海南后水湾深水网箱养殖区微生物多样性及其养殖卵形鲳鲹“烂身
发布时间：2021-01-31 07:34
卵形鲳鲹（Trachinotus ovatus）是海南省深水网箱养殖的主要品种,细菌性疾病是海南深水网箱养殖的主要疾病,对深水网箱养殖卵形鲳鰺造成了严重危害。本文利用基于宏基因组学16SrRNA基因测序的方法研究分析了海南临高后水湾深水网箱养殖区的微生物群落组成及动态变化;并对该养殖区卵形鲳鰺主要疾病“烂身病”进行了病原分离鉴定和药敏分析等研究;利用第三代测序对该致病菌株进行了基因组测序,并通过比较基因组分析了其相关毒力基因;同时,通过筛选特异性基因,建立了一种该病原的快速检测新方法。主要研究结果如下:（1）利用基于宏基因组学16SrRNA基因测序的方法研究分析了海南临高后水湾水体和患病鱼类样品微生物群落组成,结果显示该区域微生物比较丰富,菌落多样性水平较高,ACE和Chao1丰富度指数平均值分别为1517和1287,Shannon指数和Simpson指数平均值分别为3.78和0.08。（2）于2016年3月、5月、7月份、9月和11月分别对后水湾深水网箱养殖区的养殖网箱内外及非养殖区（对照区）微生物群落结构特征分析,结果表明,虽然调查区域在不同月份的微生物群落丰富度和多样性差异较大,...
【文章来源】：海南大学海南省 211工程院校
【文章页数】：130 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
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【参考文献】：
期刊论文
[1]卵形鲳鲹刺激隐核虫病组织病理学研究[J]. 陈福艳,梁万文,陈明,黄婷,李莉萍,雷爱莹,王瑞,杨学明,罗洪林,欧阳贤华. 渔业研究. 2017(03)
[2]环介导等温扩增联合横向流动试纸条可视化检测哈维氏弧菌的研究[J]. 程蝶,柴方超,蔡怡,周前进,陈炯. 生物技术通报. 2016(06)
[3]卵形鲳鲹主要致病链球菌多重PCR诊断技术的建立[J]. 熊向英,蔡小辉,彭银辉,黄国强,梁志辉,王志成. 广西科学. 2016(01)
[4]应用高通量测序技术分析北方刺参养殖池塘环境菌群结构[J]. 窦妍,赵晓伟,丁君,何鹏. 海洋与湖沼. 2016(01)
[5]网箱养殖卵形鲳鲹鱼体寄生虫初步调查[J]. 熊向英,徐力文,董兰芳,王志成,梁志辉,蒋伟添,黄国强. 广西科学院学报. 2015(04)
[6]新一代测序技术的发展和应用[J]. 田李,张颖,赵云峰. 生物技术通报. 2015(11)
[7]PacBio Sequencing and Its Applications[J]. Anthony Rhoads,Kin Fai Au. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(05)
[8]Nanopore-based Fourth-generation DNA Sequencing Technology[J]. Yanxiao Feng,Yuechuan Zhang,Cuifeng Ying,Deqiang Wang,Chunlei Du. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(01)
[9]单分子实时测序技术的原理与应用[J]. 柳延虎,王璐,于黎. 遗传. 2015(03)
[10]南海南部海域浮游细菌群落特征及影响因素研究[J]. 白洁,刘小沙,侯瑞,赵阳国,高会旺. 中国环境科学. 2014(11)
博士论文
[1]我国黄、东海典型生态过程中的微生物群落结构[D]. 刘敏.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2011
硕士论文
[1]广东海水网箱养殖鱼类细菌和寄生虫病原的分离、鉴定及流行病学调查[D]. 石章锁.西南大学 2008
本文编号：3010456
【文章来源】：海南大学海南省 211工程院校
【文章页数】：130 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２．１水样（Ａ）和患病鱼类组织样品（Ｂ）细菌丰富度稀疏曲线分析图??Ｆｉｇｕｒｅ?２．１?Ｒｉｃｈｎｅｓｓ?ｒａｒｅｆｒａｃｔｉｏｎ?ｐｌｏｔ??
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【参考文献】：
期刊论文
[1]卵形鲳鲹刺激隐核虫病组织病理学研究[J]. 陈福艳,梁万文,陈明,黄婷,李莉萍,雷爱莹,王瑞,杨学明,罗洪林,欧阳贤华. 渔业研究. 2017(03)
[2]环介导等温扩增联合横向流动试纸条可视化检测哈维氏弧菌的研究[J]. 程蝶,柴方超,蔡怡,周前进,陈炯. 生物技术通报. 2016(06)
[3]卵形鲳鲹主要致病链球菌多重PCR诊断技术的建立[J]. 熊向英,蔡小辉,彭银辉,黄国强,梁志辉,王志成. 广西科学. 2016(01)
[4]应用高通量测序技术分析北方刺参养殖池塘环境菌群结构[J]. 窦妍,赵晓伟,丁君,何鹏. 海洋与湖沼. 2016(01)
[5]网箱养殖卵形鲳鲹鱼体寄生虫初步调查[J]. 熊向英,徐力文,董兰芳,王志成,梁志辉,蒋伟添,黄国强. 广西科学院学报. 2015(04)
[6]新一代测序技术的发展和应用[J]. 田李,张颖,赵云峰. 生物技术通报. 2015(11)
[7]PacBio Sequencing and Its Applications[J]. Anthony Rhoads,Kin Fai Au. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(05)
[8]Nanopore-based Fourth-generation DNA Sequencing Technology[J]. Yanxiao Feng,Yuechuan Zhang,Cuifeng Ying,Deqiang Wang,Chunlei Du. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(01)
[9]单分子实时测序技术的原理与应用[J]. 柳延虎,王璐,于黎. 遗传. 2015(03)
[10]南海南部海域浮游细菌群落特征及影响因素研究[J]. 白洁,刘小沙,侯瑞,赵阳国,高会旺. 中国环境科学. 2014(11)
博士论文
[1]我国黄、东海典型生态过程中的微生物群落结构[D]. 刘敏.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2011
硕士论文
[1]广东海水网箱养殖鱼类细菌和寄生虫病原的分离、鉴定及流行病学调查[D]. 石章锁.西南大学 2008
本文编号：3010456
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