中国沿海地区副溶血弧菌流行病学调查及遗传多样性分析
发布时间：2020-12-29 05:53
副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是引起人类食源性疾病和水产养殖中南美白对虾急性肝胰腺坏死病(AHPND,又被称为早期死亡综合征)的条件性致病菌,是食源性肠胃炎最主要的病原之一,为人类和水产养殖带来了巨大的灾难和损失。本研究首先建立了基于PCR快速检测副溶血弧菌的方法。由于弧菌属尤其是哈维氏弧菌群的基因组具有很高的相似度,16S rDNA无法将之区分,因此对于副溶血弧菌检测的核心就是找到有效的靶标。而对于目前报道的副溶血弧菌鉴定和筛选的靶标基因一直没有一个有效的特异性评估,因此存在特异性不高的问题。为了避免假阳性,本研究通过生物信息分析找到了3个分布在两个染色体上的靶序列,对比之前报道的特异性基因,这3个靶序列同时具备种间特异性和种内保守性的特点。为了探究水产养殖中副溶血弧菌的毒力、耐药和遗传多样性等特点,本研究分别在天津(2016年6月、9月和2017年4月)、南通(2016年9月)、杭州(2016年9月)、湛江(2016年11月)和海南地区(2016年8月)进行了样品的采集,然后利用TCBS和LB培养基共分离纯化了1045株细菌。基于本研究建立的检测方法,...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
副溶血弧菌的结构和毒力基因(Wangetal.2015a)
可以通过转化、接合或者转导在细菌间转移。1.5.2 插入序列插入序列（Insertion Sequence，IS）的基本结构如图1-2，在两端有正向重复序列（directrepeats，DR）和反向重复序列(inverted repeats, IR)，中间通常是一个或者两个编码转座酶的基因。通常 IS 是不携带毒力和耐药基因的，但是两种特殊的类型的 IS，ISEcp1 和ISCR 以及形成的复合型转座子是能够捕获和转移毒力和耐药基因的(Partridge 2011)。近几年，随着进化基因组学的研究，发现 IS 对于基因组的可塑性和多样性具有重要功能。以前的研究表明，IS 就像基因组寄生虫一样(Charlesworth 1994)可以通过塑造细菌基因组来促进遗传多样性的产生
图 1-3 基因岛的基本结构示意图 (Dobrindt et al. 2004)Figure 1-3 General characteristics of genomic islands (Dobrindt et al. 2004)
本文编号：2945136
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
副溶血弧菌的结构和毒力基因(Wangetal.2015a)
可以通过转化、接合或者转导在细菌间转移。1.5.2 插入序列插入序列（Insertion Sequence，IS）的基本结构如图1-2，在两端有正向重复序列（directrepeats，DR）和反向重复序列(inverted repeats, IR)，中间通常是一个或者两个编码转座酶的基因。通常 IS 是不携带毒力和耐药基因的，但是两种特殊的类型的 IS，ISEcp1 和ISCR 以及形成的复合型转座子是能够捕获和转移毒力和耐药基因的(Partridge 2011)。近几年，随着进化基因组学的研究，发现 IS 对于基因组的可塑性和多样性具有重要功能。以前的研究表明，IS 就像基因组寄生虫一样(Charlesworth 1994)可以通过塑造细菌基因组来促进遗传多样性的产生
图 1-3 基因岛的基本结构示意图 (Dobrindt et al. 2004)Figure 1-3 General characteristics of genomic islands (Dobrindt et al. 2004)
本文编号：2945136
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/2945136.html
