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WSSV-CN04的基因组测定与感染性分析

发布时间:2020-12-21 13:08
  对虾白斑综合症病毒(White spot syndrome virus,WSSV)是严重阻碍对虾养殖业健康发展的主要病害之一,能够导致养殖的对虾大规模死亡。在本研究中,我们从自然感染的日本囊对虾中分离出了一株新的WSSV,命名为WSSV-CN04。全基因组测序表明WSSV-CN04的基因组长度为281,054 bp,编码157种蛋白。序列比对表明WSSV-CN04的基因组序列与低毒株WSSV-CN03密切相关,具有97.5%的同源性。值得注意的是,WSSV-CN04的主要囊膜蛋白VP24不仅C-末端有片段缺失,而且在病毒粒子中也检测不到。由于VP24之前被报道是一种几丁质结合蛋白,通过介导WSSV-几丁质相互作用对WSSV经口腔途径的感染有着至关重要的作用。因此本研究我们进一步分析了WSSV-CN03和WSSV-CN04通过口腔途径感染凡纳滨对虾的情况。结果表明:由于WSSV-CN04的VP24基因部分缺失,导致剩余部分无法定位到病毒粒子的囊膜上。缺失VP24的病毒粒子减弱了与消化道中几丁质组分的结合能力,更容易被排出消化道,造成病毒粒子在消化道的滞留时间减少,降低了病毒粒子穿过消化道... 

【文章来源】:自然资源部第三海洋研究所福建省

【文章页数】:76 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

WSSV-CN04的基因组测定与感染性分析


WSSV形态结构示意图

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预测编码 157 种蛋白(图5-1)。表 5-1 中我们统计总结了目前已经测序的八株 WSSV 分离株的基本信息。图 5-1:WSSV-CN04 中国大陆株的基因组结构示意图同时我们用 Geneious 软件的双序列比对功能分析了 WSSV-CN04 与其它 7个 WSSV 分离株的基因组序列同源性。分析结果表明 WSSV-CN04 与WSSV-CN03 具有最高同源性(97.5%),而与高毒株 WSSV-CN01 的差异最大(90.4%)。其中 WSSV-CN03 分离于自然感染的凡纳滨对虾,2010 年发现于福

基因组序列,基因组,图形结果,同源区


图 5-2:WSSV-CN03 和 WSSV-CN04 基因组的比较分析(A) WSSV-CN03 和 WSSV -CN04 的全基因组比对的图形结果。 WSSV-CN03 和WSSV -CN04 的基因组序列用 MAUVE 的“对比整个基因组”功能进行对比。 同源区段显

【参考文献】:
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本文编号:2929879

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