翘嘴鳜肌肉及肝脏miRNA的节律性表达分析

发布时间：2020-08-17 17:39

【摘要】：昼夜节律又称近日节律,是机体行为、生理和生化呈近似24h周期性变化的规律,在所有动物确定睡眠和进食模式中起重要作用,并与生理周期的脑波活动、激素生产、细胞再生及其它生理活性模式相关联。目前对昼夜节律的机理研究主要在转录水平和翻译后修饰,而转录后水平的研究还少有报道。MicroRNAs (miRNAs)与其靶基因3'非翻译区(3'-UTR)元件的相互作用,靶向调节mRNA稳定性和翻译,因此,miRNA在调节动物生长、繁育和疾病产生进程中起重大作用。然而miRNA作为重要的转录后调节因子,其在鱼类昼夜节律调节的生物学功能尚未见报道。因此本研究以翘嘴鳜为研究对象,构建翘嘴鳜红肌和其它5个混合组织的小RNA文库,然后利用Solexa高通量测序技术对小RNA文库中的片段进行测序。采用实时荧光定量PCR技术检测翘嘴鳜红肌、白1肌和肝脏组织相关miRNA在12h：12h光／暗周期(LD光制)条件下的表达水平,分析了筛选后的miRNA在翘嘴鳜红肌、白肌和肝脏组织内表达的昼夜节律性,以及miRNA之间表达相关性。本研究结果如下：1利用Solexa高通量测序结果鉴定出了翘嘴鳜红肌组织的204个miRNAs,在混合组织文库中鉴定出了的217个miRNAs,其中包括2个新miRNAs,这些结果大量丰富了鱼类miRNA数据库。2对从红肌文库中筛选出的42个miRNAs进行了昼夜节律性表达分析研究。在翘嘴鳜红肌组织中21个niRNAs具有显著的昼夜节律性,包括高表达的miR-206、miR-107和miR-133等10个miRNAs,以及相对较低表达的niR-29、miR-31和miR-375等11个miRNAs。多数miRNAs彼此之间存在正相关性,其中miR-133和miR-206呈正强相关性,而miR-499与部分miRNA存在负相关关系。翘嘴鳜白肌组织有35个miRNAs存在昼夜节律表达,包括高表达的miR-1、miR-10和miR-21等18个niRNAs,以及相对较低表达的miR-338、miR-31 和 miR-93等17个miRNAs。这些miRNAs彼此之间存在相关性,其中miR-1、miR-133和miR-206彼此呈正相关性,而miR-499和miR-375与部分miRNAs呈负相关性。3对翘嘴鳜肝脏组织内筛选出的23个与肝脏代谢或疾病相关miRNAs的昼夜节律表达进行了研究。其中niR-26a、miR-122、miR-16、miR-33a、miR-200b、miR-221、miR-155、 miR-181b、miR-10、miR-21、miR-99b、miR-192、miR-194和miR-146a具有明显的昼夜节律表达,这些miRNA之间部分存在正相关关系。
【学位授予单位】：湖南农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S917.4

【参考文献】

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本文编号：2795624