成品种遗传背景分析和遗传评价体系建立

发布时间：2020-04-29 20:03

【摘要】：在我国淡水养殖水产生物的品种中,鲤鱼是养殖量最多、最集中的品种(品系),其中有些品种还可以作为我国独特拥有的养殖品种。鲤鱼经历了长期的人工选择和严酷的自然选择,这使得其在表型上表现出较高的多态性,且在生化遗传上表现出较高的杂合性,同时在群体结构上也具有较高的多态性。增加鲤鱼杂交优势的利用,可以为鲤鱼品种选育提供丰富的原始材料,降低对品种进行稳定选育时所带来的难度。通过对鲤鱼群体遗传多样性和遗传结构的研究,在生产上进行分子标记辅助育种,可以有效地保护鲤鱼的种质资源。同时开发、完善种质评价的各种遗传指标,揭示种质资源的特性、遗传发育与进化规律,最终达到对重要种质资源的深度发掘和对育种成果的准确客观评价。以便促进我国水产种业的能够稳定保持并且沿着健康可持续的路线进行发展。利用微卫星标记对鲤新的育成品种---易捕鲤的遗传背景进行分析。研究表明:利用30对微卫星标记以96尾易捕鲤个体的基因组DNA为模板进行PCR扩增,根据扩增结果将所得的基因型差异利用生物软件对各种遗传参数进行分析。结果显示:在96尾易捕鲤个体中含有的等位基因总数达到了154个,其中每个位点所检测到的等位基因数范围在3~9,有效等位基因数的平均值为4.0607;期望杂合度主要分布在0.5969~0.8710,平均值为0.7400;多态信息含量计算平均值为0.7022,主要分布在0.6280~0.8550,由此说明此品种具有较丰富的遗传多样性;对此群体进行哈迪-温伯格平衡检验,结果显示现阶段群体处于不平衡状态;平均固定系数为-0.0410,说明该群体因受选择压力的影响存在杂合子过剩现象;并且检测到群体在目前阶段经历过了瓶颈效应;有效群体大小依连锁不平衡方法进行计算,结果为64.2。该研究表明此品种具有较高的遗传异质性和较大的选育空间,但由于人工选择的作用,群体处于不平衡状态,对于品种长期有效地发展将产生不利的影响,因而下一步选育工作的重点是:如何有效地对其保种策略进行研究,以便维持其丰富的遗传多样性和优良的经济性状。选用50个微卫星标记检测松浦镜鲤F8的遗传背景。结果表明:本研究从育成品种松浦镜鲤F8代中随机选取200尾个体,并且对所选取的所有个体进行PIT标记。在50对微卫星标记下对所选取个体的遗传结构进行检测。群体平均等位基因数(A)和有效等位基因数(Ae)分别为4.9600和2.4708,平均期望杂合度(He)值和多态信息含量(PIC)分别为0.5141和0.4576,由此说明该选育群体的遗传多样性的水平较高;通过对50个位点进行哈迪-温伯格平衡检验的结果显示:其中显著或极显著偏离平衡的位点有32个,这可能是人工选择压力的结果;计算有效群体大小为22.5,瓶颈效应检查的结果是:近期内群体可能经历了遗传瓶颈。通过对松浦镜鲤F8的遗传变异进行系统的研究,对该种群的遗传结构有了较深刻的了解,为松浦镜鲤选育群体F8的进一步繁育提供理论支持。利用微卫星标记研究3个鲤鱼育成品种的遗传结构和遗传多样性,在样本容量和标记数上设置不同的梯度,分析各种遗传参数变化趋势。结果表明:3种育成品种遗传多样性参数:平均有效等位基因数、平均期望杂合度、平均多态信息含量在样本量50以上标记数25以上时趋于稳定。对于遗传结构有效群体大小的计算结果是:当样本量在60以上标记数22以上时趋于稳定。对一个群体进行正确且有效的遗传评价时,所选样本容量大小、标记数量多少都有较大的影响,通过本研究建议用微卫星标记对一个育成品种进行有效的遗传评价时,样本容量在60以上标记数在25以上时较为合适。
【图文】：

位点,等位基因频率,基因频率,微卫星位点

布在 0.6280~0.8550 的范围之内，平均值为 0.7022。计算结果显示：在本实验选取的微卫星位点都是高度多态性（P≥0.5）的位点。通过计算等位基因频率布可知，，96 尾个体 30 标记中等位基因频率在 0.0~0.3 所占比例较大，等位基率分布比例属于非 L‖形状（图 2-2）。

等位基因频率

HLJ1556 4 3.4556 0.8333 0.7143 0.0896 0.6930 -0.1727HLJ855 4 3.7825 0.7812 0.7395 0.0852 0.6960 -0.0620HLJ3850 4 3.6007 0.8021 0.7261 0.4151 0.6950 -0.1105HLJ3993 4 3.7848 0.8021 0.7396 0.0129 0.6630 -0.0901HLJ3617 4 3.2196 0.2917 0.6930 0.0000 0.6850 -0.5769HLJ3999 4 3.3820 0.6042 0.7080 0.0858 0.7370 0.1422HLJ2545 5 4.3730 0.7396 0.7754 0.1338 0.7620 0.0411HLJ2369 6 4.9642 0.8229 0.8027 0.0000 0.7020 -0.0305HLJ328 5 2.8823 0.5000 0.6565 0.0001 0.7140 0.2344HLJ392 5 4.0860 0.6771 0.7592 0.0000 0.6990 0.1035HLJ740 4 2.8493 0.4688 0.6524 0.0005 0.6350 0.2778HLJ690 5 3.9673 0.7396 0.7519 0.0157 0.7520 0.0112HLJ1115 5 4.7334 0.8542 0.7929 0.0004 0.7200 -0.0830HLJ1515 4 2.5725 0.7396 0.6145 0.1218 0.6440 -0.2099HLJ3554 5 3.9234 0.8854 0.7490 0.0000 0.7020 -0.1883HLJ3948 5 3.8336 0.9271 0.7430 0.0000 0.6860 -0.2543HLJ3954 4 3.5617 0.6979 0.7230 0.0431 0.6990 0.0296Average 5.133 4.0607 0.7035 0.7400 0.7022 -0.0410
【学位授予单位】：上海海洋大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：S917.4

【参考文献】