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水生动物疫病病原LAMP检测方法的建立

发布时间:2020-05-28 00:26
【摘要】:目的:本研究旨在针对真鲷虹彩病毒(Red sea bream iridovirus、锦鲤疱疹病毒(Koi herpes virus, KHV)、流行性造血器官坏死病毒(Epizootie hematopoietie necrosis virus, EHNV)、鲤春病毒血症病毒(Spring viremia of carp virus, SVCV)、传染性造血器官坏死病毒(Infectious haematopoietic necrosis virus、病毒性出血性败血症病毒(Viral hemorrhagic septicemia virus, VHSV)这六种病毒的宿主不同建立多重LAMP (Loop mediated isothermal amplification)检测方法,该方法是对同一宿主体内的不同病原同步进行检测,这大大节省了检测时间和成本。方法:针对这六种病毒建立了单重LAMP检测方法,对其反应条件进行了优化,并检测了敏感性和特异性。在上述实验的基础上根据宿主不同分别组装多重LAMP反应体系,并检测了其特异性和敏感性。酶切鉴定更进一步验证该方法的特异性。结果:这六种病毒的单重LAMP检测方法的最低检测限分别为:100拷贝/μL,10拷贝/μL,ITCID50,10拷贝/μL,ITCID50, ITCID500且与其它几种重要的水生动物疫病病原无交叉反应,说明建立的LAMP检测方法特异性好。研究二建立的KHV和SVCV的多重LAMP最低检测限达到100拷贝/μL。与其它几种重要的水生动物疫病病原无交叉反应,显示该方法特异性好。与单重LAMP相比,敏感性有所降低。研究三建立的EHNV. IHNV和VHSV的多重LAMP最低检测限是ITCID500与几种重要水生动物疫病病原不发生交叉反应,有良好特异性。对LAMP扩增产物分别采用特定限制性内切酶进行消化,结果表明,与预期酶切片段相符合,可以实现特异性检测的目的。结论:以单重LAMP检测方法为基础,优化反应体系,组建了多重LAMP检测方法,实现了从同一宿主中同时检测多种病毒的目的。
【图文】:

分布图,引物,分布图,种类


民SIV-LF化SIV-LB)(如下表邋1,图邋2)。逡逑表1;邋RSIV的LAMP引物逡逑Tablel邋:LAMP邋primers邋of邋民SIV逡逑弓I物逦种类逦引物序列(5’-3’)逡逑Primer逦Type逦Primer邋Seqence逡逑艮邋SIV-巧逦上游外引物逦CAAGAATGTCACTCACCGCA逡逑民邋SIV-B3逦下游外引物逦CACCATCCATCTCAGGCATG逡逑民SIV-FIP逦,,山GCCAGCAAAGGCAGATTCACCTA逡逑上俯内引物逡逑CGTGCAAAGCAATTACACC逡逑民邋SIV-BIP逦干、化逦TTACGAGAACACCCCTCGGCTAG逡逑下游内引物逡逑GGGTCGACAGATGTGA逡逑民邋SIV-LF逦上游环引物逦CCACCAGATGGGAGTAGACTAC逡逑艮邋SIV-LB逦下游环弓邋I邋物逦TGTTGACATACACGGGACTGG逡逑1邋巧GAjyP:CT邋T

本文编号:2684396

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