刺参（Apostichopus japonicus）重要经济性状相关QTL位点的验证分析

发布时间：2021-01-14 07:42

　　刺参属于棘皮动物门（Echinodermata）、海参纲（Holothuroidea）,是我国北方重要的海珍品之一。近年来,我国刺参养殖得以长足发展,规模拓展迅猛,直接经济产值约300亿元,是我国海水养殖产业中单一产值最大的物种,为沿海渔业经济结构的调整和渔民就业及增产增收提供了重要途径。随着刺参产业规模的逐渐扩大,种质退化、生长缓慢、养殖周期长、抵御环境变化能力差、病害频发等一系列制约或潜在制约产业发展的瓶颈问题也日益凸显,分子标记辅助育种是解决上述问题的有效手段。随着分子技术的发展,构建遗传连锁图谱,利用与目标性状紧密连锁的分子标记对性状的遗传改良是当今水产动物遗传育种的研究热点。但由于小样本作图QTL区间过大和易受环境影响的原因,导致QTL的检测和对QTL效应评估发生偏离,因此对QTL进行验证是实施MAS的前提。本研究在前期构建的刺参高密度遗传连锁图谱的基础上筛选重要性状相关的QTL位点并进行验证和生产性应用实践,利用SSR对刺参进行亲子鉴定分析,以期为刺参分子标记辅助育种提供基础数据。本文研究结果如下:1.刺参重要经济性状相关SNP标记的筛选实验室前期构建了刺参高密度遗传连锁图... 

【文章来源】：上海海洋大学上海市

【文章页数】：78 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

QTL定位分析统计

刺参体长、体宽、体重、棘刺总数性状相关QTL在连锁图谱上的分布

图 2-3 刺参抗病力相关 QTL 在连锁图谱上的分布Fig.2-3 QTL in locus group associated with disease resistance参重要性状相关 SNP 位点筛选结果用 Samtools 软件上述获得的 81 个 SLAF 标签序列进行多态性分析， 841 个 SNP 位点。采用 SPSS20.0 软件中的 GLM 模型对这些 SNP 位子代的 5 个性状的测定数据进行相关性分析，筛选到 189 个与性状相点。根据测序结果进行 SNP 基因分型数据统计，对相应位点的 SNP状数据进行；对相应 SNP 位点在子代中的基因型分类统计后与表型关性分析，筛选可获得性状相关的优势基因型的 SNP 位点 79 个。型进行引物设计是需要SNP变异位点两侧有足够的侧翼序列，根据H法分型的条件和测序结果挑选在不同基因型之间在关联性状差异显著序列大于 200bp、无不确定碱基并且突变频率>1%的 SNP 位点，最终件的可用于后续 SNP 位点分型验证的位点共 26 个。


本文编号：2976509