缢蛏发育转录组文库及类胰岛素相关多肽基因功能的初步研究

发布时间：2021-01-21 07:13

　　缢蛏（Sinonovacula constricta）作为我国四大养殖贝类之一,在水产养殖中占据了重要的经济地位。对缢蛏生长相关基因进行研究,有助于缢蛏的良种选育,是提高缢蛏养殖经济效益的重要途径。类胰岛素相关多肽是类胰岛素超家族的重要成员之一,在生物体生长发育及代谢调控中发挥了重要作用。本研究建立了缢蛏发育转录组文库,同时获得了三个类胰岛素相关多肽（insulin-like peptide,ILP）基因。分析了ILPs基因的时空表达特征,初步探讨了其在生长发育过程中的生物学功能。1.缢蛏发育转录组特征分析,基因注释及变态相关基因分析采用新一代Illumina HiSeq 2000高通量测序技术,首次构建了缢蛏发育转录组文库,包括卵裂期、担轮幼虫期、D型期、壳顶幼虫期、匍匐期和稚贝期,共拼接得到了249795个短片段。长度在201bp到36941bp之间,平均为585bp。其中最长的注释基因是Nesprin-1（11087个氨基酸）。经过对比,在NCBI Nr、COG、Swiss-Prot和KEGG四个程序中分别注释了21920（8.78%）、8837（3.54%）、14036（5.6... 

【文章来源】：上海海洋大学上海市

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

缢蛏发育转录组基因片段组装长度分布图

表 2-2：缢蛏发育转录组拼接基因片段 BLAST 结果Table2-2: BLAST analysis of non-redundant unigenes against public databases.Database Number of annotated unigenes Percentage of annotated unigenesNrCOGSwiss-ProtKEGG21,9208,83714,03615,97895.85%38.64%61.37%69.86%

12图 2-3：缢蛏八个变态相关基因发育时期表达分布图-3: Comparison of expression values of eight genes in different developmental stagecta. (E: embryos, T: trochophores, V: veliger larvae, U: umbo larvae, C: creeping larvjuveniles) by RNA-Seq and real-time RT-PCR analyses.

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]哲罗鲑胰岛素样生长因子Ⅱ原核表达、多克隆抗体的制备及组织表达分析[D]. 吴秀梅.上海海洋大学 2015
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本文编号：2990722