转录水平分析Notch1a参与副溶血弧菌感染斑马鱼幼鱼引起的天然免疫应答

发布时间：2021-01-05 21:49

　　斑马鱼（Danio rerio）作为重要的模式生物之一,在研究天然免疫应答方面具有独特的优势,受精后的3-4周内只具有天然免疫,不具有获得性免疫。Notch信号通路在斑马鱼胚胎的发育过程中具有重要的作用,有研究发现,Notch信号通路在获得性免疫应答中同样行使功能。然而,关于Notch信号通路在天然免疫应答过程的调控机制仍不明了。副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus）是一种人兽共患的主要病原之一,既可以感染水生动物,又可以感染人类,造成的后果严重,但是关于其具体的致病机制还有待深入研究。本文用副溶血弧菌感染3 dpf（days post fertilization）的斑马鱼幼鱼2h,通过转录组测序分析转录水平差异表达基因的类型,初步研究了Notch1a信号通路在天然免疫应答中的作用机制。首先通过比较浸泡感染与尾静脉注射感染两种感染方式下野生型斑马鱼的转录组数据,发现浸泡感染差异表达的基因为602个,其中427个基因下调,175个基因上调,已报道的参与天然免疫的基因15个,分别为il11a、ccl34、tnfb、ccl20a、cxcr4a、cxcl3、fosl1a、... 

【文章来源】：上海海洋大学上海市

【文章页数】：72 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

Vp13的毒力基因的检测Fig2.1DetectionofvirulencerelatedgenesofVp132%的琼脂糖凝胶电泳检测，DNAmaker为50-500bp

图 2.2 A/T/G/C 碱基含量分布统计图Fig 2.2 The statistics ofA/T/G/C bases注：横坐标碱基在所检测序列中的位置；纵坐标是碱基占比。质量分布

图 2.3 碱基质量分布统计图Fig 2.3 The statistics of quality of bases是碱基在所检测序列中的位置；纵坐标是reads的碱基质量值（Q值， 15=Lowest），如果某碱基质量值为30（Q30），则表示该碱基测序出0.001（10-3）。

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本文编号：2959357