青蟹嗜睡病相关病毒的结构研究
发布时间：2020-09-04 10:36
病毒是通过寄生在活体细胞内进行生命活动的特殊微型生命体。有些病毒能够引起经济动物的重大疾病,造成严重的经济损失;有些病毒能够造成严重危害人类健康的疾病;而有些病毒的一些特殊分子机制,又能够成为分子生物学和医学的工具。因而对病毒结构的研究有助于理解病毒的生命活动,从而实现对有害病毒的防治、可促进相关病毒工具的应用等目的,具有重要意义。拟穴青蟹是我国东南沿海的一种重要经济动物,在我国已有多年养殖历史,但青蟹养殖长期受到病毒类疾病的威胁。研究表明两种青蟹病毒:青蟹呼肠孤病毒(mud crab reovirus,MCRV)和青蟹双顺反子病毒(mud crab dicistrovirus,MCDV)可导致蟹类的嗜睡病,造成拟穴青蟹大规模死亡,造成严重的经济损失。为了获得嗜睡病相关病毒的结构特征和相关致病机制等信息,为青蟹疾病防治提供一定的结构信息,本文借助冷冻电镜对嗜睡病蟹体内分离得到的70nm病毒颗粒和30nm病毒颗粒进行结构分析,对病毒的宿主结合位点、组装、转录、核酸释放等机制等进行了探究,并获得了以下结果:1.获得青蟹呼肠孤病毒(mud crab reovirus,MCRV)3.1A的二十面体结构和3.8A的D5对称结构,并构建了 MCRV的VP1、VP3、VP11、VP12四个结构蛋白的原子模型,发现MCRV的独特结构特征:内层衣壳VP3结合形成的十聚体间无相互作用;特有衣壳蛋白VP11对内外层衣壳稳定和组装有重要作用;衣壳内TEC仅包含RdRp单个蛋白,并呈独特的D5对称方式排列;RdRp的N端结构域具有独特的突起。这些结构特征表明MCRV具有独特的衣壳组装和基因组转录机制。2.获得了青蟹双顺反子病毒(mudcrab dicistrovirus,MCDV)3.5A的三维结构,构建MCDV的VP1、VP2、VP3和VP4四个结构蛋白的原子模型,发现了 MCDV在双顺反子病毒中特有的突起结构,且覆盖MCDV表面的指状突起,可能具有识别宿主的功能;对MCDV的核酸释放机制研究表明VP1和VP2的N端、VP4和VP3的C端突起与核酸释放过程相关。3.通过冷冻电镜单颗粒技术发现了一种新病毒,并获得其3.3A的三维结构,借助结构分析获得了其正确序列。根据结构和序列分析,暂命名为蟹番茄矮缩病毒样病毒(MCTV),并发现MCTV的结构特征与Betanodavirus相似,具有类似的组装机制;MCTV的基因组结构同Tombusviridae类似,但衣壳蛋白与两种Nodaviridae的病毒高度同源,说明其基因组可能具有不同的进化来源。
【学位单位】：中山大学
【学位级别】：博士
【学位年份】：2019
【中图分类】：S945
【部分图文】：
图 1-1 中央截面定理和三维重构原理[10]ntral slice theorem and the principle of 3D-re在空间的取向则可以通过等价线[11]原投影的傅立叶变换必然存在一条等价性可以确定投影的取向。递函数2]是解析电镜二维投影图像高分辨信息解为物体空间密度经过电镜的透镜系为衬度传递函数（ContrastTransferFu，像的高分辨信息的相位发生一定的变
图 1-3 原始图像与漂移校正后的图像的频谱图[20]Fig.1-3 FFT of raw images and drift-corrected images[20](a&d)校正前图像的频谱（b&e）图像每帧的位移量（c&f）校正后图像的频谱&d）The power spectrum before drift correction.(b&e) Drift of frames. (c&f) Power spectrum beforerection.由于样品在电子束照射下所产生的热效应、样品台稳定性等因素，样品在过程中会有一定的漂移。采用一般的成像方式，在漂移比较严重的情况下收据时，图像信号将受到严重损失。这一问题在具备高输出帧率的相机出现后程度上得到了解决。使用高输出帧率的相机可以以录像的形式收集数据。通算所得原始数据中每一帧之间的相关系数峰值，可以获得样品的位移量，从过对校正后的信息叠加获得清晰的图像[20]。目前已有成熟的软件，通过 G算可以快速获得漂移校正后的图像（图 1-3），如 Motioncor2[21]。在进行更
K2与US4000的DQE对比
本文编号：2812224
【学位单位】：中山大学
【学位级别】：博士
【学位年份】：2019
【中图分类】：S945
【部分图文】：
图 1-1 中央截面定理和三维重构原理[10]ntral slice theorem and the principle of 3D-re在空间的取向则可以通过等价线[11]原投影的傅立叶变换必然存在一条等价性可以确定投影的取向。递函数2]是解析电镜二维投影图像高分辨信息解为物体空间密度经过电镜的透镜系为衬度传递函数（ContrastTransferFu，像的高分辨信息的相位发生一定的变
图 1-3 原始图像与漂移校正后的图像的频谱图[20]Fig.1-3 FFT of raw images and drift-corrected images[20](a&d)校正前图像的频谱（b&e）图像每帧的位移量（c&f）校正后图像的频谱&d）The power spectrum before drift correction.(b&e) Drift of frames. (c&f) Power spectrum beforerection.由于样品在电子束照射下所产生的热效应、样品台稳定性等因素，样品在过程中会有一定的漂移。采用一般的成像方式，在漂移比较严重的情况下收据时，图像信号将受到严重损失。这一问题在具备高输出帧率的相机出现后程度上得到了解决。使用高输出帧率的相机可以以录像的形式收集数据。通算所得原始数据中每一帧之间的相关系数峰值，可以获得样品的位移量，从过对校正后的信息叠加获得清晰的图像[20]。目前已有成熟的软件，通过 G算可以快速获得漂移校正后的图像（图 1-3），如 Motioncor2[21]。在进行更
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【参考文献】
相关硕士学位论文 前2条
1 高远瞩;青蟹双顺反子病毒（MCDV）的三维结构研究[D];中山大学;2016年
2 王璞;青蟹呼肠孤病毒（MCRV）的冷冻电镜三维结构研究[D];中山大学;2014年
本文编号：2812224
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/2812224.html
