弓背青鳉线粒体DNA遗传多样性分析
发布时间：2020-12-22 08:52
弓背青鳉（Oryzias curvinotus）隶属怪頜鳉科（Adrianichthyidae）,青鳉属（Oryzias）,是一种广盐性、广温性、产卵量大、世代周期短及易于在实验室饲养的小型鱼类。弓背青鳉（O.curvinotus）是南方沿海分布的土著鱼类,与同属中研究最为清晰的日本青鳉（Oryzias latipes）亲缘关系密切,且都具有XX-XY性别控制系统,具有极好的理论研究价值。对弓背青鳉（O.curvinotus）生态学调查及其线粒体DNA遗传多样性分析,丰富了其生物学背景研究,为发展弓背青鳉（O.curvinotus）为模式生物的研究提供支撑。具体研究结果主要包括五部分:1.弓背青鳉（O.curvinotus）的生态学调查水的理化指标:盐度范围为0.14-33.57;水温范围为9.58-40.9℃;p H值范围为7.2-9.38;溶解氧的范围为2.11-17.12 ppm。弓背青鳉（O.curvinotus）栖息生境特征是:生活在水流平缓并有植物的水域中,一旦食蚊鱼（Gambusia affinis）发展成为优势种,弓背青鳉（O.curvinotus）的数量将大大减少。2...
【文章来源】：广东海洋大学广东省
【文章页数】：75 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 分类与形态
1.2 生物学特性
1.3 国内外对弓背青鳉研究现状
1.4 鱼类线粒体基因组研究意义
1.5 研究目的和意义
2 弓背青鳉的生态学调查
2.1 材料与方法
2.1.1 调查点的设立
2.1.2 采样及测量方法
2.1.3 室内繁养
2.2 结果
2.2.1 水的物化指标
2.2.2 栖息生境
2.2.3 室内繁养
2.3 讨论
3 盐度对弓背青鳉受精卵孵化的影响
3.1 材料与方法
3.1.1 材料来源
3.1.2 盐度梯度设置
3.2 结果
3.3 讨论
4 弓背青鳉遗传性别鉴定
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验试剂与仪器
4.1.3 引物合成
4.1.4 基因组DNA的提取
4.1.5 克隆测序
4.1.6 琼脂糖凝胶电泳
4.2 结果
4.2.1 性别标记引物克隆与分析
4.2.2 弓背青鳉遗传性别的判定
4.2.3 弓背青鳉自然遗传性比
4.3 讨论
5 弓背青鳉线粒体基因组全序列测定与系统进化分析
5.1 材料与方法
5.1.1 材料
5.1.2 试剂、仪器和设备
5.1.3 实验方法
5.2 结果与分析
5.2.1 弓背青鳉线粒体基因组组成与排列
5.2.2 碱基组成
5.2.3 蛋白质编码基因
5.2.4 转运RNA（tRNA）基因和核糖体RNA（rRNA）基因
5.2.5 非编码区
5.2.6 以mtDNA基因组为基础的分子系统进化树的构建
5.3 讨论
6 基于COⅠ基因与D-loop区的南方沿海弓背青鳉遗传多样性分析
6.1 材料与方法
6.1.1 材料
6.1.2 试剂、仪器和设备
6.1.3 实验方法
6.2 结果
6.2.1 基于mtDNACOⅠ基因的结果分析
6.2.2 基于mtDNAD-loop区的结果分析
6.2.3 核苷酸代替速率
6.3 讨论
6.3.1 碱基组成
6.3.2 遗传变异分析
6.3.3 根据COⅠ基因与D-loop区序列检测群体遗传多样性的结果比较
6.3.4 遗传多样性分析
6.3.5 遗传分化分析
6.3.6 群体动态历史
6.4 结语
7 结论
参考文献
致谢
作者简介
导师简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]长江中下游湖泊短颌鲚线粒体控制区遗传多样性分析[J]. 王旭歌,何勇凤,吴兴兵,杨德国. 动物学杂志. 2018(01)
[2]广东淡水鱼类弓背青鳉分类形态性状再描述[J]. 张方方,姜昊辰,金锦锦,仇玉萍,陈国柱. 四川动物. 2017(05)
[3]基于COI基因和D-loop区部分序列比较雷州半岛东、西岸湖栖鳍虾虎鱼群体的遗传多样性[J]. 廖健,龙水生,贺亮,郭昱嵩,刘楚吾,刘丽,王中铎. 海洋科学. 2017(02)
[4]基于DNA条形码探讨红树林区背眼虾虎鱼亚科鱼类的分子系统学[J]. 张顺,黄承勤,廖健,郭昱嵩,刘楚吾,王中铎. 基因组学与应用生物学. 2017(08)
[5]基于线粒体DNA D-loop的都柳江鲇形目两种经济鱼类种群遗传多样性研究[J]. 刘伟,代应贵,袁振兴,孙际佳,刘丽. 水产科学. 2016(04)
[6]COⅠ条形码辅助分析雷州半岛红树林区鱼类的物种多样性[J]. 张顺,廖健,柏琴,陈冲,郭昱嵩,刘楚吾,王中铎. 海洋与湖沼. 2016(03)
[7]5种虾虎鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化[J]. 廖健,张顺,龙水生,黄承勤,郭昱嵩,王中铎,刘楚吾. 广东海洋大学学报. 2016(01)
[8]海水模式种青鳉鱼(Oryzias melastigma)的胚胎发育观察[J]. 陈漪,王晓杰,冉皓宇,林昱. 海洋与湖沼. 2016(01)
[9]不同水系银鲴自然群体线粒体COI基因遗传变异研究[J]. 刘军,赵良杰,刘其根,张宏. 淡水渔业. 2015(06)
[10]基于线粒体COI序列的中国沿海蓝点马鲛遗传多样性[J]. 曹艳,章群,宫亚运,吕金磊,杨喜书. 海洋渔业. 2015(06)
硕士论文
[1]基于线粒体控制区和细胞色素B基因的江豚种群遗传多样性和遗传结构分析[D]. 程亚欣.上海海洋大学 2016
[2]基于FVCOM的琼州海峡潮汐潮流数值模拟与研究[D]. 郑淑贤.中国海洋大学 2015
[3]基于mtDNA Cyt b基因和D-loop区的祁连山裸鲤遗传多样性及分类地位分析[D]. 张久盘.甘肃农业大学 2015
[4]青鳉性腺发育的组织学观察和DMY、Dmrt1基因的表达分析[D]. 张静.上海海洋大学 2013
[5]黄河流域大鳞副泥鳅遗传多样性分析[D]. 赵旭.河南师范大学 2012
[6]青鳉的生态学调查及其在不同盐度下的繁殖生物学研究[D]. 李志国.河北农业大学 2010
[7]中国野生香鱼（Plecoglossus altivelis）遗传多样性分析[D]. 乐小亮.暨南大学 2010
[8]中国东部6个大型湖泊翘嘴鲌(Culter alburnus)遗传多样性的线粒体ND2基因序列分析[D]. 伊西庆.暨南大学 2009
[9]隆额网翅蝗线粒体基因组全序列的测定与分析[D]. 刘念.陕西师范大学 2006
本文编号：2931486
【文章来源】：广东海洋大学广东省
【文章页数】：75 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 分类与形态
1.2 生物学特性
1.3 国内外对弓背青鳉研究现状
1.4 鱼类线粒体基因组研究意义
1.5 研究目的和意义
2 弓背青鳉的生态学调查
2.1 材料与方法
2.1.1 调查点的设立
2.1.2 采样及测量方法
2.1.3 室内繁养
2.2 结果
2.2.1 水的物化指标
2.2.2 栖息生境
2.2.3 室内繁养
2.3 讨论
3 盐度对弓背青鳉受精卵孵化的影响
3.1 材料与方法
3.1.1 材料来源
3.1.2 盐度梯度设置
3.2 结果
3.3 讨论
4 弓背青鳉遗传性别鉴定
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验试剂与仪器
4.1.3 引物合成
4.1.4 基因组DNA的提取
4.1.5 克隆测序
4.1.6 琼脂糖凝胶电泳
4.2 结果
4.2.1 性别标记引物克隆与分析
4.2.2 弓背青鳉遗传性别的判定
4.2.3 弓背青鳉自然遗传性比
4.3 讨论
5 弓背青鳉线粒体基因组全序列测定与系统进化分析
5.1 材料与方法
5.1.1 材料
5.1.2 试剂、仪器和设备
5.1.3 实验方法
5.2 结果与分析
5.2.1 弓背青鳉线粒体基因组组成与排列
5.2.2 碱基组成
5.2.3 蛋白质编码基因
5.2.4 转运RNA（tRNA）基因和核糖体RNA（rRNA）基因
5.2.5 非编码区
5.2.6 以mtDNA基因组为基础的分子系统进化树的构建
5.3 讨论
6 基于COⅠ基因与D-loop区的南方沿海弓背青鳉遗传多样性分析
6.1 材料与方法
6.1.1 材料
6.1.2 试剂、仪器和设备
6.1.3 实验方法
6.2 结果
6.2.1 基于mtDNACOⅠ基因的结果分析
6.2.2 基于mtDNAD-loop区的结果分析
6.2.3 核苷酸代替速率
6.3 讨论
6.3.1 碱基组成
6.3.2 遗传变异分析
6.3.3 根据COⅠ基因与D-loop区序列检测群体遗传多样性的结果比较
6.3.4 遗传多样性分析
6.3.5 遗传分化分析
6.3.6 群体动态历史
6.4 结语
7 结论
参考文献
致谢
作者简介
导师简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]长江中下游湖泊短颌鲚线粒体控制区遗传多样性分析[J]. 王旭歌,何勇凤,吴兴兵,杨德国. 动物学杂志. 2018(01)
[2]广东淡水鱼类弓背青鳉分类形态性状再描述[J]. 张方方,姜昊辰,金锦锦,仇玉萍,陈国柱. 四川动物. 2017(05)
[3]基于COI基因和D-loop区部分序列比较雷州半岛东、西岸湖栖鳍虾虎鱼群体的遗传多样性[J]. 廖健,龙水生,贺亮,郭昱嵩,刘楚吾,刘丽,王中铎. 海洋科学. 2017(02)
[4]基于DNA条形码探讨红树林区背眼虾虎鱼亚科鱼类的分子系统学[J]. 张顺,黄承勤,廖健,郭昱嵩,刘楚吾,王中铎. 基因组学与应用生物学. 2017(08)
[5]基于线粒体DNA D-loop的都柳江鲇形目两种经济鱼类种群遗传多样性研究[J]. 刘伟,代应贵,袁振兴,孙际佳,刘丽. 水产科学. 2016(04)
[6]COⅠ条形码辅助分析雷州半岛红树林区鱼类的物种多样性[J]. 张顺,廖健,柏琴,陈冲,郭昱嵩,刘楚吾,王中铎. 海洋与湖沼. 2016(03)
[7]5种虾虎鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化[J]. 廖健,张顺,龙水生,黄承勤,郭昱嵩,王中铎,刘楚吾. 广东海洋大学学报. 2016(01)
[8]海水模式种青鳉鱼(Oryzias melastigma)的胚胎发育观察[J]. 陈漪,王晓杰,冉皓宇,林昱. 海洋与湖沼. 2016(01)
[9]不同水系银鲴自然群体线粒体COI基因遗传变异研究[J]. 刘军,赵良杰,刘其根,张宏. 淡水渔业. 2015(06)
[10]基于线粒体COI序列的中国沿海蓝点马鲛遗传多样性[J]. 曹艳,章群,宫亚运,吕金磊,杨喜书. 海洋渔业. 2015(06)
硕士论文
[1]基于线粒体控制区和细胞色素B基因的江豚种群遗传多样性和遗传结构分析[D]. 程亚欣.上海海洋大学 2016
[2]基于FVCOM的琼州海峡潮汐潮流数值模拟与研究[D]. 郑淑贤.中国海洋大学 2015
[3]基于mtDNA Cyt b基因和D-loop区的祁连山裸鲤遗传多样性及分类地位分析[D]. 张久盘.甘肃农业大学 2015
[4]青鳉性腺发育的组织学观察和DMY、Dmrt1基因的表达分析[D]. 张静.上海海洋大学 2013
[5]黄河流域大鳞副泥鳅遗传多样性分析[D]. 赵旭.河南师范大学 2012
[6]青鳉的生态学调查及其在不同盐度下的繁殖生物学研究[D]. 李志国.河北农业大学 2010
[7]中国野生香鱼（Plecoglossus altivelis）遗传多样性分析[D]. 乐小亮.暨南大学 2010
[8]中国东部6个大型湖泊翘嘴鲌(Culter alburnus)遗传多样性的线粒体ND2基因序列分析[D]. 伊西庆.暨南大学 2009
[9]隆额网翅蝗线粒体基因组全序列的测定与分析[D]. 刘念.陕西师范大学 2006
本文编号：2931486
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